More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1656 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C1861  2,5-diketo-D-gluconic acid reductase A  99.65 
 
 
289 aa  604  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1799  2,5-diketo-D-gluconic acid reductase A  99.65 
 
 
289 aa  604  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0682871  normal  0.021154 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1656  2,5-diketo-D-gluconic acid reductase A  100 
 
 
289 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.116736 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1475  2,5-diketo-D-gluconic acid reductase A  98.96 
 
 
289 aa  600  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1801  2,5-diketo-D-gluconic acid reductase A  98.62 
 
 
289 aa  598  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.421925 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0353  aldo/keto reductase family oxidoreductase  84.43 
 
 
289 aa  528  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.823091  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0266  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  84.43 
 
 
289 aa  528  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0353  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  84.78 
 
 
289 aa  530  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.93544 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0333  aldo/keto reductase family oxidoreductase  84.38 
 
 
289 aa  527  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0314  aldo/keto reductase family oxidoreductase  84.08 
 
 
289 aa  525  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1742  2,5-didehydrogluconate reductase  47.87 
 
 
286 aa  280  2e-74  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00702522  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3809  Aldehyde reductase  48.44 
 
 
283 aa  278  8e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000126678  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1796  2,5-didehydrogluconate reductase  46.26 
 
 
286 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000313979  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0966  aldo/keto reductase  47.86 
 
 
292 aa  267  2e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.283303  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0442  2,5-didehydrogluconate reductase  51.55 
 
 
281 aa  263  3e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1051  2,5-didehydrogluconate reductase  45.45 
 
 
286 aa  262  4e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.191739 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1898  2,5-didehydrogluconate reductase  48.84 
 
 
292 aa  261  1e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1088  aldo/keto reductase  50 
 
 
292 aa  260  2e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.207607  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0330  organophosphate reductase  45.99 
 
 
283 aa  258  9e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.318988 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3075  2,5-didehydrogluconate reductase  45.99 
 
 
283 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2998  aldo/keto reductase family oxidoreductase  45.99 
 
 
283 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1901  aldo/keto reductase family oxidoreductase  45.86 
 
 
289 aa  255  6e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0037382 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2512  aldo/keto reductase  49.61 
 
 
281 aa  253  3e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.415578  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0166  2,5-didehydrogluconate reductase  49.06 
 
 
283 aa  251  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1800  2,5-didehydrogluconate reductase  46.04 
 
 
282 aa  250  2e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.195279  hitchhiker  0.00925516 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1641  aldo/keto reductase  45.79 
 
 
286 aa  250  2e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000276497  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0361  2,5-didehydrogluconate reductase  50.39 
 
 
286 aa  248  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479945  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2796  2,5-didehydrogluconate reductase  48.66 
 
 
275 aa  246  3e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0160  aldo/keto reductase  48.39 
 
 
284 aa  243  3e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.960375 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3785  Aldehyde reductase  44.83 
 
 
267 aa  240  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal  0.0153976 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4166  aldo/keto reductase family oxidoreductase  47.89 
 
 
275 aa  240  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4230  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  47.51 
 
 
275 aa  240  2e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3853  aldo/keto reductase family oxidoreductase  47.51 
 
 
312 aa  239  5e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230626  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4373  2,5-didehydrogluconate reductase  45.71 
 
 
283 aa  238  8e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0106599  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1297  2,5-didehydrogluconate reductase  44.57 
 
 
280 aa  237  1e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.140644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4121  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  47.13 
 
 
275 aa  237  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000119845 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0216  aldo/keto reductase family oxidoreductase  47.15 
 
 
277 aa  236  2e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0197  aldo/keto reductase family oxidoreductase  46.01 
 
 
277 aa  236  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4006  aldo/keto reductase family oxidoreductase  47.13 
 
 
275 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000973326  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3928  2,5-didehydrogluconate reductase  47.13 
 
 
275 aa  237  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0821638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0196  aldo/keto reductase family oxidoreductase  46.01 
 
 
277 aa  236  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4319  aldo/keto reductase family oxidoreductase  47.13 
 
 
275 aa  237  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0216  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  46.01 
 
 
277 aa  236  2e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0239  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  47.15 
 
 
277 aa  236  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1030  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  46.74 
 
 
275 aa  236  3e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3839  aldo/keto reductase family oxidoreductase  46.74 
 
 
275 aa  236  4e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5104  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  46.38 
 
 
277 aa  236  4e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0222  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  46.38 
 
 
277 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0184  aldo/keto reductase  45.65 
 
 
277 aa  234  9e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2708  2,5-didehydrogluconate reductase  45.45 
 
 
286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4207  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  45.98 
 
 
275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0181  2,5-didehydrogluconate reductase  46.38 
 
 
277 aa  233  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0187  aldo/keto reductase  45.65 
 
 
277 aa  232  5e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3980  aldo/keto reductase  45 
 
 
283 aa  232  6e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.817607  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1087  aldo/keto reductase  43.12 
 
 
288 aa  231  7.000000000000001e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2112  2,5-didehydrogluconate reductase  47.39 
 
 
285 aa  231  7.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113097 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0995  aldo/keto reductase  41.94 
 
 
291 aa  231  8.000000000000001e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000447693  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0196  2,5-didehydrogluconate reductase  44.93 
 
 
277 aa  228  7e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2230  aldo/keto reductase  40.78 
 
 
282 aa  225  7e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2269  aldo/keto reductase  40.78 
 
 
282 aa  225  7e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1587  2,5-didehydrogluconate reductase  46.01 
 
 
276 aa  224  9e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0625741  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4931  aldo/keto reductase family oxidoreductase  46.35 
 
 
279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5308  aldo/keto reductase family oxidoreductase  46.35 
 
 
279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6724  2,5-didehydrogluconate reductase  44.12 
 
 
277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.658132 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5223  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  46.35 
 
 
279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31230  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  43.8 
 
 
293 aa  219  3e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5210  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  46.35 
 
 
279 aa  219  5e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5174  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  47.64 
 
 
279 aa  219  5e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000199554 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5206  aldo/keto reductase family oxidoreductase  46.72 
 
 
279 aa  219  6e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3101  aldo/keto reductase family oxidoreductase  46.35 
 
 
279 aa  219  6e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4772  aldo/keto reductase family oxidoreductase  45.99 
 
 
279 aa  218  7e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0038  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  46.35 
 
 
279 aa  218  7e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000134419 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4543  2,5-didehydrogluconate reductase  43.43 
 
 
295 aa  218  8.999999999999998e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4893  2,5-didehydrogluconate reductase  46.35 
 
 
279 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4792  aldo/keto reductase family oxidoreductase  47.27 
 
 
279 aa  218  1e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1160  2,5-didehydrogluconate reductase  43.57 
 
 
276 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2522  2,5-didehydrogluconate reductase  42.59 
 
 
273 aa  217  1e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0538132  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1501  2,5-didehydrogluconate reductase  44.4 
 
 
274 aa  217  2e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0064  2,5-didehydrogluconate reductase  43.45 
 
 
288 aa  217  2e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.750291  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3193  aldo/keto reductase family oxidoreductase  46.69 
 
 
279 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.724803  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3446  aldo/keto reductase family oxidoreductase  46.69 
 
 
279 aa  216  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0600  2,5-didehydrogluconate reductase  43.08 
 
 
267 aa  216  5e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1380  2,5-didehydrogluconate reductase  44.89 
 
 
275 aa  216  5e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3423  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  45.99 
 
 
279 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.681639  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0519  2,5-didehydrogluconate reductase  46.15 
 
 
275 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00901409  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0848  Aldehyde reductase  44.27 
 
 
274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3900  aldo/keto reductase  43.28 
 
 
308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.835176  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2709  aldo/keto reductase  42.39 
 
 
304 aa  213  3.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3534  2,5-didehydrogluconate reductase  41.79 
 
 
272 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  0.675115 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1839  2,5-didehydrogluconate reductase  43.23 
 
 
277 aa  211  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1875  2,5-didehydrogluconate reductase  43.23 
 
 
277 aa  211  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7952  2,5-didehydrogluconate reductase  45.25 
 
 
270 aa  210  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15550  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  45.59 
 
 
282 aa  210  3e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00501077  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1361  aldo/keto reductase  41.86 
 
 
285 aa  209  3e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104969  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0942  2,5-didehydrogluconate reductase  41.31 
 
 
300 aa  209  6e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.175704  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1395  2,5-didehydrogluconate reductase  45.21 
 
 
281 aa  207  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.330402  decreased coverage  0.000466795 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1476  aldo/keto reductase family oxidoreductase  42.75 
 
 
280 aa  206  3e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0251019  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14340  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  40.22 
 
 
299 aa  205  6e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.414164  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1918  2,5-didehydrogluconate reductase  43.35 
 
 
283 aa  205  7e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.628248 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4225  oxidoreductase  40.91 
 
 
276 aa  205  7e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>