More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3899 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3899  aldo/keto reductase  100 
 
 
269 aa  546  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.986138  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2695  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  68.91 
 
 
268 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0240  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  69.66 
 
 
268 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5450  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  68.54 
 
 
268 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4858  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  68.54 
 
 
268 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5412  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  68.54 
 
 
268 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948984  decreased coverage  0.00302815 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2306  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.42 
 
 
268 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0833333  hitchhiker  0.000000150497 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3351  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.79 
 
 
268 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0904766 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1865  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  65.8 
 
 
267 aa  367  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329772  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5298  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.91 
 
 
268 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.222173 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4753  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  68.28 
 
 
268 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10147  normal  0.725846 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0925  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  65.67 
 
 
272 aa  368  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0422  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.54 
 
 
268 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495467  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2153  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  66.42 
 
 
268 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03276  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  70.97 
 
 
246 aa  362  5.0000000000000005e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0287  2,5-didehydrogluconate reductase  66.29 
 
 
277 aa  360  1e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.941845 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1154  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  65.06 
 
 
283 aa  358  6e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.254496  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09980  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  64.42 
 
 
272 aa  358  7e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00527099  normal  0.878507 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3327  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  64.31 
 
 
267 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0204  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  65.43 
 
 
267 aa  357  9.999999999999999e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2368  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  63.94 
 
 
267 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5364  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  64.81 
 
 
267 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108532  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0213  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  65.06 
 
 
267 aa  354  7.999999999999999e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0554444  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3458  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  64.68 
 
 
267 aa  353  2e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.412559  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3401  aldo/keto reductase  65.06 
 
 
267 aa  352  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0222  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  64.68 
 
 
267 aa  352  2.9999999999999997e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0705129  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0299  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  64.68 
 
 
274 aa  352  5e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0220  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  64.68 
 
 
267 aa  352  5e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.167357  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00200  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  64.31 
 
 
267 aa  351  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148488  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00205  hypothetical protein  64.31 
 
 
267 aa  351  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.125752  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1180  aldo/keto reductase  62.08 
 
 
267 aa  350  1e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0293  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  64.68 
 
 
274 aa  350  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.896057 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0211  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  63.94 
 
 
267 aa  350  2e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0362263  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5116  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  63.33 
 
 
267 aa  348  4e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745449  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0904  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  63.57 
 
 
267 aa  349  4e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1880  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  62.08 
 
 
267 aa  348  5e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0285  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  63.94 
 
 
274 aa  347  9e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0278  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  64.68 
 
 
267 aa  346  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1975  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  62.45 
 
 
267 aa  346  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  0.128704 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0280  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  64.68 
 
 
274 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1048  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  60.97 
 
 
267 aa  338  7e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00311623  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1101  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  60.97 
 
 
267 aa  338  7e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0068  aldo/keto reductase  65.92 
 
 
267 aa  337  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0945  aldo/keto reductase  60.67 
 
 
273 aa  325  4.0000000000000003e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0210  aldo/keto reductase  57.46 
 
 
268 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1316  aldo/keto reductase  56.18 
 
 
271 aa  303  2.0000000000000002e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.904393  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02792  probable oxidoreductase  52.57 
 
 
278 aa  275  5e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3599  aldo/keto reductase  51.49 
 
 
280 aa  267  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02282  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  49.44 
 
 
267 aa  261  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4134  aldo/keto reductase  47.19 
 
 
273 aa  250  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0580  aldo/keto reductase  45.19 
 
 
275 aa  229  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160331  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2717  aldo/keto reductase  44.61 
 
 
274 aa  226  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158921  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1306  aldo/keto reductase  44.07 
 
 
274 aa  225  5.0000000000000005e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0288  2,5-didehydrogluconate reductase  44.65 
 
 
274 aa  221  9e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.206569  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3052  aldo/keto reductase  44.24 
 
 
274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2929  aldo/keto reductase  42.54 
 
 
274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1167  aldo/keto reductase  43.97 
 
 
277 aa  216  4e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.23428 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4776  aldo/keto reductase  43.7 
 
 
274 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0578  aldo/keto reductase  42.32 
 
 
276 aa  210  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.113038  normal  0.346661 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2108  aldo/keto reductase  41.76 
 
 
282 aa  210  2e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4789  putative aldo/keto reductase  41.57 
 
 
272 aa  209  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1329  aldo/keto reductase  41.85 
 
 
274 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245506  normal  0.195487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3895  aldo/keto reductase  41.85 
 
 
274 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.216872  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06660  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  47.06 
 
 
277 aa  205  6e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2432  2,5-didehydrogluconate reductase  38.95 
 
 
272 aa  204  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812147  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0968  aldo/keto reductase  45.02 
 
 
274 aa  201  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3073  2,5-didehydrogluconate reductase  39.78 
 
 
272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7952  2,5-didehydrogluconate reductase  44.75 
 
 
270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3571  aldo/keto reductase  41.64 
 
 
277 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3339  2,5-didehydrogluconate reductase  41.79 
 
 
272 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6096  aldo/keto reductase  43.28 
 
 
268 aa  199  6e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.118169  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2058  aldo/keto reductase  42.22 
 
 
274 aa  194  9e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3671  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.48 
 
 
274 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  0.0165196 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5283  aldo/keto reductase  42.75 
 
 
282 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0154862 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0368  aldo/keto reductase  41.48 
 
 
279 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.67539  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2381  2,5-didehydrogluconate reductase  37.73 
 
 
272 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308673  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0084  aldo/keto reductase  43.41 
 
 
276 aa  192  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2445  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.96 
 
 
273 aa  192  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2228  aldo/keto reductase  41.48 
 
 
274 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2042  aldo/keto reductase  38.49 
 
 
280 aa  190  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3984  aldo/keto reductase  42.06 
 
 
277 aa  190  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1501  2,5-didehydrogluconate reductase  38.78 
 
 
274 aa  189  2.9999999999999997e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2214  aldo/keto reductase  42.21 
 
 
268 aa  188  8e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0861  aldo/keto reductase  42.63 
 
 
274 aa  187  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.274237  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38150  Aldo/keto reductase  41.7 
 
 
277 aa  186  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.451685  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2232  aldo/keto reductase  40.37 
 
 
274 aa  186  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1587  2,5-didehydrogluconate reductase  41.64 
 
 
276 aa  186  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0625741  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3214  2,5-didehydrogluconate reductase  43.14 
 
 
280 aa  186  5e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00515928  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4957  2,5-didehydrogluconate reductase  40.47 
 
 
279 aa  186  5e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4126  2,5-didehydrogluconate reductase  41.26 
 
 
294 aa  185  7e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1380  2,5-didehydrogluconate reductase  39.23 
 
 
275 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0181  2,5-didehydrogluconate reductase  38.85 
 
 
277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1420  2,5-didehydrogluconate reductase  43.72 
 
 
274 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.917399  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0196  2,5-didehydrogluconate reductase  38.85 
 
 
277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4230  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  40.23 
 
 
275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30490  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  41.57 
 
 
282 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0216  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  38.85 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0197  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.85 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4912  aldo/keto reductase  39.63 
 
 
277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0232607  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0196  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.85 
 
 
277 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>