More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_14340 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_14340  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  100 
 
 
299 aa  607  1e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.414164  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4543  2,5-didehydrogluconate reductase  68.04 
 
 
295 aa  404  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2709  aldo/keto reductase  67.23 
 
 
304 aa  406  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4126  2,5-didehydrogluconate reductase  68.47 
 
 
294 aa  403  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31230  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  67.81 
 
 
293 aa  395  1e-109  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3945  aldo/keto reductase  68.6 
 
 
295 aa  397  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3900  aldo/keto reductase  66.2 
 
 
308 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.835176  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3009  2,5-didehydrogluconate reductase  67.12 
 
 
294 aa  388  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000425946 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14610  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  63.1 
 
 
294 aa  380  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3218  aldo/keto reductase  63.82 
 
 
295 aa  359  3e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1972  2,5-didehydrogluconate reductase  52.04 
 
 
298 aa  316  3e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0084  aldo/keto reductase  51.75 
 
 
276 aa  286  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7952  2,5-didehydrogluconate reductase  53.21 
 
 
270 aa  285  5.999999999999999e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1587  2,5-didehydrogluconate reductase  50.88 
 
 
276 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0625741  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3534  2,5-didehydrogluconate reductase  49.1 
 
 
272 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  0.675115 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1395  2,5-didehydrogluconate reductase  49.65 
 
 
281 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.330402  decreased coverage  0.000466795 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0861  aldo/keto reductase  50.18 
 
 
274 aa  272  6e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.274237  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1360  2,5-didehydrogluconate reductase  48.08 
 
 
282 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.603872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1378  2,5-didehydrogluconate reductase  48.08 
 
 
282 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3547  2,5-didehydrogluconate reductase  47.89 
 
 
278 aa  267  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.802476  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1394  2,5-didehydrogluconate reductase  47.04 
 
 
282 aa  264  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3214  2,5-didehydrogluconate reductase  49.65 
 
 
280 aa  263  3e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00515928  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0519  2,5-didehydrogluconate reductase  49.1 
 
 
275 aa  261  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00901409  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0164  aldo/keto reductase family oxidoreductase  44.91 
 
 
357 aa  258  7e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.432724  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0183  aldo/keto reductase family oxidoreductase  44.91 
 
 
275 aa  258  8e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2796  2,5-didehydrogluconate reductase  47.5 
 
 
275 aa  256  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1985  2,5-didehydrogluconate reductase  46.64 
 
 
276 aa  256  4e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.163279  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4977  2,5-didehydrogluconate reductase  47.18 
 
 
294 aa  255  7e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1919  2,5-didehydrogluconate reductase  46.64 
 
 
276 aa  255  7e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.894727 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4957  2,5-didehydrogluconate reductase  46.13 
 
 
279 aa  254  9e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1160  2,5-didehydrogluconate reductase  49.64 
 
 
276 aa  254  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1913  2,5-didehydrogluconate reductase  47.5 
 
 
278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.143661  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4697  2,5-didehydrogluconate reductase  47.04 
 
 
282 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.973362  normal  0.111177 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1380  2,5-didehydrogluconate reductase  46.98 
 
 
275 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02540  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  46.71 
 
 
279 aa  251  9.000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.935575  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1769  2,5-didehydrogluconate reductase  45.99 
 
 
281 aa  250  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.904108  normal  0.360608 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2581  2,5-didehydrogluconate reductase  47.2 
 
 
282 aa  247  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4230  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  46.1 
 
 
275 aa  247  2e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1721  2,5-didehydrogluconate reductase  45.91 
 
 
276 aa  247  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.459314 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4166  aldo/keto reductase family oxidoreductase  46.1 
 
 
275 aa  246  4e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0685  2,5-didehydrogluconate reductase  44.91 
 
 
281 aa  246  4e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.689254  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3013  2,5-didehydrogluconate reductase  43.16 
 
 
276 aa  245  6.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.856221  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3853  aldo/keto reductase family oxidoreductase  45.39 
 
 
312 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230626  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03850  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  46.13 
 
 
282 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0362  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.58 
 
 
279 aa  243  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4006  aldo/keto reductase family oxidoreductase  45.39 
 
 
275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000973326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4319  aldo/keto reductase family oxidoreductase  45.39 
 
 
275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4207  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  46.1 
 
 
275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4121  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  45.39 
 
 
275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000119845 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30490  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  45.42 
 
 
282 aa  243  3e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3839  aldo/keto reductase family oxidoreductase  45.39 
 
 
275 aa  243  3e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4383  aldo/keto reductase  45.91 
 
 
283 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0835  aldo/keto reductase  46.64 
 
 
281 aa  243  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.600409 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15550  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  45.23 
 
 
282 aa  242  6e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00501077  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06660  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  45.33 
 
 
277 aa  241  1e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1030  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  46.1 
 
 
275 aa  240  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3928  2,5-didehydrogluconate reductase  45.04 
 
 
275 aa  240  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0821638  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0968  aldo/keto reductase  46.45 
 
 
274 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4349  2,5-didehydrogluconate reductase  46.26 
 
 
275 aa  238  6.999999999999999e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00162069  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0491  aldo/keto reductase  46.98 
 
 
273 aa  238  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.333273 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1500  putative oxidoreductase protein  46.59 
 
 
276 aa  236  4e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.181777  normal  0.869656 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5462  aldo/keto reductase  45.33 
 
 
276 aa  236  4e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414898  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0265  aldo/keto reductase  44.17 
 
 
281 aa  235  6e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1600  2,5-didehydrogluconate reductase  45.36 
 
 
289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4225  oxidoreductase  42.2 
 
 
276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1420  2,5-didehydrogluconate reductase  47.16 
 
 
274 aa  233  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.917399  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1985  2,5-didehydrogluconate reductase  45.3 
 
 
278 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2768  2,5-didehydrogluconate reductase  46.74 
 
 
278 aa  230  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.988077  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2300  2,5-didehydrogluconate reductase  45.23 
 
 
278 aa  229  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.109418 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1989  aldo/keto reductase  43.39 
 
 
291 aa  229  4e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000065841 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1051  2,5-didehydrogluconate reductase  44.53 
 
 
286 aa  229  5e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.191739 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0848  Aldehyde reductase  43.06 
 
 
274 aa  228  8e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2023  2,5-didehydrogluconate reductase  44.88 
 
 
278 aa  228  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.760724 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3761  2,5-didehydrogluconate reductase  42.96 
 
 
276 aa  226  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2522  2,5-didehydrogluconate reductase  38.85 
 
 
273 aa  225  6e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0538132  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2161  2,5-didehydrogluconate reductase  44.72 
 
 
279 aa  225  7e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2708  2,5-didehydrogluconate reductase  47.45 
 
 
286 aa  225  7e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4216  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  43.01 
 
 
274 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.296306  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0222  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  40.57 
 
 
277 aa  223  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0586  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  42.96 
 
 
275 aa  223  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0216  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.86 
 
 
277 aa  223  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0272  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  42.86 
 
 
277 aa  223  4e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0239  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  39.86 
 
 
277 aa  223  4e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0667  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  42.52 
 
 
277 aa  223  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0727  2,5-didehydrogluconate reductase  39.78 
 
 
279 aa  222  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1687  2,5-didehydrogluconate reductase  46.69 
 
 
258 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0743  2,5-didehydrogluconate reductase  39.78 
 
 
279 aa  222  4.9999999999999996e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2028  2,5-didehydrogluconate reductase  44.37 
 
 
277 aa  222  6e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5104  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  40.21 
 
 
277 aa  222  7e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0988  2,5-didehydrogluconate reductase  42.86 
 
 
272 aa  221  9e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4086  aldo/keto reductase  41.81 
 
 
276 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.968066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6724  2,5-didehydrogluconate reductase  43.82 
 
 
277 aa  221  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.658132 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0181  2,5-didehydrogluconate reductase  40.21 
 
 
277 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2252  2,5-didehydrogluconate reductase  44.07 
 
 
291 aa  220  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.202758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0216  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  38.83 
 
 
277 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0197  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.83 
 
 
277 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0196  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.83 
 
 
277 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0187  aldo/keto reductase  39.18 
 
 
277 aa  219  6e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1742  2,5-didehydrogluconate reductase  42.09 
 
 
286 aa  218  1e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00702522  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0184  aldo/keto reductase  38.49 
 
 
277 aa  217  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>