More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3980 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3980  aldo/keto reductase  100 
 
 		 283 aa  590  1e-168  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.817607  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4373  2,5-didehydrogluconate reductase  90.11 
 
 		 283 aa  517  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0106599  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1051  2,5-didehydrogluconate reductase  69.68 
 
 		 286 aa  434  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.191739 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3809  Aldehyde reductase  66.31 
 
 		 283 aa  429  1e-119  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000126678  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0330  organophosphate reductase  63.96 
 
 		 283 aa  398  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.318988 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3075  2,5-didehydrogluconate reductase  63.25 
 
 		 283 aa  394  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2998  aldo/keto reductase family oxidoreductase  63.25 
 
 		 283 aa  394  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1742  2,5-didehydrogluconate reductase  62.9 
 
 		 286 aa  390  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00702522  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0166  2,5-didehydrogluconate reductase  67.97 
 
 		 283 aa  389  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1901  aldo/keto reductase family oxidoreductase  63.08 
 
 		 289 aa  387  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0037382 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0361  2,5-didehydrogluconate reductase  68.61 
 
 		 286 aa  380  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479945  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1796  2,5-didehydrogluconate reductase  62.06 
 
 		 286 aa  379  1e-104  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000313979  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0442  2,5-didehydrogluconate reductase  61.21 
 
 		 281 aa  372  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1297  2,5-didehydrogluconate reductase  58.33 
 
 		 280 aa  353  2e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.140644  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0160  aldo/keto reductase  63.96 
 
 		 284 aa  352  4e-96  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.960375 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1898  2,5-didehydrogluconate reductase  57.51 
 
 		 292 aa  345  3e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1800  2,5-didehydrogluconate reductase  56.52 
 
 		 282 aa  346  3e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.195279  hitchhiker  0.00925516 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2230  aldo/keto reductase  55.48 
 
 		 282 aa  342  5.999999999999999e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2269  aldo/keto reductase  55.48 
 
 		 282 aa  342  5.999999999999999e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2112  2,5-didehydrogluconate reductase  60.56 
 
 		 285 aa  340  2e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113097 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2708  2,5-didehydrogluconate reductase  59.57 
 
 		 286 aa  332  5e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1641  aldo/keto reductase  57.46 
 
 		 286 aa  330  1e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000276497  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3785  Aldehyde reductase  56.59 
 
 		 267 aa  318  6e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal  0.0153976 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2512  aldo/keto reductase  54.74 
 
 		 281 aa  318  7.999999999999999e-86  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.415578  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0966  aldo/keto reductase  54.39 
 
 		 292 aa  302  3.0000000000000004e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.283303  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1088  aldo/keto reductase  54.04 
 
 		 292 aa  298  1e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.207607  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1361  aldo/keto reductase  51.99 
 
 		 285 aa  296  3e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104969  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0995  aldo/keto reductase  50.19 
 
 		 291 aa  296  3e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000447693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0350  morphine 6-dehydrogenase  64.71 
 
 		 191 aa  273  3e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.708797 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2796  2,5-didehydrogluconate reductase  50.78 
 
 		 275 aa  271  6e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4166  aldo/keto reductase family oxidoreductase  50.97 
 
 		 275 aa  270  1e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4230  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  50.58 
 
 		 275 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3928  2,5-didehydrogluconate reductase  50.19 
 
 		 275 aa  268  7e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0821638  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4006  aldo/keto reductase family oxidoreductase  49.81 
 
 		 275 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000973326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3839  aldo/keto reductase family oxidoreductase  49.81 
 
 		 275 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4319  aldo/keto reductase family oxidoreductase  49.81 
 
 		 275 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4121  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  49.81 
 
 		 275 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000119845 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3853  aldo/keto reductase family oxidoreductase  49.81 
 
 		 312 aa  268  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230626  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0196  2,5-didehydrogluconate reductase  48.9 
 
 		 277 aa  266  2e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0216  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  48.9 
 
 		 277 aa  267  2e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0197  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.9 
 
 		 277 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0196  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.9 
 
 		 277 aa  267  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4207  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  49.81 
 
 		 275 aa  266  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0222  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  50.19 
 
 		 277 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0216  aldo/keto reductase family oxidoreductase  50.19 
 
 		 277 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0239  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  50.19 
 
 		 277 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1587  2,5-didehydrogluconate reductase  51.88 
 
 		 276 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0625741  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5104  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  50.19 
 
 		 277 aa  265  5e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0184  aldo/keto reductase  48.53 
 
 		 277 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0519  2,5-didehydrogluconate reductase  51.75 
 
 		 275 aa  265  7e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00901409  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1030  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  49.42 
 
 		 275 aa  263  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0187  aldo/keto reductase  49.42 
 
 		 277 aa  263  3e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0181  2,5-didehydrogluconate reductase  48.9 
 
 		 277 aa  263  3e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7952  2,5-didehydrogluconate reductase  52.03 
 
 		 270 aa  262  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1380  2,5-didehydrogluconate reductase  51.76 
 
 		 275 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0084  aldo/keto reductase  48.38 
 
 		 276 aa  259  5.0000000000000005e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3534  2,5-didehydrogluconate reductase  51.91 
 
 		 272 aa  258  6e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  0.675115 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0600  2,5-didehydrogluconate reductase  47.99 
 
 		 267 aa  255  4e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1801  2,5-diketo-D-gluconic acid reductase A  45.71 
 
 		 289 aa  254  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.421925 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1475  2,5-diketo-D-gluconic acid reductase A  45.36 
 
 		 289 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1160  2,5-didehydrogluconate reductase  47.14 
 
 		 276 aa  253  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6724  2,5-didehydrogluconate reductase  50.58 
 
 		 277 aa  252  4.0000000000000004e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.658132 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0848  Aldehyde reductase  47.79 
 
 		 274 aa  251  8.000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0064  2,5-didehydrogluconate reductase  47.91 
 
 		 288 aa  250  2e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.750291  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3900  aldo/keto reductase  47.33 
 
 		 308 aa  250  2e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.835176  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1656  2,5-diketo-D-gluconic acid reductase A  45 
 
 		 289 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.116736 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1799  2,5-diketo-D-gluconic acid reductase A  45 
 
 		 289 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0682871  normal  0.021154 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1861  2,5-diketo-D-gluconic acid reductase A  45 
 
 		 289 aa  249  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0353  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  45.36 
 
 		 289 aa  249  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.93544 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0266  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  45.36 
 
 		 289 aa  249  4e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0353  aldo/keto reductase family oxidoreductase  45.36 
 
 		 289 aa  249  4e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.823091  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4126  2,5-didehydrogluconate reductase  48.31 
 
 		 294 aa  249  5e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2522  2,5-didehydrogluconate reductase  45.21 
 
 		 273 aa  248  7e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0538132  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0333  aldo/keto reductase family oxidoreductase  45.36 
 
 		 289 aa  248  8e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1972  2,5-didehydrogluconate reductase  46.47 
 
 		 298 aa  246  2e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0314  aldo/keto reductase family oxidoreductase  45 
 
 		 289 aa  246  4e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1087  aldo/keto reductase  45 
 
 		 288 aa  246  4e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1913  2,5-didehydrogluconate reductase  48.5 
 
 		 278 aa  245  8e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.143661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6248  2,5-didehydrogluconate reductase  44.19 
 
 		 278 aa  241  7e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0038  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  48.38 
 
 		 279 aa  241  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000134419 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31230  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  45.49 
 
 		 293 aa  241  1e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1721  2,5-didehydrogluconate reductase  47.6 
 
 		 276 aa  241  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.459314 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14610  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  46.42 
 
 		 294 aa  241  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5206  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.55 
 
 		 279 aa  240  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3423  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  48.55 
 
 		 279 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.681639  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4957  2,5-didehydrogluconate reductase  46.21 
 
 		 279 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1395  2,5-didehydrogluconate reductase  47.43 
 
 		 281 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.330402  decreased coverage  0.000466795 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3009  2,5-didehydrogluconate reductase  45.09 
 
 		 294 aa  239  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000425946 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5210  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  48.01 
 
 		 279 aa  239  5e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4931  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.01 
 
 		 279 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5308  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.01 
 
 		 279 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4893  2,5-didehydrogluconate reductase  48.74 
 
 		 279 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0964  aldo/keto reductase  44.83 
 
 		 273 aa  239  5.999999999999999e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.259587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5223  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  48.01 
 
 		 279 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15550  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  48.89 
 
 		 282 aa  238  5.999999999999999e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00501077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3547  2,5-didehydrogluconate reductase  45.29 
 
 		 278 aa  238  5.999999999999999e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.802476  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4772  aldo/keto reductase family oxidoreductase  47.65 
 
 		 279 aa  237  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0164  aldo/keto reductase family oxidoreductase  49.61 
 
 		 357 aa  237  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.432724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5174  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  48.01 
 
 		 279 aa  237  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000199554 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1394  2,5-didehydrogluconate reductase  44.6 
 
 		 282 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>