More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1180 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1180  aldo/keto reductase  100 
 
 
267 aa  541  1e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0240  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  68.3 
 
 
268 aa  371  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2695  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.55 
 
 
268 aa  368  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0925  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.67 
 
 
272 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5298  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  68.3 
 
 
268 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.222173 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2306  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.17 
 
 
268 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0833333  hitchhiker  0.000000150497 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4858  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.55 
 
 
268 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0904  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  65.92 
 
 
267 aa  364  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5116  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.42 
 
 
267 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745449  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5364  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  66.67 
 
 
267 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108532  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5450  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.55 
 
 
268 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4753  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.92 
 
 
268 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10147  normal  0.725846 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3351  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  66.79 
 
 
268 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0904766 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5412  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.55 
 
 
268 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948984  decreased coverage  0.00302815 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2153  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  66.04 
 
 
268 aa  362  4e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0422  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  66.04 
 
 
268 aa  361  7.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495467  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09980  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  66.04 
 
 
272 aa  359  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00527099  normal  0.878507 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1975  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  66.29 
 
 
267 aa  358  4e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  0.128704 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1865  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  64.42 
 
 
267 aa  352  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329772  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2368  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  65.54 
 
 
267 aa  351  7e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3327  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  65.17 
 
 
267 aa  351  8e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0220  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  63.67 
 
 
267 aa  350  1e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.167357  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0204  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  63.3 
 
 
267 aa  350  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0299  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  62.92 
 
 
274 aa  349  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0293  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  63.3 
 
 
274 aa  348  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.896057 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3458  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  63.3 
 
 
267 aa  348  4e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.412559  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0222  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  62.92 
 
 
267 aa  348  5e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0705129  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3401  aldo/keto reductase  63.3 
 
 
267 aa  348  6e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0213  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  63.3 
 
 
267 aa  348  8e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0554444  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00200  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  62.92 
 
 
267 aa  346  2e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148488  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00205  hypothetical protein  62.92 
 
 
267 aa  346  2e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.125752  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1880  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  63.67 
 
 
267 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0211  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  62.17 
 
 
267 aa  343  1e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0362263  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0285  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  62.17 
 
 
274 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0287  2,5-didehydrogluconate reductase  60.38 
 
 
277 aa  343  2e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.941845 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1101  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  63.67 
 
 
267 aa  342  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1048  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  63.67 
 
 
267 aa  342  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00311623  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0278  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  62.17 
 
 
267 aa  341  5.999999999999999e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0280  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  62.92 
 
 
274 aa  340  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3899  aldo/keto reductase  62.08 
 
 
269 aa  333  2e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.986138  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0945  aldo/keto reductase  61.13 
 
 
273 aa  327  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1154  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  57.68 
 
 
283 aa  319  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.254496  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03276  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  59.84 
 
 
246 aa  300  1e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0068  aldo/keto reductase  58.49 
 
 
267 aa  297  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1316  aldo/keto reductase  53.96 
 
 
271 aa  288  7e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.904393  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02282  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  47.17 
 
 
267 aa  267  1e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0210  aldo/keto reductase  49.62 
 
 
268 aa  258  9e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02792  probable oxidoreductase  44.61 
 
 
278 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3599  aldo/keto reductase  46.42 
 
 
280 aa  241  1e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4134  aldo/keto reductase  44.15 
 
 
273 aa  236  3e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1306  aldo/keto reductase  42.16 
 
 
274 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0288  2,5-didehydrogluconate reductase  41.64 
 
 
274 aa  206  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.206569  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1167  aldo/keto reductase  41.5 
 
 
277 aa  206  3e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.23428 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2717  aldo/keto reductase  39.7 
 
 
274 aa  205  5e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158921  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0580  aldo/keto reductase  40.07 
 
 
275 aa  202  5e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160331  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3571  aldo/keto reductase  40.38 
 
 
277 aa  199  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4789  putative aldo/keto reductase  38.11 
 
 
272 aa  195  8.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3339  2,5-didehydrogluconate reductase  38.11 
 
 
272 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2432  2,5-didehydrogluconate reductase  36.84 
 
 
272 aa  192  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812147  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4776  aldo/keto reductase  41.04 
 
 
274 aa  191  9e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1329  aldo/keto reductase  40.3 
 
 
274 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245506  normal  0.195487 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3073  2,5-didehydrogluconate reductase  36.6 
 
 
272 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3052  aldo/keto reductase  39.33 
 
 
274 aa  187  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2381  2,5-didehydrogluconate reductase  36.23 
 
 
272 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308673  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03850  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  39.1 
 
 
282 aa  186  5e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0578  aldo/keto reductase  38.35 
 
 
276 aa  185  6e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.113038  normal  0.346661 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3895  aldo/keto reductase  38.06 
 
 
274 aa  185  7e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.216872  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06660  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  39 
 
 
277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2108  aldo/keto reductase  37.92 
 
 
282 aa  182  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6096  aldo/keto reductase  40.23 
 
 
268 aa  182  6e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.118169  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2929  aldo/keto reductase  38.72 
 
 
274 aa  182  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30490  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  40.55 
 
 
282 aa  182  6e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1420  2,5-didehydrogluconate reductase  41.05 
 
 
274 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.917399  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38150  Aldo/keto reductase  37.69 
 
 
277 aa  181  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.451685  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2058  aldo/keto reductase  39.55 
 
 
274 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0988  2,5-didehydrogluconate reductase  38.28 
 
 
272 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0968  aldo/keto reductase  38.76 
 
 
274 aa  178  9e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3671  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.18 
 
 
274 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  0.0165196 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2232  aldo/keto reductase  39.55 
 
 
274 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0368  aldo/keto reductase  40.89 
 
 
279 aa  176  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.67539  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2042  aldo/keto reductase  36.5 
 
 
280 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2445  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.3 
 
 
273 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2314  oxidoreductase, chromogranin/secretogranin  38.28 
 
 
272 aa  176  3e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2228  aldo/keto reductase  38.81 
 
 
274 aa  176  3e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7952  2,5-didehydrogluconate reductase  37.25 
 
 
270 aa  176  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0727  2,5-didehydrogluconate reductase  36.19 
 
 
279 aa  175  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0743  2,5-didehydrogluconate reductase  36.19 
 
 
279 aa  175  6e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2214  aldo/keto reductase  37.74 
 
 
268 aa  175  7e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0362  aldo/keto reductase family oxidoreductase  36.5 
 
 
279 aa  175  8e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5283  aldo/keto reductase  39.92 
 
 
282 aa  172  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0154862 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1501  2,5-didehydrogluconate reductase  36.29 
 
 
274 aa  172  3.9999999999999995e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1839  2,5-didehydrogluconate reductase  35.52 
 
 
277 aa  172  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1875  2,5-didehydrogluconate reductase  35.52 
 
 
277 aa  172  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1615  2,5-didehydrogluconate reductase  36.76 
 
 
272 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.808798  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0861  aldo/keto reductase  37.6 
 
 
274 aa  171  7.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.274237  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1587  2,5-didehydrogluconate reductase  36.72 
 
 
276 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0625741  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1476  aldo/keto reductase family oxidoreductase  36.16 
 
 
280 aa  171  1e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0251019  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0612  aldo/keto reductase  38.55 
 
 
268 aa  171  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293395  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1326  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  35.42 
 
 
280 aa  171  1e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000298135  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2161  2,5-didehydrogluconate reductase  39.69 
 
 
279 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>