More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4912 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4912  aldo/keto reductase  100 
 
 		 277 aa  567  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0232607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38150  Aldo/keto reductase  67.75 
 
 		 277 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.451685  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2228  aldo/keto reductase  68.25 
 
 		 274 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3671  aldo/keto reductase family oxidoreductase  67.88 
 
 		 274 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  0.0165196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2058  aldo/keto reductase  67.52 
 
 		 274 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2232  aldo/keto reductase  67.52 
 
 		 274 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3895  aldo/keto reductase  55.76 
 
 		 274 aa  311  4.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.216872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4776  aldo/keto reductase  53.53 
 
 		 274 aa  309  4e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1306  aldo/keto reductase  53.53 
 
 		 274 aa  308  5e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1329  aldo/keto reductase  52.42 
 
 		 274 aa  305  6e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245506  normal  0.195487 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2445  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  53.9 
 
 		 273 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0288  2,5-didehydrogluconate reductase  43.75 
 
 		 274 aa  238  9e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.206569  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6096  aldo/keto reductase  44.32 
 
 		 268 aa  214  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0672  aldo/keto reductase  42.53 
 
 		 280 aa  212  5.999999999999999e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851781  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0578  aldo/keto reductase  43.35 
 
 		 276 aa  211  9e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.113038  normal  0.346661 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1316  aldo/keto reductase  43.02 
 
 		 271 aa  211  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.904393  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2432  2,5-didehydrogluconate reductase  39.71 
 
 		 272 aa  207  1e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812147  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3571  aldo/keto reductase  42.28 
 
 		 277 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4789  putative aldo/keto reductase  40.96 
 
 		 272 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0311  aldo/keto reductase  42.21 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2848  aldo/keto reductase  41.22 
 
 		 267 aa  202  4e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02282  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  41.73 
 
 		 267 aa  202  7e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1167  aldo/keto reductase  41.25 
 
 		 277 aa  201  9e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.23428 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3339  2,5-didehydrogluconate reductase  39.11 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2042  aldo/keto reductase  40.61 
 
 		 280 aa  199  3e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2108  aldo/keto reductase  37.83 
 
 		 282 aa  199  3.9999999999999996e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2214  aldo/keto reductase  41.38 
 
 		 268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3073  2,5-didehydrogluconate reductase  40.96 
 
 		 272 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0299  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.42 
 
 		 274 aa  198  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0285  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.05 
 
 		 274 aa  198  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2368  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  41.42 
 
 		 267 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3327  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  41.04 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2381  2,5-didehydrogluconate reductase  40.22 
 
 		 272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308673  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0068  aldo/keto reductase  44.15 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0580  aldo/keto reductase  37.59 
 
 		 275 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0945  aldo/keto reductase  43.02 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3408  aldo/keto reductase  43.51 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.174673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0293  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  38.69 
 
 		 274 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.896057 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1990  aldo/keto reductase  43.03 
 
 		 286 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1975  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.67 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  0.128704 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0222  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.18 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0705129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0213  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.18 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0554444  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0287  2,5-didehydrogluconate reductase  40.6 
 
 		 277 aa  194  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.941845 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3458  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  38.81 
 
 		 267 aa  193  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.412559  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00200  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  38.81 
 
 		 267 aa  193  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148488  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3401  aldo/keto reductase  39.18 
 
 		 267 aa  193  3e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0211  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.18 
 
 		 267 aa  193  3e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0362263  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00205  hypothetical protein  38.81 
 
 		 267 aa  193  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.125752  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0204  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  38.81 
 
 		 267 aa  192  7e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0220  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  38.43 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.167357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0278  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  38.81 
 
 		 267 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0280  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.05 
 
 		 274 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1880  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.93 
 
 		 267 aa  188  8e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0968  aldo/keto reductase  41.15 
 
 		 274 aa  188  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02792  probable oxidoreductase  38.41 
 
 		 278 aa  188  9e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0009  aldo/keto reductase  40.24 
 
 		 254 aa  187  2e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.415825  normal  0.702209 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5364  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.67 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0556  aldo/keto reductase  39.76 
 
 		 277 aa  187  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1048  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  38.81 
 
 		 267 aa  186  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00311623  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1154  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  38.43 
 
 		 283 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.254496  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1101  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  38.43 
 
 		 267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0925  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.07 
 
 		 272 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09980  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.85 
 
 		 272 aa  182  7e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00527099  normal  0.878507 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1769  2,5-didehydrogluconate reductase  38.01 
 
 		 281 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.904108  normal  0.360608 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5116  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.18 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745449  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2153  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.07 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4134  aldo/keto reductase  38.64 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3351  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  38.35 
 
 		 268 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0904766 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0240  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.1 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2717  aldo/keto reductase  37.36 
 
 		 274 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2695  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  38.72 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0612  aldo/keto reductase  41.51 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293395  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0422  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.7 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495467  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1865  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  36.94 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0368  aldo/keto reductase  37.88 
 
 		 279 aa  177  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.67539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1380  2,5-didehydrogluconate reductase  38.85 
 
 		 275 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3013  2,5-didehydrogluconate reductase  36.26 
 
 		 276 aa  176  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.856221  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3899  aldo/keto reductase  39.63 
 
 		 269 aa  176  5e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.986138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4753  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  38.2 
 
 		 268 aa  176  5e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10147  normal  0.725846 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4858  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  37.59 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5450  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  37.59 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0084  aldo/keto reductase  41.22 
 
 		 276 aa  174  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5412  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  37.59 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948984  decreased coverage  0.00302815 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5298  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  37.08 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.222173 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3052  aldo/keto reductase  37.5 
 
 		 274 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0904  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  38.06 
 
 		 267 aa  174  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0519  2,5-didehydrogluconate reductase  37.13 
 
 		 275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00901409  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7952  2,5-didehydrogluconate reductase  39.25 
 
 		 270 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2581  2,5-didehydrogluconate reductase  37.4 
 
 		 282 aa  172  5e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0848  Aldehyde reductase  36.94 
 
 		 274 aa  172  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03276  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.27 
 
 		 246 aa  172  6.999999999999999e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1394  2,5-didehydrogluconate reductase  35.79 
 
 		 282 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2741  aldo/keto reductase  39.67 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2306  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  37.59 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0833333  hitchhiker  0.000000150497 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4697  2,5-didehydrogluconate reductase  35.79 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.973362  normal  0.111177 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2953  aldo/keto reductase  41.15 
 
 		 273 aa  171  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1360  2,5-didehydrogluconate reductase  35.42 
 
 		 282 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.603872  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3599  aldo/keto reductase  37.59 
 
 		 280 aa  170  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1378  2,5-didehydrogluconate reductase  35.42 
 
 		 282 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0183  aldo/keto reductase family oxidoreductase  35.88 
 
 		 275 aa  170  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>