More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0210 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0210  aldo/keto reductase  100 
 
 		 268 aa  553  1e-156  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3599  aldo/keto reductase  62.92 
 
 		 280 aa  359  3e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2695  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  54.48 
 
 		 268 aa  295  4e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02792  probable oxidoreductase  54.07 
 
 		 278 aa  295  6e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1865  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  53.76 
 
 		 267 aa  293  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3899  aldo/keto reductase  57.46 
 
 		 269 aa  292  3e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.986138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2306  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  52.24 
 
 		 268 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0833333  hitchhiker  0.000000150497 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1316  aldo/keto reductase  50 
 
 		 271 aa  285  7e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.904393  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0068  aldo/keto reductase  54.31 
 
 		 267 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1154  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  53.38 
 
 		 283 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.254496  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3351  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  51.87 
 
 		 268 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0904766 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0240  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  52.24 
 
 		 268 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0904  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  51.13 
 
 		 267 aa  281  7.000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2153  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  51.12 
 
 		 268 aa  279  4e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0422  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  51.12 
 
 		 268 aa  277  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495467  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3327  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  51.13 
 
 		 267 aa  276  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2368  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  51.13 
 
 		 267 aa  275  5e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02282  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  47.57 
 
 		 267 aa  274  1.0000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4134  aldo/keto reductase  49.62 
 
 		 273 aa  273  3e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3401  aldo/keto reductase  49.06 
 
 		 267 aa  270  1e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1101  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  50 
 
 		 267 aa  270  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1975  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  50.38 
 
 		 267 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  0.128704 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1048  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  50 
 
 		 267 aa  270  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00311623  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0204  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  49.06 
 
 		 267 aa  270  2e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3458  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  49.06 
 
 		 267 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.412559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5116  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  50.75 
 
 		 267 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745449  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5450  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  50 
 
 		 268 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5412  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  50 
 
 		 268 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948984  decreased coverage  0.00302815 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4858  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  50 
 
 		 268 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1880  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  50 
 
 		 267 aa  268  7e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0220  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  49.06 
 
 		 267 aa  268  8e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.167357  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00200  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  48.68 
 
 		 267 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148488  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00205  hypothetical protein  48.68 
 
 		 267 aa  268  8.999999999999999e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.125752  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0299  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  48.87 
 
 		 274 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0293  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  48.87 
 
 		 274 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.896057 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5298  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  49.25 
 
 		 268 aa  267  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.222173 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0213  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  48.68 
 
 		 267 aa  266  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0554444  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4753  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  49.63 
 
 		 268 aa  267  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10147  normal  0.725846 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0222  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  48.3 
 
 		 267 aa  265  5e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0705129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0287  2,5-didehydrogluconate reductase  49.06 
 
 		 277 aa  265  7e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.941845 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0211  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  48.3 
 
 		 267 aa  264  8.999999999999999e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0362263  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0280  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  49.25 
 
 		 274 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0925  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  49.62 
 
 		 272 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5364  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  49.62 
 
 		 267 aa  262  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0285  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  48.12 
 
 		 274 aa  262  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03276  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  54.32 
 
 		 246 aa  261  8.999999999999999e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09980  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  48.3 
 
 		 272 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00527099  normal  0.878507 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0278  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  48.65 
 
 		 267 aa  258  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1180  aldo/keto reductase  49.62 
 
 		 267 aa  258  9e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0945  aldo/keto reductase  49.06 
 
 		 273 aa  253  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0580  aldo/keto reductase  44.03 
 
 		 275 aa  216  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0288  2,5-didehydrogluconate reductase  41.95 
 
 		 274 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.206569  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3339  2,5-didehydrogluconate reductase  41.13 
 
 		 272 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0578  aldo/keto reductase  41.67 
 
 		 276 aa  210  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.113038  normal  0.346661 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2717  aldo/keto reductase  42.7 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1306  aldo/keto reductase  41.89 
 
 		 274 aa  209  4e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2432  2,5-didehydrogluconate reductase  39.25 
 
 		 272 aa  208  6e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812147  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4789  putative aldo/keto reductase  40.38 
 
 		 272 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2108  aldo/keto reductase  41.33 
 
 		 282 aa  206  3e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2042  aldo/keto reductase  40.08 
 
 		 280 aa  206  4e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1329  aldo/keto reductase  41.57 
 
 		 274 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245506  normal  0.195487 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0672  aldo/keto reductase  40.08 
 
 		 280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851781  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3895  aldo/keto reductase  39.85 
 
 		 274 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.216872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3052  aldo/keto reductase  42.16 
 
 		 274 aa  198  9e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2214  aldo/keto reductase  41.42 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4776  aldo/keto reductase  40.82 
 
 		 274 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1167  aldo/keto reductase  41.43 
 
 		 277 aa  195  6e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.23428 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0311  aldo/keto reductase  41.15 
 
 		 267 aa  195  6e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3073  2,5-didehydrogluconate reductase  37.74 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2929  aldo/keto reductase  41.2 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2522  2,5-didehydrogluconate reductase  37.35 
 
 		 273 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0538132  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2058  aldo/keto reductase  40.6 
 
 		 274 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3214  2,5-didehydrogluconate reductase  40.54 
 
 		 280 aa  189  4e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00515928  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0084  aldo/keto reductase  42.86 
 
 		 276 aa  188  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30490  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  42.02 
 
 		 282 aa  188  9e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0183  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.83 
 
 		 275 aa  188  9e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3671  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.6 
 
 		 274 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  0.0165196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2228  aldo/keto reductase  39.85 
 
 		 274 aa  185  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3013  2,5-didehydrogluconate reductase  39.62 
 
 		 276 aa  184  9e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.856221  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2953  aldo/keto reductase  40.3 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3571  aldo/keto reductase  38.49 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06660  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  39.85 
 
 		 277 aa  182  5.0000000000000004e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38150  Aldo/keto reductase  38.72 
 
 		 277 aa  182  5.0000000000000004e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.451685  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0968  aldo/keto reductase  41.09 
 
 		 274 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7952  2,5-didehydrogluconate reductase  40.82 
 
 		 270 aa  182  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4383  aldo/keto reductase  41.15 
 
 		 283 aa  182  6e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0519  2,5-didehydrogluconate reductase  39.47 
 
 		 275 aa  182  6e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00901409  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0164  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.96 
 
 		 357 aa  182  7e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.432724  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2381  2,5-didehydrogluconate reductase  36.23 
 
 		 272 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308673  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3839  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.75 
 
 		 275 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4006  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.38 
 
 		 275 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000973326  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3853  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.38 
 
 		 312 aa  180  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4319  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.38 
 
 		 275 aa  180  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4121  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  40.38 
 
 		 275 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000119845 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4230  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  40.38 
 
 		 275 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2232  aldo/keto reductase  39.1 
 
 		 274 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0181  2,5-didehydrogluconate reductase  39.16 
 
 		 277 aa  179  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0197  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.78 
 
 		 277 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0216  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  38.78 
 
 		 277 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0196  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.78 
 
 		 277 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>