More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_02540 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_02540  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  100 
 
 
279 aa  567  1e-161  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.935575  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1913  2,5-didehydrogluconate reductase  70.18 
 
 
278 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.143661  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0265  aldo/keto reductase  62.18 
 
 
281 aa  359  2e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0491  aldo/keto reductase  60 
 
 
273 aa  342  5e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.333273 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15550  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  57.09 
 
 
282 aa  325  7e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00501077  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0084  aldo/keto reductase  57.82 
 
 
276 aa  323  2e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7952  2,5-didehydrogluconate reductase  60.15 
 
 
270 aa  322  5e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1540  aldo/keto reductase  55.31 
 
 
287 aa  310  1e-83  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.199224 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3534  2,5-didehydrogluconate reductase  54.31 
 
 
272 aa  304  9.000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  0.675115 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4086  aldo/keto reductase  52.9 
 
 
276 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.968066 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1587  2,5-didehydrogluconate reductase  54.01 
 
 
276 aa  301  1e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0625741  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0861  aldo/keto reductase  56.72 
 
 
274 aa  300  1e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.274237  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3761  2,5-didehydrogluconate reductase  52.17 
 
 
276 aa  299  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1395  2,5-didehydrogluconate reductase  53.9 
 
 
281 aa  297  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.330402  decreased coverage  0.000466795 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1985  2,5-didehydrogluconate reductase  54.04 
 
 
276 aa  297  1e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.163279  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1919  2,5-didehydrogluconate reductase  53.31 
 
 
276 aa  294  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.894727 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0968  aldo/keto reductase  54.65 
 
 
274 aa  291  1e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00820  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  51.82 
 
 
276 aa  289  3e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1002  aldo/keto diketogulonate reductase  50.54 
 
 
289 aa  288  7e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1721  2,5-didehydrogluconate reductase  52.4 
 
 
276 aa  288  9e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.459314 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4225  oxidoreductase  50 
 
 
276 aa  286  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3214  2,5-didehydrogluconate reductase  52.75 
 
 
280 aa  285  5e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00515928  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0519  2,5-didehydrogluconate reductase  50.9 
 
 
275 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00901409  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4349  2,5-didehydrogluconate reductase  57.72 
 
 
275 aa  284  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06660  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  51.99 
 
 
277 aa  283  3.0000000000000004e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1380  2,5-didehydrogluconate reductase  51.67 
 
 
275 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1160  2,5-didehydrogluconate reductase  52.26 
 
 
276 aa  280  2e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3013  2,5-didehydrogluconate reductase  49.26 
 
 
276 aa  277  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.856221  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03850  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  52.55 
 
 
282 aa  276  2e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1360  2,5-didehydrogluconate reductase  48.03 
 
 
282 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.603872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1378  2,5-didehydrogluconate reductase  48.03 
 
 
282 aa  274  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2796  2,5-didehydrogluconate reductase  49.44 
 
 
275 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0183  aldo/keto reductase family oxidoreductase  49.07 
 
 
275 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1989  aldo/keto reductase  48.08 
 
 
291 aa  273  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000065841 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4126  2,5-didehydrogluconate reductase  49.82 
 
 
294 aa  273  2.0000000000000002e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3547  2,5-didehydrogluconate reductase  49.26 
 
 
278 aa  273  3e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.802476  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2768  2,5-didehydrogluconate reductase  51.13 
 
 
278 aa  273  3e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1972  2,5-didehydrogluconate reductase  49.31 
 
 
298 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1420  2,5-didehydrogluconate reductase  51.65 
 
 
274 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.917399  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0262  2,5-didehydrogluconate reductase  49.26 
 
 
276 aa  271  8.000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0685  2,5-didehydrogluconate reductase  49.64 
 
 
281 aa  271  9e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.689254  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1769  2,5-didehydrogluconate reductase  49.82 
 
 
281 aa  271  9e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.904108  normal  0.360608 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4697  2,5-didehydrogluconate reductase  48.75 
 
 
282 aa  271  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.973362  normal  0.111177 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4977  2,5-didehydrogluconate reductase  50.74 
 
 
294 aa  270  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2709  aldo/keto reductase  50.18 
 
 
304 aa  268  7e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1394  2,5-didehydrogluconate reductase  47.31 
 
 
282 aa  268  7e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4230  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  48.15 
 
 
275 aa  268  8e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5462  aldo/keto reductase  49.63 
 
 
276 aa  268  8.999999999999999e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414898  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1500  putative oxidoreductase protein  51.84 
 
 
276 aa  267  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.181777  normal  0.869656 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0164  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.16 
 
 
357 aa  268  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.432724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3853  aldo/keto reductase family oxidoreductase  47.41 
 
 
312 aa  266  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230626  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4543  2,5-didehydrogluconate reductase  48.61 
 
 
295 aa  265  8e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4166  aldo/keto reductase family oxidoreductase  47.41 
 
 
275 aa  264  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4006  aldo/keto reductase family oxidoreductase  47.04 
 
 
275 aa  264  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000973326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4319  aldo/keto reductase family oxidoreductase  47.04 
 
 
275 aa  264  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4207  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  48.15 
 
 
275 aa  264  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3928  2,5-didehydrogluconate reductase  47.04 
 
 
275 aa  264  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0821638  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4121  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  47.04 
 
 
275 aa  264  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000119845 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2023  2,5-didehydrogluconate reductase  48.89 
 
 
278 aa  264  2e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.760724 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2581  2,5-didehydrogluconate reductase  48.91 
 
 
282 aa  263  2e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2300  2,5-didehydrogluconate reductase  48.89 
 
 
278 aa  263  2e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.109418 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1030  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  48.33 
 
 
275 aa  263  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0835  aldo/keto reductase  49.64 
 
 
281 aa  263  3e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.600409 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3839  aldo/keto reductase family oxidoreductase  47.04 
 
 
275 aa  263  3e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1985  2,5-didehydrogluconate reductase  48.89 
 
 
278 aa  263  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1938  2,5-didehydrogluconate reductase  48.33 
 
 
283 aa  262  4e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.499109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1984  2,5-didehydrogluconate reductase  48.33 
 
 
283 aa  262  4e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.062143  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3009  2,5-didehydrogluconate reductase  47.9 
 
 
294 aa  262  4.999999999999999e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000425946 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4957  2,5-didehydrogluconate reductase  48.55 
 
 
279 aa  262  4.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3900  aldo/keto reductase  50 
 
 
308 aa  261  6.999999999999999e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.835176  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2582  aldo/keto reductase  46.86 
 
 
276 aa  259  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0247931  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1918  2,5-didehydrogluconate reductase  47.96 
 
 
283 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.628248 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0848  Aldehyde reductase  50.19 
 
 
274 aa  259  4e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1699  2,5-didehydrogluconate reductase  47.46 
 
 
286 aa  258  7e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4205  2,5-didehydrogluconate reductase  47.58 
 
 
279 aa  258  7e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30490  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  50.55 
 
 
282 aa  258  9e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4216  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  47.6 
 
 
274 aa  256  2e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.296306  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2252  2,5-didehydrogluconate reductase  47.74 
 
 
291 aa  256  3e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.202758  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4383  aldo/keto reductase  48.69 
 
 
283 aa  255  6e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2522  2,5-didehydrogluconate reductase  42.07 
 
 
273 aa  254  1.0000000000000001e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0538132  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0197  aldo/keto reductase family oxidoreductase  45.68 
 
 
277 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0196  aldo/keto reductase family oxidoreductase  45.68 
 
 
277 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0487  aldo/keto reductase  48.71 
 
 
277 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0216  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  45.68 
 
 
277 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0600  2,5-didehydrogluconate reductase  45.45 
 
 
267 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31230  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  50 
 
 
293 aa  253  4.0000000000000004e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0187  aldo/keto reductase  45.68 
 
 
277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0239  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  45.32 
 
 
277 aa  252  6e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0216  aldo/keto reductase family oxidoreductase  45.32 
 
 
277 aa  252  6e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5104  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  45.32 
 
 
277 aa  251  7e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1615  2,5-didehydrogluconate reductase  48.5 
 
 
272 aa  251  7e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.808798  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0184  aldo/keto reductase  45.32 
 
 
277 aa  251  8.000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14340  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  46.71 
 
 
299 aa  251  8.000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.414164  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0196  2,5-didehydrogluconate reductase  46.3 
 
 
277 aa  251  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6724  2,5-didehydrogluconate reductase  47.78 
 
 
277 aa  250  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.658132 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2161  2,5-didehydrogluconate reductase  47.21 
 
 
279 aa  250  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0222  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  44.96 
 
 
277 aa  249  3e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1501  2,5-didehydrogluconate reductase  45.39 
 
 
274 aa  249  3e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0727  2,5-didehydrogluconate reductase  44.49 
 
 
279 aa  249  5e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0743  2,5-didehydrogluconate reductase  44.49 
 
 
279 aa  249  5e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>