More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0280 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A0280  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  100 
 
 		 274 aa  558  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0293  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  99.64 
 
 		 274 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.896057 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0285  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  97.08 
 
 		 274 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0299  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  97.08 
 
 		 274 aa  541  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0278  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  97.38 
 
 		 267 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0213  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  91.76 
 
 		 267 aa  501  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0554444  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3458  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  91.39 
 
 		 267 aa  500  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.412559  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00200  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  91.01 
 
 		 267 aa  498  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148488  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3401  aldo/keto reductase  91.39 
 
 		 267 aa  498  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0204  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  91.39 
 
 		 267 aa  499  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0220  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  91.39 
 
 		 267 aa  498  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.167357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0222  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  91.01 
 
 		 267 aa  498  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0705129  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00205  hypothetical protein  91.01 
 
 		 267 aa  498  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.125752  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0211  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  90.64 
 
 		 267 aa  496  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0362263  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0904  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  75.66 
 
 		 267 aa  411  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1048  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  74.16 
 
 		 267 aa  399  9.999999999999999e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00311623  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1101  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  73.78 
 
 		 267 aa  396  1e-109  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1865  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  68.91 
 
 		 267 aa  377  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1975  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  68.91 
 
 		 267 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  0.128704 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3327  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  68.16 
 
 		 267 aa  374  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0240  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  69.43 
 
 		 268 aa  375  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5364  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  68.16 
 
 		 267 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2695  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  69.06 
 
 		 268 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2368  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.79 
 
 		 267 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1880  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  68.16 
 
 		 267 aa  372  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4858  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  68.68 
 
 		 268 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5450  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  68.68 
 
 		 268 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09980  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.55 
 
 		 272 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00527099  normal  0.878507 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0925  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.29 
 
 		 272 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5412  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  68.68 
 
 		 268 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948984  decreased coverage  0.00302815 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5298  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.17 
 
 		 268 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.222173 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2306  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.17 
 
 		 268 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0833333  hitchhiker  0.000000150497 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4753  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.55 
 
 		 268 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10147  normal  0.725846 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3351  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  68.3 
 
 		 268 aa  367  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0904766 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2153  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  66.42 
 
 		 268 aa  363  2e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5116  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  66.67 
 
 		 267 aa  359  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745449  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0422  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  66.04 
 
 		 268 aa  358  5e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495467  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1154  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  63.57 
 
 		 283 aa  358  6e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.254496  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0945  aldo/keto reductase  66.42 
 
 		 273 aa  354  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0287  2,5-didehydrogluconate reductase  64.53 
 
 		 277 aa  354  1e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.941845 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1180  aldo/keto reductase  62.92 
 
 		 267 aa  346  2e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3899  aldo/keto reductase  64.68 
 
 		 269 aa  336  2.9999999999999997e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.986138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0068  aldo/keto reductase  61.89 
 
 		 267 aa  321  7e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03276  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  61.79 
 
 		 246 aa  316  3e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02792  probable oxidoreductase  51.09 
 
 		 278 aa  284  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02282  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  49.81 
 
 		 267 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1316  aldo/keto reductase  50.19 
 
 		 271 aa  271  6e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.904393  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0210  aldo/keto reductase  49.25 
 
 		 268 aa  270  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3599  aldo/keto reductase  49.43 
 
 		 280 aa  266  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4134  aldo/keto reductase  45.28 
 
 		 273 aa  250  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1306  aldo/keto reductase  46.3 
 
 		 274 aa  246  4e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2717  aldo/keto reductase  45.02 
 
 		 274 aa  227  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0580  aldo/keto reductase  43.54 
 
 		 275 aa  221  9.999999999999999e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0288  2,5-didehydrogluconate reductase  42.44 
 
 		 274 aa  215  7e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.206569  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2232  aldo/keto reductase  41.24 
 
 		 274 aa  209  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3052  aldo/keto reductase  43.33 
 
 		 274 aa  209  4e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4776  aldo/keto reductase  41.91 
 
 		 274 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0578  aldo/keto reductase  41.79 
 
 		 276 aa  205  7e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.113038  normal  0.346661 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4789  putative aldo/keto reductase  39.78 
 
 		 272 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2228  aldo/keto reductase  39.05 
 
 		 274 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2929  aldo/keto reductase  43.98 
 
 		 274 aa  202  5e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3571  aldo/keto reductase  41.13 
 
 		 277 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1329  aldo/keto reductase  39.63 
 
 		 274 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245506  normal  0.195487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3895  aldo/keto reductase  38.89 
 
 		 274 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.216872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2432  2,5-didehydrogluconate reductase  36.8 
 
 		 272 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812147  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2445  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.22 
 
 		 273 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2058  aldo/keto reductase  39.05 
 
 		 274 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4912  aldo/keto reductase  39.05 
 
 		 277 aa  198  7e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0232607  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3671  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.69 
 
 		 274 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  0.0165196 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3073  2,5-didehydrogluconate reductase  39.48 
 
 		 272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1587  2,5-didehydrogluconate reductase  40.81 
 
 		 276 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0625741  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06660  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  41.67 
 
 		 277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30490  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  41.39 
 
 		 282 aa  196  3e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0968  aldo/keto reductase  40.08 
 
 		 274 aa  195  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4225  oxidoreductase  38.7 
 
 		 276 aa  194  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1167  aldo/keto reductase  40.64 
 
 		 277 aa  194  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.23428 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3339  2,5-didehydrogluconate reductase  37.74 
 
 		 272 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3766  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  38.95 
 
 		 281 aa  191  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.739123  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7952  2,5-didehydrogluconate reductase  40.46 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2381  2,5-didehydrogluconate reductase  38.01 
 
 		 272 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308673  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2522  2,5-didehydrogluconate reductase  39.33 
 
 		 273 aa  190  2.9999999999999997e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0538132  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0861  aldo/keto reductase  39.1 
 
 		 274 aa  188  8e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.274237  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0343  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  38.43 
 
 		 275 aa  188  8e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0586  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  40 
 
 		 275 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0336  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  38.43 
 
 		 275 aa  187  2e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6096  aldo/keto reductase  40.23 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.118169  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02885  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  38.49 
 
 		 275 aa  186  4e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0687  2,5-didehydrogluconate reductase  38.49 
 
 		 275 aa  186  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02835  hypothetical protein  38.49 
 
 		 275 aa  186  4e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3190  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  38.49 
 
 		 275 aa  186  4e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3480  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  38.49 
 
 		 275 aa  186  4e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2042  aldo/keto reductase  38.02 
 
 		 280 aa  186  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1721  2,5-didehydrogluconate reductase  39.92 
 
 		 276 aa  186  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.459314 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0684  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  38.49 
 
 		 275 aa  186  4e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0667  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  39.25 
 
 		 277 aa  186  5e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0519  2,5-didehydrogluconate reductase  37.69 
 
 		 275 aa  186  5e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00901409  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0272  2,5-diketo-D-gluconate reductase A  39.62 
 
 		 277 aa  186  5e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0743  2,5-didehydrogluconate reductase  36.43 
 
 		 279 aa  185  6e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2796  2,5-didehydrogluconate reductase  36.78 
 
 		 275 aa  185  6e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1615  2,5-didehydrogluconate reductase  38.55 
 
 		 272 aa  185  6e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.808798  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>