More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3052 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3052  aldo/keto reductase  100 
 
 
274 aa  555  1e-157  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2929  aldo/keto reductase  76.56 
 
 
274 aa  433  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0580  aldo/keto reductase  63.27 
 
 
275 aa  358  4e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160331  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2717  aldo/keto reductase  62.41 
 
 
274 aa  343  2e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158921  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3339  2,5-didehydrogluconate reductase  45.42 
 
 
272 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3073  2,5-didehydrogluconate reductase  45.42 
 
 
272 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3571  aldo/keto reductase  45.32 
 
 
277 aa  246  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4789  putative aldo/keto reductase  44.69 
 
 
272 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2381  2,5-didehydrogluconate reductase  42.49 
 
 
272 aa  241  9e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308673  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2432  2,5-didehydrogluconate reductase  42.49 
 
 
272 aa  238  6.999999999999999e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812147  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0368  aldo/keto reductase  48.65 
 
 
279 aa  238  9e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.67539  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09980  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  48.12 
 
 
272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00527099  normal  0.878507 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0288  2,5-didehydrogluconate reductase  43.8 
 
 
274 aa  233  3e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.206569  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3327  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.69 
 
 
267 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2368  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.69 
 
 
267 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5116  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.69 
 
 
267 aa  228  8e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745449  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1975  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.69 
 
 
267 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  0.128704 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6096  aldo/keto reductase  46.72 
 
 
268 aa  227  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.118169  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0556  aldo/keto reductase  47.22 
 
 
277 aa  227  2e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1880  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.69 
 
 
267 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0925  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.96 
 
 
272 aa  225  7e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5364  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  46.07 
 
 
267 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108532  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5283  aldo/keto reductase  44.71 
 
 
282 aa  222  4e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0154862 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1048  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  44.19 
 
 
267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00311623  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2695  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  46.82 
 
 
268 aa  218  7.999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4858  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.9 
 
 
268 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5450  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.9 
 
 
268 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5412  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.9 
 
 
268 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948984  decreased coverage  0.00302815 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1101  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.82 
 
 
267 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4753  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.15 
 
 
268 aa  216  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10147  normal  0.725846 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5298  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.15 
 
 
268 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.222173 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3899  aldo/keto reductase  44.24 
 
 
269 aa  215  5.9999999999999996e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.986138  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0945  aldo/keto reductase  42.34 
 
 
273 aa  215  7e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1990  aldo/keto reductase  45.1 
 
 
286 aa  214  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0222  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.61 
 
 
267 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0705129  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00200  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.61 
 
 
267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148488  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00205  hypothetical protein  43.61 
 
 
267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.125752  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0204  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.61 
 
 
267 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0240  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.35 
 
 
268 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0211  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.61 
 
 
267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0362263  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3458  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.61 
 
 
267 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.412559  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0299  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.7 
 
 
274 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3401  aldo/keto reductase  43.61 
 
 
267 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0213  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.23 
 
 
267 aa  211  7.999999999999999e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0554444  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1154  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.45 
 
 
283 aa  211  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.254496  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1865  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.32 
 
 
267 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329772  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0220  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.61 
 
 
267 aa  211  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.167357  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3351  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  44.74 
 
 
268 aa  210  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0904766 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2306  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.32 
 
 
268 aa  209  3e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0833333  hitchhiker  0.000000150497 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1167  aldo/keto reductase  42.58 
 
 
277 aa  208  7e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.23428 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0904  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.07 
 
 
267 aa  208  8e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0293  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.33 
 
 
274 aa  207  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.896057 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0285  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.59 
 
 
274 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0422  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.61 
 
 
268 aa  207  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495467  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2153  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.23 
 
 
268 aa  204  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0287  2,5-didehydrogluconate reductase  41.73 
 
 
277 aa  204  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.941845 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3895  aldo/keto reductase  39.78 
 
 
274 aa  202  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.216872  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0278  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.45 
 
 
267 aa  202  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0968  aldo/keto reductase  40.77 
 
 
274 aa  202  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0068  aldo/keto reductase  43.61 
 
 
267 aa  201  9e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1329  aldo/keto reductase  39.05 
 
 
274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245506  normal  0.195487 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0280  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.33 
 
 
274 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0210  aldo/keto reductase  42.16 
 
 
268 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1800  2,5-didehydrogluconate reductase  41.7 
 
 
282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.195279  hitchhiker  0.00925516 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7952  2,5-didehydrogluconate reductase  42.8 
 
 
270 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1985  2,5-didehydrogluconate reductase  40.38 
 
 
278 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2108  aldo/keto reductase  37.13 
 
 
282 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0183  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.93 
 
 
275 aa  196  3e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4776  aldo/keto reductase  38.69 
 
 
274 aa  195  7e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2522  2,5-didehydrogluconate reductase  38.25 
 
 
273 aa  194  1e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0538132  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1316  aldo/keto reductase  39.85 
 
 
271 aa  194  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.904393  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1160  2,5-didehydrogluconate reductase  39.41 
 
 
276 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02792  probable oxidoreductase  40 
 
 
278 aa  194  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0084  aldo/keto reductase  43.7 
 
 
276 aa  193  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2228  aldo/keto reductase  39.86 
 
 
274 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1306  aldo/keto reductase  38.38 
 
 
274 aa  192  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1420  2,5-didehydrogluconate reductase  40.38 
 
 
274 aa  192  6e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.917399  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1587  2,5-didehydrogluconate reductase  40.23 
 
 
276 aa  192  7e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0625741  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2041  aldo/keto reductase  40.39 
 
 
272 aa  191  7e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.962738  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2232  aldo/keto reductase  40.44 
 
 
274 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5462  aldo/keto reductase  39.23 
 
 
276 aa  191  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414898  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0727  2,5-didehydrogluconate reductase  36.72 
 
 
279 aa  191  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1721  2,5-didehydrogluconate reductase  40.37 
 
 
276 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.459314 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0743  2,5-didehydrogluconate reductase  36.72 
 
 
279 aa  191  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3013  2,5-didehydrogluconate reductase  37.69 
 
 
276 aa  190  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.856221  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4383  aldo/keto reductase  40.64 
 
 
283 aa  190  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0164  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.55 
 
 
357 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.432724  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4134  aldo/keto reductase  37.82 
 
 
273 aa  189  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2058  aldo/keto reductase  39.48 
 
 
274 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4207  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  38.76 
 
 
275 aa  189  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4230  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  38.37 
 
 
275 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3671  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.11 
 
 
274 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  0.0165196 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4006  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.37 
 
 
275 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000973326  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2445  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  41.24 
 
 
273 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3853  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.46 
 
 
312 aa  187  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230626  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2300  2,5-didehydrogluconate reductase  39.23 
 
 
278 aa  187  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.109418 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4319  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.37 
 
 
275 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2796  2,5-didehydrogluconate reductase  38.28 
 
 
275 aa  188  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3928  2,5-didehydrogluconate reductase  39.15 
 
 
275 aa  187  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0821638  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4121  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  38.37 
 
 
275 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000119845 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>