More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2058 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2058  aldo/keto reductase  100 
 
 		 274 aa  551  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3671  aldo/keto reductase family oxidoreductase  97.81 
 
 		 274 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  0.0165196 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2228  aldo/keto reductase  95.26 
 
 		 274 aa  527  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2232  aldo/keto reductase  87.59 
 
 		 274 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4912  aldo/keto reductase  67.52 
 
 		 277 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0232607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38150  Aldo/keto reductase  67.4 
 
 		 277 aa  364  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.451685  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1306  aldo/keto reductase  55.97 
 
 		 274 aa  313  9.999999999999999e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3895  aldo/keto reductase  55.22 
 
 		 274 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.216872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1329  aldo/keto reductase  53.11 
 
 		 274 aa  301  6.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245506  normal  0.195487 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4776  aldo/keto reductase  52.38 
 
 		 274 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2445  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  54.72 
 
 		 273 aa  281  8.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0288  2,5-didehydrogluconate reductase  45.62 
 
 		 274 aa  236  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.206569  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0578  aldo/keto reductase  43.22 
 
 		 276 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.113038  normal  0.346661 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2214  aldo/keto reductase  46.01 
 
 		 268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0672  aldo/keto reductase  43.07 
 
 		 280 aa  218  1e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851781  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6096  aldo/keto reductase  45.42 
 
 		 268 aa  215  5e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2432  2,5-didehydrogluconate reductase  41.2 
 
 		 272 aa  211  7e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812147  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0580  aldo/keto reductase  40.22 
 
 		 275 aa  211  7.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0068  aldo/keto reductase  46.79 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3571  aldo/keto reductase  41.95 
 
 		 277 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1167  aldo/keto reductase  43.09 
 
 		 277 aa  207  1e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.23428 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2042  aldo/keto reductase  41.83 
 
 		 280 aa  206  4e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3073  2,5-didehydrogluconate reductase  41.73 
 
 		 272 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1154  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.25 
 
 		 283 aa  203  2e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.254496  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4789  putative aldo/keto reductase  40.07 
 
 		 272 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2848  aldo/keto reductase  42.11 
 
 		 267 aa  201  8e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.677029 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3408  aldo/keto reductase  44.66 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.174673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1316  aldo/keto reductase  41.51 
 
 		 271 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.904393  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2381  2,5-didehydrogluconate reductase  40.23 
 
 		 272 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308673  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0299  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  38.69 
 
 		 274 aa  198  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1990  aldo/keto reductase  44 
 
 		 286 aa  198  7.999999999999999e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0293  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  38.69 
 
 		 274 aa  198  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.896057 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2108  aldo/keto reductase  37.83 
 
 		 282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0285  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  37.96 
 
 		 274 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3339  2,5-didehydrogluconate reductase  38.58 
 
 		 272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0240  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.91 
 
 		 268 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0287  2,5-didehydrogluconate reductase  43.61 
 
 		 277 aa  196  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.941845 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0311  aldo/keto reductase  42.21 
 
 		 267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5298  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  41.2 
 
 		 268 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.222173 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4753  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  41.57 
 
 		 268 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10147  normal  0.725846 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2368  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  41.42 
 
 		 267 aa  194  9e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3458  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  38.81 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.412559  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00200  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  38.81 
 
 		 267 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148488  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0556  aldo/keto reductase  42.17 
 
 		 277 aa  194  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00205  hypothetical protein  38.81 
 
 		 267 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.125752  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0213  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  38.81 
 
 		 267 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0554444  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1880  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  41.04 
 
 		 267 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5450  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  41.35 
 
 		 268 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1048  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  38.81 
 
 		 267 aa  193  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00311623  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5412  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  41.35 
 
 		 268 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948984  decreased coverage  0.00302815 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4858  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  41.35 
 
 		 268 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02282  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  37.97 
 
 		 267 aa  193  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3327  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.67 
 
 		 267 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0220  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  38.81 
 
 		 267 aa  192  4e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.167357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0278  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.23 
 
 		 267 aa  192  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0945  aldo/keto reductase  42.42 
 
 		 273 aa  192  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03276  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.51 
 
 		 246 aa  192  7e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0925  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  41.95 
 
 		 272 aa  191  8e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0222  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  38.06 
 
 		 267 aa  191  9e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0705129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0211  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  38.06 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0362263  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1101  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  38.43 
 
 		 267 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3351  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.23 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0904766 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4134  aldo/keto reductase  38.26 
 
 		 273 aa  191  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0280  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.05 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3401  aldo/keto reductase  38.43 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0009  aldo/keto reductase  42.91 
 
 		 254 aa  191  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.415825  normal  0.702209 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09980  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  41.35 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00527099  normal  0.878507 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2717  aldo/keto reductase  39.26 
 
 		 274 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0210  aldo/keto reductase  40.6 
 
 		 268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0204  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  38.06 
 
 		 267 aa  189  4e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2695  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.16 
 
 		 268 aa  189  5e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3052  aldo/keto reductase  39.48 
 
 		 274 aa  189  5e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1975  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.3 
 
 		 267 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  0.128704 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2306  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.6 
 
 		 268 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0833333  hitchhiker  0.000000150497 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1380  2,5-didehydrogluconate reductase  39.85 
 
 		 275 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0904  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.3 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0519  2,5-didehydrogluconate reductase  38.01 
 
 		 275 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00901409  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2041  aldo/keto reductase  42.86 
 
 		 272 aa  185  6e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.962738  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5116  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.55 
 
 		 267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745449  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5364  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.67 
 
 		 267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108532  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4166  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.15 
 
 		 275 aa  183  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3599  aldo/keto reductase  38.87 
 
 		 280 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3899  aldo/keto reductase  42.22 
 
 		 269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.986138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0968  aldo/keto reductase  40.78 
 
 		 274 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2522  2,5-didehydrogluconate reductase  33.7 
 
 		 273 aa  182  6e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0538132  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4006  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.77 
 
 		 275 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000973326  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3853  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.77 
 
 		 312 aa  181  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230626  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4319  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.77 
 
 		 275 aa  181  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1501  2,5-didehydrogluconate reductase  37.93 
 
 		 274 aa  181  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4121  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  39.77 
 
 		 275 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000119845 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0848  Aldehyde reductase  38.75 
 
 		 274 aa  181  1e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3839  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.77 
 
 		 275 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4207  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  39.77 
 
 		 275 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1180  aldo/keto reductase  39.55 
 
 		 267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3928  2,5-didehydrogluconate reductase  39.39 
 
 		 275 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0821638  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2153  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.85 
 
 		 268 aa  178  8e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2953  aldo/keto reductase  42.91 
 
 		 273 aa  178  9e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0422  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.85 
 
 		 268 aa  178  9e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495467  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2741  aldo/keto reductase  43.15 
 
 		 259 aa  178  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1030  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  39.39 
 
 		 275 aa  177  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>