More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4134 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4134  aldo/keto reductase  100 
 
 		 273 aa  570  1e-161  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02282  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  53.99 
 
 		 267 aa  308  9e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1316  aldo/keto reductase  53.03 
 
 		 271 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.904393  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1154  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  50.19 
 
 		 283 aa  280  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.254496  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3599  aldo/keto reductase  50.57 
 
 		 280 aa  276  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0210  aldo/keto reductase  49.62 
 
 		 268 aa  273  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0287  2,5-didehydrogluconate reductase  46.89 
 
 		 277 aa  271  8.000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.941845 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2306  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  49.24 
 
 		 268 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0833333  hitchhiker  0.000000150497 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2695  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  49.24 
 
 		 268 aa  268  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02792  probable oxidoreductase  48.69 
 
 		 278 aa  264  1e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3351  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  48.86 
 
 		 268 aa  263  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0904766 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0904  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  47.17 
 
 		 267 aa  261  1e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0204  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.83 
 
 		 267 aa  260  2e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00200  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.83 
 
 		 267 aa  259  3e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148488  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3327  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  47.17 
 
 		 267 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00205  hypothetical protein  45.83 
 
 		 267 aa  259  3e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.125752  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2368  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  47.55 
 
 		 267 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0068  aldo/keto reductase  48.29 
 
 		 267 aa  258  8e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0240  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  47.73 
 
 		 268 aa  257  1e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3458  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.45 
 
 		 267 aa  257  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.412559  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3401  aldo/keto reductase  45.45 
 
 		 267 aa  256  3e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0220  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.45 
 
 		 267 aa  256  4e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.167357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0945  aldo/keto reductase  45.99 
 
 		 273 aa  255  5e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0299  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.28 
 
 		 274 aa  255  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0211  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.08 
 
 		 267 aa  255  5e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0362263  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0213  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  44.7 
 
 		 267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0554444  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0222  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  44.7 
 
 		 267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0705129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1880  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  47.17 
 
 		 267 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0278  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.63 
 
 		 267 aa  253  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1975  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  47.17 
 
 		 267 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  0.128704 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5298  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  46.97 
 
 		 268 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.222173 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0285  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  44.91 
 
 		 274 aa  252  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5364  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  47.55 
 
 		 267 aa  252  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0293  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.28 
 
 		 274 aa  251  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.896057 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4753  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  47.35 
 
 		 268 aa  251  6e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10147  normal  0.725846 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4858  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  47.35 
 
 		 268 aa  251  7e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5450  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  47.35 
 
 		 268 aa  251  7e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5412  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  47.35 
 
 		 268 aa  251  7e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948984  decreased coverage  0.00302815 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0422  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  46.97 
 
 		 268 aa  251  7e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495467  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1048  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  46.42 
 
 		 267 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00311623  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1101  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  46.42 
 
 		 267 aa  251  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2153  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  46.59 
 
 		 268 aa  249  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5116  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  46.42 
 
 		 267 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745449  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09980  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.83 
 
 		 272 aa  246  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00527099  normal  0.878507 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0280  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.28 
 
 		 274 aa  243  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3899  aldo/keto reductase  47.19 
 
 		 269 aa  242  3.9999999999999997e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.986138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1865  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.02 
 
 		 267 aa  241  7e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03276  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  46.12 
 
 		 246 aa  238  5.999999999999999e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0925  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.77 
 
 		 272 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1180  aldo/keto reductase  44.15 
 
 		 267 aa  236  3e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0288  2,5-didehydrogluconate reductase  41.73 
 
 		 274 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.206569  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4789  putative aldo/keto reductase  40.91 
 
 		 272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0580  aldo/keto reductase  41.3 
 
 		 275 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1306  aldo/keto reductase  40.91 
 
 		 274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2042  aldo/keto reductase  38.27 
 
 		 280 aa  212  3.9999999999999995e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1167  aldo/keto reductase  42.63 
 
 		 277 aa  212  5.999999999999999e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.23428 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0578  aldo/keto reductase  39.27 
 
 		 276 aa  211  1e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.113038  normal  0.346661 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0672  aldo/keto reductase  39.35 
 
 		 280 aa  207  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851781  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2717  aldo/keto reductase  40.58 
 
 		 274 aa  207  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2108  aldo/keto reductase  40.79 
 
 		 282 aa  207  2e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2041  aldo/keto reductase  42.19 
 
 		 272 aa  205  6e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.962738  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2432  2,5-didehydrogluconate reductase  37.88 
 
 		 272 aa  203  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812147  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3984  aldo/keto reductase  40.94 
 
 		 277 aa  202  6e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2214  aldo/keto reductase  41.35 
 
 		 268 aa  201  9.999999999999999e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6096  aldo/keto reductase  39.77 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3339  2,5-didehydrogluconate reductase  38.26 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0612  aldo/keto reductase  42.8 
 
 		 268 aa  199  5e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293395  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2381  2,5-didehydrogluconate reductase  37.88 
 
 		 272 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308673  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3571  aldo/keto reductase  39.02 
 
 		 277 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3895  aldo/keto reductase  39.05 
 
 		 274 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.216872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0009  aldo/keto reductase  41.96 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.415825  normal  0.702209 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3073  2,5-didehydrogluconate reductase  36.74 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2058  aldo/keto reductase  38.26 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4776  aldo/keto reductase  39.02 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2228  aldo/keto reductase  38.64 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38150  Aldo/keto reductase  38.49 
 
 		 277 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.451685  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2232  aldo/keto reductase  37.88 
 
 		 274 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3052  aldo/keto reductase  37.82 
 
 		 274 aa  189  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1329  aldo/keto reductase  37.59 
 
 		 274 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245506  normal  0.195487 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2796  2,5-didehydrogluconate reductase  39.92 
 
 		 275 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30490  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  44.31 
 
 		 282 aa  188  7e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3671  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.26 
 
 		 274 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  0.0165196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0368  aldo/keto reductase  39.47 
 
 		 279 aa  187  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.67539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1501  2,5-didehydrogluconate reductase  39.46 
 
 		 274 aa  188  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0861  aldo/keto reductase  39.55 
 
 		 274 aa  186  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.274237  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02540  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  40.23 
 
 		 279 aa  186  4e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.935575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0519  2,5-didehydrogluconate reductase  39.23 
 
 		 275 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00901409  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4225  oxidoreductase  36.68 
 
 		 276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2953  aldo/keto reductase  37.45 
 
 		 273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0265  aldo/keto reductase  39.69 
 
 		 281 aa  182  7e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1990  aldo/keto reductase  38.49 
 
 		 286 aa  181  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4912  aldo/keto reductase  38.64 
 
 		 277 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0232607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0082  aldo/keto reductase  39.77 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4207  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  41.94 
 
 		 275 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0491  aldo/keto reductase  39.39 
 
 		 273 aa  179  4.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.333273 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0858  aldo/keto reductase  38.4 
 
 		 279 aa  179  4.999999999999999e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1030  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  41.94 
 
 		 275 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1380  2,5-didehydrogluconate reductase  38.08 
 
 		 275 aa  178  7e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0311  aldo/keto reductase  37.88 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3408  aldo/keto reductase  38.87 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.174673  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>