More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3339 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3339  2,5-didehydrogluconate reductase  100 
 
 		 272 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3073  2,5-didehydrogluconate reductase  73.9 
 
 		 272 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4789  putative aldo/keto reductase  73.53 
 
 		 272 aa  432  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3571  aldo/keto reductase  73.06 
 
 		 277 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2432  2,5-didehydrogluconate reductase  72.43 
 
 		 272 aa  431  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812147  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2381  2,5-didehydrogluconate reductase  69.85 
 
 		 272 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308673  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0288  2,5-didehydrogluconate reductase  54.21 
 
 		 274 aa  308  5.9999999999999995e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.206569  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0580  aldo/keto reductase  49.27 
 
 		 275 aa  280  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2717  aldo/keto reductase  49.64 
 
 		 274 aa  275  5e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1167  aldo/keto reductase  47.66 
 
 		 277 aa  263  2e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.23428 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0368  aldo/keto reductase  47.78 
 
 		 279 aa  254  1.0000000000000001e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.67539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3052  aldo/keto reductase  45.42 
 
 		 274 aa  252  5.000000000000001e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1990  aldo/keto reductase  49.39 
 
 		 286 aa  249  4e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6096  aldo/keto reductase  47.64 
 
 		 268 aa  247  1e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0556  aldo/keto reductase  47.06 
 
 		 277 aa  246  2e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2929  aldo/keto reductase  45.05 
 
 		 274 aa  242  6e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1306  aldo/keto reductase  44.32 
 
 		 274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2108  aldo/keto reductase  44.4 
 
 		 282 aa  229  4e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2445  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.96 
 
 		 273 aa  221  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0904  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  44.36 
 
 		 267 aa  218  7.999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1329  aldo/keto reductase  39.19 
 
 		 274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245506  normal  0.195487 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5283  aldo/keto reductase  40.73 
 
 		 282 aa  215  7e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0154862 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1316  aldo/keto reductase  43.4 
 
 		 271 aa  214  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.904393  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5116  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.26 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745449  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4776  aldo/keto reductase  41.03 
 
 		 274 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02282  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.62 
 
 		 267 aa  212  4.9999999999999996e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0210  aldo/keto reductase  41.13 
 
 		 268 aa  211  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1865  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  41.35 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3895  aldo/keto reductase  39.93 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.216872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0287  2,5-didehydrogluconate reductase  42.86 
 
 		 277 aa  209  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.941845 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2306  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  41.35 
 
 		 268 aa  206  4e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0833333  hitchhiker  0.000000150497 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0672  aldo/keto reductase  39.92 
 
 		 280 aa  206  4e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851781  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0068  aldo/keto reductase  42.26 
 
 		 267 aa  205  6e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3351  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  41.13 
 
 		 268 aa  205  7e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0904766 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0519  2,5-didehydrogluconate reductase  42.4 
 
 		 275 aa  204  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00901409  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1154  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  41.89 
 
 		 283 aa  204  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.254496  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2695  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.98 
 
 		 268 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2042  aldo/keto reductase  38.08 
 
 		 280 aa  203  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0240  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.45 
 
 		 268 aa  202  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1380  2,5-didehydrogluconate reductase  41.2 
 
 		 275 aa  202  4e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1501  2,5-didehydrogluconate reductase  40.16 
 
 		 274 aa  202  5e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02792  probable oxidoreductase  40.14 
 
 		 278 aa  202  6e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1880  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.38 
 
 		 267 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0578  aldo/keto reductase  40.08 
 
 		 276 aa  201  8e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.113038  normal  0.346661 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1048  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.62 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00311623  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4912  aldo/keto reductase  39.11 
 
 		 277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0232607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4134  aldo/keto reductase  38.26 
 
 		 273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0422  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  41.89 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495467  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1101  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.62 
 
 		 267 aa  199  3e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1975  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.62 
 
 		 267 aa  199  3e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  0.128704 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3327  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.62 
 
 		 267 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4858  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.7 
 
 		 268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5450  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.7 
 
 		 268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5412  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.7 
 
 		 268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948984  decreased coverage  0.00302815 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0222  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  38.49 
 
 		 267 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0705129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2153  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  41.13 
 
 		 268 aa  199  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2368  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.62 
 
 		 267 aa  198  6e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0204  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  38.49 
 
 		 267 aa  199  6e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5364  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40 
 
 		 267 aa  198  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0299  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  38.49 
 
 		 274 aa  198  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3458  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  38.49 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.412559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2228  aldo/keto reductase  38.06 
 
 		 274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0945  aldo/keto reductase  38.4 
 
 		 273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0211  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  38.11 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0362263  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00200  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  38.49 
 
 		 267 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148488  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3671  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.58 
 
 		 274 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  0.0165196 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0220  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  38.87 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.167357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0213  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  38.49 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0554444  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2232  aldo/keto reductase  38.2 
 
 		 274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00205  hypothetical protein  38.49 
 
 		 267 aa  196  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.125752  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2041  aldo/keto reductase  39.36 
 
 		 272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.962738  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2058  aldo/keto reductase  38.58 
 
 		 274 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3401  aldo/keto reductase  38.49 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4697  2,5-didehydrogluconate reductase  38.87 
 
 		 282 aa  196  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.973362  normal  0.111177 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5298  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  38.58 
 
 		 268 aa  196  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.222173 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09980  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.6 
 
 		 272 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00527099  normal  0.878507 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2522  2,5-didehydrogluconate reductase  36.29 
 
 		 273 aa  195  6e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0538132  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0285  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  38.11 
 
 		 274 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4753  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  38.58 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10147  normal  0.725846 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0925  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.7 
 
 		 272 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38150  Aldo/keto reductase  39.64 
 
 		 277 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.451685  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1180  aldo/keto reductase  38.11 
 
 		 267 aa  193  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0293  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  37.74 
 
 		 274 aa  192  7e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.896057 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3984  aldo/keto reductase  38.37 
 
 		 277 aa  191  9e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4207  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  40.52 
 
 		 275 aa  191  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3899  aldo/keto reductase  41.79 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.986138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2796  2,5-didehydrogluconate reductase  40.32 
 
 		 275 aa  189  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0278  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  37.74 
 
 		 267 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4225  oxidoreductase  37.6 
 
 		 276 aa  189  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4121  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  40.52 
 
 		 275 aa  188  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000119845 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4006  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.52 
 
 		 275 aa  188  9e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000973326  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3839  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.52 
 
 		 275 aa  188  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4319  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.52 
 
 		 275 aa  188  9e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4230  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  40.15 
 
 		 275 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1394  2,5-didehydrogluconate reductase  39.77 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3853  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.15 
 
 		 312 aa  186  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230626  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03276  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  41.53 
 
 		 246 aa  186  3e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1360  2,5-didehydrogluconate reductase  38.87 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.603872  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3599  aldo/keto reductase  38.87 
 
 		 280 aa  186  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1378  2,5-didehydrogluconate reductase  38.87 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>