More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2708 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2708  2,5-didehydrogluconate reductase  100 
 
 
286 aa  585  1e-166  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2112  2,5-didehydrogluconate reductase  66.2 
 
 
285 aa  377  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00113097 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3809  Aldehyde reductase  56.54 
 
 
283 aa  354  8.999999999999999e-97  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000126678  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1051  2,5-didehydrogluconate reductase  60.85 
 
 
286 aa  354  1e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.191739 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1742  2,5-didehydrogluconate reductase  58.12 
 
 
286 aa  350  1e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00702522  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1796  2,5-didehydrogluconate reductase  54.23 
 
 
286 aa  341  1e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000313979  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0166  2,5-didehydrogluconate reductase  64.39 
 
 
283 aa  340  2e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4373  2,5-didehydrogluconate reductase  58.87 
 
 
283 aa  334  1e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0106599  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3980  aldo/keto reductase  59.57 
 
 
283 aa  332  6e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.817607  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0330  organophosphate reductase  54.77 
 
 
283 aa  330  1e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.318988 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0160  aldo/keto reductase  63.31 
 
 
284 aa  329  4e-89  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.960375 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3075  2,5-didehydrogluconate reductase  54.42 
 
 
283 aa  328  5.0000000000000004e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2998  aldo/keto reductase family oxidoreductase  54.42 
 
 
283 aa  328  5.0000000000000004e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1901  aldo/keto reductase family oxidoreductase  56.04 
 
 
289 aa  327  1.0000000000000001e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0037382 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0361  2,5-didehydrogluconate reductase  63.08 
 
 
286 aa  327  2.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0479945  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1800  2,5-didehydrogluconate reductase  55.31 
 
 
282 aa  323  2e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.195279  hitchhiker  0.00925516 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0442  2,5-didehydrogluconate reductase  54.64 
 
 
281 aa  322  3e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1641  aldo/keto reductase  58.61 
 
 
286 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000276497  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1297  2,5-didehydrogluconate reductase  52.21 
 
 
280 aa  316  3e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.140644  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1898  2,5-didehydrogluconate reductase  52.31 
 
 
292 aa  315  4e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2269  aldo/keto reductase  50.18 
 
 
282 aa  306  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2230  aldo/keto reductase  50.18 
 
 
282 aa  306  2.0000000000000002e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7952  2,5-didehydrogluconate reductase  59.69 
 
 
270 aa  288  6e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2512  aldo/keto reductase  47.31 
 
 
281 aa  285  5e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.415578  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0084  aldo/keto reductase  56.82 
 
 
276 aa  285  8e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1587  2,5-didehydrogluconate reductase  55.22 
 
 
276 aa  285  8e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0625741  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1361  aldo/keto reductase  46.38 
 
 
285 aa  282  4.0000000000000003e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104969  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0995  aldo/keto reductase  46.55 
 
 
291 aa  281  1e-74  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000447693  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0966  aldo/keto reductase  52.96 
 
 
292 aa  275  6e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.283303  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1087  aldo/keto reductase  47.48 
 
 
288 aa  275  7e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3534  2,5-didehydrogluconate reductase  54.04 
 
 
272 aa  275  9e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  0.675115 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3785  Aldehyde reductase  50 
 
 
267 aa  275  9e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.105861  normal  0.0153976 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2796  2,5-didehydrogluconate reductase  50.19 
 
 
275 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1160  2,5-didehydrogluconate reductase  55.69 
 
 
276 aa  272  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1721  2,5-didehydrogluconate reductase  52.27 
 
 
276 aa  269  4e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.459314 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0519  2,5-didehydrogluconate reductase  52.73 
 
 
275 aa  267  1e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00901409  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15550  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  53.03 
 
 
282 aa  267  1e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00501077  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02540  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  53.03 
 
 
279 aa  265  5.999999999999999e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.935575  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0600  2,5-didehydrogluconate reductase  47.04 
 
 
267 aa  263  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4166  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.46 
 
 
275 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4225  oxidoreductase  49.24 
 
 
276 aa  262  4.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3853  aldo/keto reductase family oxidoreductase  47.69 
 
 
312 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230626  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1972  2,5-didehydrogluconate reductase  48.92 
 
 
298 aa  261  1e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4006  aldo/keto reductase family oxidoreductase  47.69 
 
 
275 aa  259  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000973326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3839  aldo/keto reductase family oxidoreductase  47.69 
 
 
275 aa  259  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4319  aldo/keto reductase family oxidoreductase  47.69 
 
 
275 aa  259  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4121  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  47.69 
 
 
275 aa  259  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000119845 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4230  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  48.08 
 
 
275 aa  259  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1088  aldo/keto reductase  51.11 
 
 
292 aa  259  5.0000000000000005e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.207607  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4126  2,5-didehydrogluconate reductase  50 
 
 
294 aa  258  9e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0181  2,5-didehydrogluconate reductase  49.22 
 
 
277 aa  256  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4205  2,5-didehydrogluconate reductase  50.76 
 
 
279 aa  257  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3928  2,5-didehydrogluconate reductase  47.31 
 
 
275 aa  256  3e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0821638  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2768  2,5-didehydrogluconate reductase  52.61 
 
 
278 aa  255  5e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1656  2,5-diketo-D-gluconic acid reductase A  45.45 
 
 
289 aa  255  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.116736 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0265  aldo/keto reductase  51.61 
 
 
281 aa  255  6e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1861  2,5-diketo-D-gluconic acid reductase A  46.38 
 
 
289 aa  255  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1799  2,5-diketo-D-gluconic acid reductase A  46.38 
 
 
289 aa  255  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0682871  normal  0.021154 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0196  2,5-didehydrogluconate reductase  48.84 
 
 
277 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1475  2,5-diketo-D-gluconic acid reductase A  46.38 
 
 
289 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1801  2,5-diketo-D-gluconic acid reductase A  46.38 
 
 
289 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.421925 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4207  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  46.92 
 
 
275 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5462  aldo/keto reductase  50.38 
 
 
276 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414898  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1030  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  47.31 
 
 
275 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1380  2,5-didehydrogluconate reductase  49.42 
 
 
275 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1985  2,5-didehydrogluconate reductase  50.96 
 
 
276 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.163279  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1938  2,5-didehydrogluconate reductase  50.76 
 
 
283 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.499109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1984  2,5-didehydrogluconate reductase  50.76 
 
 
283 aa  253  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.062143  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0861  aldo/keto reductase  51.74 
 
 
274 aa  252  5.000000000000001e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.274237  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1919  2,5-didehydrogluconate reductase  51.35 
 
 
276 aa  252  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.894727 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0353  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  45.23 
 
 
289 aa  250  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.93544 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3900  aldo/keto reductase  47.37 
 
 
308 aa  251  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.835176  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0333  aldo/keto reductase family oxidoreductase  45.23 
 
 
289 aa  251  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0216  aldo/keto reductase family oxidoreductase  48.05 
 
 
277 aa  250  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0239  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  48.05 
 
 
277 aa  250  2e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0848  Aldehyde reductase  50.19 
 
 
274 aa  249  3e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1918  2,5-didehydrogluconate reductase  50.38 
 
 
283 aa  249  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.628248 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06660  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  50.38 
 
 
277 aa  249  4e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0266  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  44.88 
 
 
289 aa  249  4e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5104  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  48.05 
 
 
277 aa  249  4e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0353  aldo/keto reductase family oxidoreductase  44.88 
 
 
289 aa  249  4e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.823091  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0222  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  48.05 
 
 
277 aa  248  7e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0314  aldo/keto reductase family oxidoreductase  44.88 
 
 
289 aa  248  8e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1913  2,5-didehydrogluconate reductase  48.24 
 
 
278 aa  248  8e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.143661  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0491  aldo/keto reductase  50.36 
 
 
273 aa  248  9e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.333273 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0197  aldo/keto reductase family oxidoreductase  46.64 
 
 
277 aa  247  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0196  aldo/keto reductase family oxidoreductase  46.64 
 
 
277 aa  247  2e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0216  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  46.64 
 
 
277 aa  247  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2161  2,5-didehydrogluconate reductase  51.15 
 
 
279 aa  246  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0968  aldo/keto reductase  52.9 
 
 
274 aa  246  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1360  2,5-didehydrogluconate reductase  47.73 
 
 
282 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.603872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1378  2,5-didehydrogluconate reductase  47.73 
 
 
282 aa  246  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3214  2,5-didehydrogluconate reductase  49.81 
 
 
280 aa  246  3e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00515928  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0184  aldo/keto reductase  46.27 
 
 
277 aa  244  8e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0164  aldo/keto reductase family oxidoreductase  46.92 
 
 
357 aa  244  9e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.432724  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0183  aldo/keto reductase family oxidoreductase  46.92 
 
 
275 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31230  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  48.04 
 
 
293 aa  244  9.999999999999999e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30490  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  49.62 
 
 
282 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0187  aldo/keto reductase  46.9 
 
 
277 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4543  2,5-didehydrogluconate reductase  46.69 
 
 
295 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>