More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0204 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0204  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  100 
 
 		 267 aa  546  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3401  aldo/keto reductase  99.25 
 
 		 267 aa  540  1e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3458  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  99.25 
 
 		 267 aa  541  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.412559  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00200  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  98.88 
 
 		 267 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148488  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0213  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  98.5 
 
 		 267 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0554444  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00205  hypothetical protein  98.88 
 
 		 267 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.125752  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0211  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  98.5 
 
 		 267 aa  538  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0362263  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0220  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  98.5 
 
 		 267 aa  537  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.167357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0222  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  98.5 
 
 		 267 aa  536  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0705129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0285  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  92.51 
 
 		 274 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0299  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  92.51 
 
 		 274 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0293  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  91.76 
 
 		 274 aa  501  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.896057 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0278  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  92.13 
 
 		 267 aa  502  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0280  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  91.39 
 
 		 274 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0904  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  76.4 
 
 		 267 aa  414  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1048  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  75.66 
 
 		 267 aa  408  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00311623  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1101  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  75.28 
 
 		 267 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1865  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  70.41 
 
 		 267 aa  387  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2695  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  69.06 
 
 		 268 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3327  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.79 
 
 		 267 aa  371  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0240  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  68.68 
 
 		 268 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2306  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.55 
 
 		 268 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0833333  hitchhiker  0.000000150497 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5364  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.79 
 
 		 267 aa  373  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108532  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2368  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.42 
 
 		 267 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1975  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.79 
 
 		 267 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  0.128704 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3351  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.92 
 
 		 268 aa  367  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0904766 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2153  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  65.79 
 
 		 268 aa  364  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5450  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.55 
 
 		 268 aa  363  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5412  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.55 
 
 		 268 aa  363  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948984  decreased coverage  0.00302815 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4858  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.55 
 
 		 268 aa  363  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5116  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  66.67 
 
 		 267 aa  363  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745449  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1880  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.04 
 
 		 267 aa  362  3e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0945  aldo/keto reductase  67.17 
 
 		 273 aa  362  4e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0422  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  65.41 
 
 		 268 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495467  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0925  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  65.41 
 
 		 272 aa  361  8e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5298  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  66.42 
 
 		 268 aa  361  8e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.222173 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4753  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  66.79 
 
 		 268 aa  360  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10147  normal  0.725846 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09980  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  65.28 
 
 		 272 aa  360  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00527099  normal  0.878507 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1154  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  63.4 
 
 		 283 aa  357  9e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.254496  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1180  aldo/keto reductase  63.3 
 
 		 267 aa  350  2e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0287  2,5-didehydrogluconate reductase  62.26 
 
 		 277 aa  348  5e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.941845 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3899  aldo/keto reductase  65.43 
 
 		 269 aa  344  7e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.986138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03276  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  62.6 
 
 		 246 aa  328  8e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0068  aldo/keto reductase  62.26 
 
 		 267 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02792  probable oxidoreductase  54.28 
 
 		 278 aa  296  3e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1316  aldo/keto reductase  52.45 
 
 		 271 aa  286  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.904393  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02282  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  49.81 
 
 		 267 aa  276  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0210  aldo/keto reductase  49.06 
 
 		 268 aa  270  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3599  aldo/keto reductase  50.38 
 
 		 280 aa  270  2e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4134  aldo/keto reductase  45.83 
 
 		 273 aa  260  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1306  aldo/keto reductase  45.52 
 
 		 274 aa  238  5.999999999999999e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2717  aldo/keto reductase  44.19 
 
 		 274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0580  aldo/keto reductase  42.7 
 
 		 275 aa  215  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3052  aldo/keto reductase  43.61 
 
 		 274 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0288  2,5-didehydrogluconate reductase  42.01 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.206569  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4789  putative aldo/keto reductase  40.38 
 
 		 272 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4776  aldo/keto reductase  41.73 
 
 		 274 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3073  2,5-didehydrogluconate reductase  39.85 
 
 		 272 aa  203  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3571  aldo/keto reductase  40.75 
 
 		 277 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06660  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  43.24 
 
 		 277 aa  202  5e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3895  aldo/keto reductase  38.81 
 
 		 274 aa  201  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.216872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0968  aldo/keto reductase  41.47 
 
 		 274 aa  201  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2929  aldo/keto reductase  42.7 
 
 		 274 aa  202  7e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0578  aldo/keto reductase  40.23 
 
 		 276 aa  201  9.999999999999999e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.113038  normal  0.346661 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1329  aldo/keto reductase  39.47 
 
 		 274 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245506  normal  0.195487 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2432  2,5-didehydrogluconate reductase  37.59 
 
 		 272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812147  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3339  2,5-didehydrogluconate reductase  38.49 
 
 		 272 aa  199  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2232  aldo/keto reductase  40.3 
 
 		 274 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2445  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.11 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30490  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  42.52 
 
 		 282 aa  193  2e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2381  2,5-didehydrogluconate reductase  37.64 
 
 		 272 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308673  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1167  aldo/keto reductase  40.24 
 
 		 277 aa  193  3e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.23428 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1587  2,5-didehydrogluconate reductase  41.18 
 
 		 276 aa  192  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0625741  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0861  aldo/keto reductase  39.92 
 
 		 274 aa  192  4e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.274237  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6096  aldo/keto reductase  40.6 
 
 		 268 aa  192  6e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4225  oxidoreductase  38.31 
 
 		 276 aa  192  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4912  aldo/keto reductase  38.81 
 
 		 277 aa  192  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0232607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2228  aldo/keto reductase  38.43 
 
 		 274 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0586  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  42.19 
 
 		 275 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0272  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  41.8 
 
 		 277 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2058  aldo/keto reductase  38.06 
 
 		 274 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0667  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  41.41 
 
 		 277 aa  189  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2042  aldo/keto reductase  38.26 
 
 		 280 aa  188  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3534  2,5-didehydrogluconate reductase  37.84 
 
 		 272 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  0.675115 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2522  2,5-didehydrogluconate reductase  38.7 
 
 		 273 aa  187  1e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0538132  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3671  aldo/keto reductase family oxidoreductase  37.69 
 
 		 274 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  0.0165196 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0343  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  39.23 
 
 		 275 aa  187  2e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1420  2,5-didehydrogluconate reductase  40.42 
 
 		 274 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.917399  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0672  aldo/keto reductase  37.69 
 
 		 280 aa  186  3e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851781  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0519  2,5-didehydrogluconate reductase  38.52 
 
 		 275 aa  186  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00901409  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2108  aldo/keto reductase  38.66 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0336  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  39.23 
 
 		 275 aa  186  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0727  2,5-didehydrogluconate reductase  36.61 
 
 		 279 aa  185  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0743  2,5-didehydrogluconate reductase  36.61 
 
 		 279 aa  185  8e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7952  2,5-didehydrogluconate reductase  40.47 
 
 		 270 aa  184  9e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4086  aldo/keto reductase  38.61 
 
 		 276 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.968066 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02885  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  38.67 
 
 		 275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0687  2,5-didehydrogluconate reductase  38.67 
 
 		 275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0684  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  38.67 
 
 		 275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3761  2,5-didehydrogluconate reductase  37.55 
 
 		 276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>