More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3440 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E3440  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  100 
 
 		 275 aa  565  1e-160  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3190  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  99.64 
 
 		 275 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02885  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  99.64 
 
 		 275 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0687  2,5-didehydrogluconate reductase  99.64 
 
 		 275 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3297  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  99.27 
 
 		 275 aa  560  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.292953 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3480  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  99.64 
 
 		 275 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02835  hypothetical protein  99.64 
 
 		 275 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0684  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  99.64 
 
 		 275 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4323  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  98.91 
 
 		 275 aa  558  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3515  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  92.36 
 
 		 275 aa  505  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.944641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3420  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  92.36 
 
 		 275 aa  505  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.355756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3414  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  92.36 
 
 		 275 aa  505  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3349  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  92.36 
 
 		 275 aa  505  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3423  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  87.64 
 
 		 275 aa  505  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3340  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  92 
 
 		 275 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0667  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  73.45 
 
 		 277 aa  424  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0586  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  74.44 
 
 		 275 aa  424  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0272  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  73.09 
 
 		 277 aa  424  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0336  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  73.53 
 
 		 275 aa  422  1e-117  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0343  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  72.06 
 
 		 275 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4216  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  73.88 
 
 		 274 aa  417  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.296306  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3766  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  70.22 
 
 		 281 aa  409  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.739123  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3604  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  66.79 
 
 		 281 aa  379  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0084  aldo/keto reductase  54.58 
 
 		 276 aa  308  9e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4225  oxidoreductase  54.58 
 
 		 276 aa  306  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1587  2,5-didehydrogluconate reductase  54.89 
 
 		 276 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0625741  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3013  2,5-didehydrogluconate reductase  51.45 
 
 		 276 aa  300  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.856221  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0968  aldo/keto reductase  54.15 
 
 		 274 aa  300  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7952  2,5-didehydrogluconate reductase  54.04 
 
 		 270 aa  298  6e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0183  aldo/keto reductase family oxidoreductase  50.72 
 
 		 275 aa  296  2e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0164  aldo/keto reductase family oxidoreductase  51.09 
 
 		 357 aa  293  1e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.432724  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3761  2,5-didehydrogluconate reductase  52.75 
 
 		 276 aa  292  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3534  2,5-didehydrogluconate reductase  51.85 
 
 		 272 aa  290  2e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  0.675115 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1395  2,5-didehydrogluconate reductase  50.9 
 
 		 281 aa  289  4e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.330402  decreased coverage  0.000466795 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2796  2,5-didehydrogluconate reductase  50.36 
 
 		 275 aa  287  1e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1721  2,5-didehydrogluconate reductase  49.46 
 
 		 276 aa  285  4e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.459314 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4977  2,5-didehydrogluconate reductase  50.55 
 
 		 294 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0861  aldo/keto reductase  51.3 
 
 		 274 aa  283  2.0000000000000002e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.274237  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4086  aldo/keto reductase  50.92 
 
 		 276 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.968066 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1500  putative oxidoreductase protein  51.1 
 
 		 276 aa  279  4e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.181777  normal  0.869656 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0519  2,5-didehydrogluconate reductase  50 
 
 		 275 aa  278  8e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00901409  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4230  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  48.55 
 
 		 275 aa  278  8e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2300  2,5-didehydrogluconate reductase  50.74 
 
 		 278 aa  278  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.109418 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1420  2,5-didehydrogluconate reductase  50.18 
 
 		 274 aa  277  1e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.917399  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2023  2,5-didehydrogluconate reductase  50.74 
 
 		 278 aa  277  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.760724 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4166  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.55 
 
 		 275 aa  276  3e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4006  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.19 
 
 		 275 aa  275  4e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000973326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4319  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.19 
 
 		 275 aa  275  4e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5462  aldo/keto reductase  50.55 
 
 		 276 aa  276  4e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4121  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  48.19 
 
 		 275 aa  275  4e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000119845 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4207  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  48.55 
 
 		 275 aa  275  5e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3853  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.13 
 
 		 312 aa  275  5e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230626  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3839  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.19 
 
 		 275 aa  275  7e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1030  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  48.91 
 
 		 275 aa  275  7e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4957  2,5-didehydrogluconate reductase  47.83 
 
 		 279 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3928  2,5-didehydrogluconate reductase  47.83 
 
 		 275 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0821638  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1769  2,5-didehydrogluconate reductase  46.24 
 
 		 281 aa  271  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.904108  normal  0.360608 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4697  2,5-didehydrogluconate reductase  45.88 
 
 		 282 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.973362  normal  0.111177 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0988  2,5-didehydrogluconate reductase  46.49 
 
 		 272 aa  269  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1615  2,5-didehydrogluconate reductase  46.32 
 
 		 272 aa  266  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.808798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1380  2,5-didehydrogluconate reductase  48.13 
 
 		 275 aa  267  2e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1985  2,5-didehydrogluconate reductase  50 
 
 		 278 aa  267  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0362  aldo/keto reductase family oxidoreductase  47.62 
 
 		 279 aa  266  2.9999999999999995e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2314  oxidoreductase, chromogranin/secretogranin  45.76 
 
 		 272 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1160  2,5-didehydrogluconate reductase  49.45 
 
 		 276 aa  265  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06660  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  49.08 
 
 		 277 aa  264  1e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1360  2,5-didehydrogluconate reductase  44.29 
 
 		 282 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.603872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1378  2,5-didehydrogluconate reductase  44.29 
 
 		 282 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0743  2,5-didehydrogluconate reductase  45.66 
 
 		 279 aa  262  4e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0727  2,5-didehydrogluconate reductase  45.66 
 
 		 279 aa  262  4e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1985  2,5-didehydrogluconate reductase  46.91 
 
 		 276 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.163279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1972  2,5-didehydrogluconate reductase  47.12 
 
 		 298 aa  261  6.999999999999999e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0685  2,5-didehydrogluconate reductase  48.15 
 
 		 281 aa  261  6.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.689254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0216  aldo/keto reductase family oxidoreductase  46.47 
 
 		 277 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0239  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  46.47 
 
 		 277 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0222  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  46.47 
 
 		 277 aa  260  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5104  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  46.47 
 
 		 277 aa  261  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0197  aldo/keto reductase family oxidoreductase  46.47 
 
 		 277 aa  260  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0184  aldo/keto reductase  46.47 
 
 		 277 aa  260  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0187  aldo/keto reductase  46.47 
 
 		 277 aa  260  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0196  aldo/keto reductase family oxidoreductase  46.47 
 
 		 277 aa  260  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0216  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  46.47 
 
 		 277 aa  260  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2161  2,5-didehydrogluconate reductase  47.83 
 
 		 279 aa  260  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4349  2,5-didehydrogluconate reductase  50 
 
 		 275 aa  259  4e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1919  2,5-didehydrogluconate reductase  46.3 
 
 		 276 aa  259  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.894727 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4205  2,5-didehydrogluconate reductase  46.38 
 
 		 279 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00820  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  49.46 
 
 		 276 aa  258  6e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0181  2,5-didehydrogluconate reductase  45.72 
 
 		 277 aa  258  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12986  oxidoreductase  47.23 
 
 		 282 aa  258  1e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1172  2,5-didehydrogluconate reductase  48.09 
 
 		 281 aa  258  1e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.586801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0835  aldo/keto reductase  48.54 
 
 		 281 aa  258  1e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.600409 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03850  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  48.04 
 
 		 282 aa  256  2e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1394  2,5-didehydrogluconate reductase  43.21 
 
 		 282 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2582  aldo/keto reductase  43.64 
 
 		 276 aa  255  7e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0247931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3547  2,5-didehydrogluconate reductase  46.18 
 
 		 278 aa  255  7e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.802476  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0196  2,5-didehydrogluconate reductase  46.27 
 
 		 277 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1501  2,5-didehydrogluconate reductase  47.51 
 
 		 274 aa  253  2.0000000000000002e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0487  aldo/keto reductase  46.38 
 
 		 277 aa  251  8.000000000000001e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2581  2,5-didehydrogluconate reductase  46.4 
 
 		 282 aa  251  8.000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30490  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  47.01 
 
 		 282 aa  251  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>