More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02792 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02792  probable oxidoreductase  100 
 
 		 278 aa  570  1.0000000000000001e-162  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1316  aldo/keto reductase  51.66 
 
 		 271 aa  305  6e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.904393  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3599  aldo/keto reductase  55.56 
 
 		 280 aa  304  8.000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00200  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  54.65 
 
 		 267 aa  296  2e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148488  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00205  hypothetical protein  54.65 
 
 		 267 aa  296  2e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.125752  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0204  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  54.28 
 
 		 267 aa  296  3e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0222  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  54.28 
 
 		 267 aa  295  5e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0705129  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3401  aldo/keto reductase  54.28 
 
 		 267 aa  295  6e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0211  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  54.28 
 
 		 267 aa  295  6e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0362263  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0210  aldo/keto reductase  54.07 
 
 		 268 aa  295  7e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3458  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  54.28 
 
 		 267 aa  294  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.412559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0220  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  53.9 
 
 		 267 aa  291  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.167357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0213  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  53.16 
 
 		 267 aa  290  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0554444  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02282  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  52.24 
 
 		 267 aa  290  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0293  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  51.67 
 
 		 274 aa  281  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.896057 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0285  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  51.09 
 
 		 274 aa  280  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0299  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  51.67 
 
 		 274 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0278  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  52.04 
 
 		 267 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0068  aldo/keto reductase  52.24 
 
 		 267 aa  272  6e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0904  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  49.07 
 
 		 267 aa  271  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0280  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  52.04 
 
 		 274 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1975  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  49.44 
 
 		 267 aa  270  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  0.128704 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1154  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  49.81 
 
 		 283 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.254496  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5116  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  49.44 
 
 		 267 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745449  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3327  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  49.07 
 
 		 267 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2368  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  48.7 
 
 		 267 aa  268  8e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1880  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  49.07 
 
 		 267 aa  265  4e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2695  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  48.89 
 
 		 268 aa  265  7e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3899  aldo/keto reductase  52.57 
 
 		 269 aa  264  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.986138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5364  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  49.44 
 
 		 267 aa  264  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4134  aldo/keto reductase  48.69 
 
 		 273 aa  264  1e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0287  2,5-didehydrogluconate reductase  47.99 
 
 		 277 aa  264  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.941845 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0925  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  47.21 
 
 		 272 aa  263  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2306  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  48.15 
 
 		 268 aa  262  4e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0833333  hitchhiker  0.000000150497 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09980  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  47.21 
 
 		 272 aa  262  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00527099  normal  0.878507 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1865  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  46.84 
 
 		 267 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2153  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  48.71 
 
 		 268 aa  258  6e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0240  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  48.71 
 
 		 268 aa  257  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0422  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  48.71 
 
 		 268 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495467  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0945  aldo/keto reductase  46.1 
 
 		 273 aa  255  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1180  aldo/keto reductase  44.61 
 
 		 267 aa  253  3e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03276  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  51.01 
 
 		 246 aa  251  6e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1048  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  46.1 
 
 		 267 aa  251  9.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00311623  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4858  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  47.97 
 
 		 268 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5450  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  47.97 
 
 		 268 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5412  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  47.97 
 
 		 268 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948984  decreased coverage  0.00302815 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1101  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.72 
 
 		 267 aa  249  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5298  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  46.49 
 
 		 268 aa  245  6e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.222173 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3351  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  46.47 
 
 		 268 aa  244  8e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0904766 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4753  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  46.86 
 
 		 268 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10147  normal  0.725846 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0578  aldo/keto reductase  44.4 
 
 		 276 aa  224  9e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.113038  normal  0.346661 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0288  2,5-didehydrogluconate reductase  40.71 
 
 		 274 aa  219  3e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.206569  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2042  aldo/keto reductase  41.45 
 
 		 280 aa  216  4e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4789  putative aldo/keto reductase  40.14 
 
 		 272 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30490  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  42.8 
 
 		 282 aa  209  5e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06660  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  42.42 
 
 		 277 aa  209  6e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0672  aldo/keto reductase  41.45 
 
 		 280 aa  207  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851781  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3073  2,5-didehydrogluconate reductase  39.43 
 
 		 272 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2432  2,5-didehydrogluconate reductase  36.2 
 
 		 272 aa  204  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812147  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3339  2,5-didehydrogluconate reductase  40.14 
 
 		 272 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3571  aldo/keto reductase  40.37 
 
 		 277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4776  aldo/keto reductase  38.71 
 
 		 274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0580  aldo/keto reductase  40.93 
 
 		 275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2161  2,5-didehydrogluconate reductase  42.02 
 
 		 279 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1306  aldo/keto reductase  38.71 
 
 		 274 aa  199  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1167  aldo/keto reductase  39.85 
 
 		 277 aa  198  7e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.23428 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0183  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.64 
 
 		 275 aa  196  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3534  2,5-didehydrogluconate reductase  39.92 
 
 		 272 aa  196  5.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  0.675115 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2929  aldo/keto reductase  42.35 
 
 		 274 aa  195  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1329  aldo/keto reductase  36.92 
 
 		 274 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245506  normal  0.195487 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1476  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.11 
 
 		 280 aa  195  7e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0251019  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3013  2,5-didehydrogluconate reductase  38.64 
 
 		 276 aa  194  9e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.856221  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3052  aldo/keto reductase  40 
 
 		 274 aa  194  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2717  aldo/keto reductase  39.5 
 
 		 274 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5462  aldo/keto reductase  39.62 
 
 		 276 aa  194  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3895  aldo/keto reductase  37.28 
 
 		 274 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.216872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0968  aldo/keto reductase  40.3 
 
 		 274 aa  193  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0164  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.64 
 
 		 357 aa  192  4e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.432724  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0727  2,5-didehydrogluconate reductase  37.59 
 
 		 279 aa  192  5e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0743  2,5-didehydrogluconate reductase  37.59 
 
 		 279 aa  192  5e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0311  aldo/keto reductase  39.63 
 
 		 267 aa  192  6e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2381  2,5-didehydrogluconate reductase  36.56 
 
 		 272 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308673  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1587  2,5-didehydrogluconate reductase  38.43 
 
 		 276 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0625741  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4205  2,5-didehydrogluconate reductase  39.3 
 
 		 279 aa  191  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2214  aldo/keto reductase  39.7 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4912  aldo/keto reductase  38.41 
 
 		 277 aa  188  9e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0232607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0519  2,5-didehydrogluconate reductase  37.74 
 
 		 275 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00901409  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6096  aldo/keto reductase  38.71 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1326  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  39.26 
 
 		 280 aa  187  2e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000298135  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1985  2,5-didehydrogluconate reductase  39.16 
 
 		 278 aa  187  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4225  oxidoreductase  36.26 
 
 		 276 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2108  aldo/keto reductase  37.32 
 
 		 282 aa  186  4e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2300  2,5-didehydrogluconate reductase  38.78 
 
 		 278 aa  185  7e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.109418 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0084  aldo/keto reductase  39.62 
 
 		 276 aa  185  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1360  2,5-didehydrogluconate reductase  38.95 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.603872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1378  2,5-didehydrogluconate reductase  38.95 
 
 		 282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1769  2,5-didehydrogluconate reductase  39.03 
 
 		 281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.904108  normal  0.360608 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0835  aldo/keto reductase  39.47 
 
 		 281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.600409 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7952  2,5-didehydrogluconate reductase  39.03 
 
 		 270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88249  Aldo/keto reductase  36.3 
 
 		 310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0901901  normal  0.089343 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>