More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6096 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6096  aldo/keto reductase  100 
 
 
268 aa  547  1e-155  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.118169  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3339  2,5-didehydrogluconate reductase  47.64 
 
 
272 aa  247  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2432  2,5-didehydrogluconate reductase  45.79 
 
 
272 aa  246  3e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812147  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4789  putative aldo/keto reductase  47.62 
 
 
272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2717  aldo/keto reductase  45.99 
 
 
274 aa  238  1e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158921  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3571  aldo/keto reductase  48.16 
 
 
277 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0288  2,5-didehydrogluconate reductase  46.38 
 
 
274 aa  237  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.206569  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0580  aldo/keto reductase  46.35 
 
 
275 aa  236  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160331  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3073  2,5-didehydrogluconate reductase  46.52 
 
 
272 aa  235  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3052  aldo/keto reductase  46.72 
 
 
274 aa  227  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2381  2,5-didehydrogluconate reductase  43.22 
 
 
272 aa  226  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308673  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2232  aldo/keto reductase  46.56 
 
 
274 aa  225  6e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0368  aldo/keto reductase  47.24 
 
 
279 aa  220  1.9999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.67539  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2228  aldo/keto reductase  45.04 
 
 
274 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1306  aldo/keto reductase  44.27 
 
 
274 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2058  aldo/keto reductase  45.42 
 
 
274 aa  215  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3671  aldo/keto reductase family oxidoreductase  45.42 
 
 
274 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  0.0165196 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4912  aldo/keto reductase  44.32 
 
 
277 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0232607  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2929  aldo/keto reductase  43.07 
 
 
274 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3895  aldo/keto reductase  41.91 
 
 
274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.216872  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4776  aldo/keto reductase  42.28 
 
 
274 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1329  aldo/keto reductase  40.81 
 
 
274 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245506  normal  0.195487 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2108  aldo/keto reductase  40.82 
 
 
282 aa  211  7.999999999999999e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2445  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.65 
 
 
273 aa  209  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0287  2,5-didehydrogluconate reductase  45.11 
 
 
277 aa  208  9e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.941845 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0945  aldo/keto reductase  44.7 
 
 
273 aa  207  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2041  aldo/keto reductase  42.91 
 
 
272 aa  207  1e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.962738  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0556  aldo/keto reductase  45.24 
 
 
277 aa  206  2e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02282  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.38 
 
 
267 aa  206  4e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1990  aldo/keto reductase  44.22 
 
 
286 aa  205  7e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38150  Aldo/keto reductase  44.27 
 
 
277 aa  203  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.451685  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0861  aldo/keto reductase  46.25 
 
 
274 aa  203  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.274237  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1154  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.15 
 
 
283 aa  202  3e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.254496  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1167  aldo/keto reductase  41.7 
 
 
277 aa  202  4e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.23428 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4134  aldo/keto reductase  39.77 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0578  aldo/keto reductase  43.4 
 
 
276 aa  198  7.999999999999999e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.113038  normal  0.346661 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3534  2,5-didehydrogluconate reductase  43.4 
 
 
272 aa  196  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  0.675115 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2306  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.49 
 
 
268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0833333  hitchhiker  0.000000150497 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0904  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.66 
 
 
267 aa  195  6e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2368  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  41.73 
 
 
267 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1160  2,5-didehydrogluconate reductase  42.07 
 
 
276 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1316  aldo/keto reductase  42.86 
 
 
271 aa  194  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.904393  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3327  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  41.35 
 
 
267 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2695  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.75 
 
 
268 aa  193  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1975  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  41.73 
 
 
267 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  0.128704 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1865  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.98 
 
 
267 aa  192  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329772  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0204  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.6 
 
 
267 aa  192  6e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0240  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.32 
 
 
268 aa  191  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5450  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.32 
 
 
268 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4543  2,5-didehydrogluconate reductase  44.91 
 
 
295 aa  191  9e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5412  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.32 
 
 
268 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948984  decreased coverage  0.00302815 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4205  2,5-didehydrogluconate reductase  43.08 
 
 
279 aa  191  9e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4858  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.32 
 
 
268 aa  191  9e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1380  2,5-didehydrogluconate reductase  40.61 
 
 
275 aa  191  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0211  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.23 
 
 
267 aa  191  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0362263  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0068  aldo/keto reductase  46.07 
 
 
267 aa  191  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00200  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.6 
 
 
267 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148488  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3401  aldo/keto reductase  40.6 
 
 
267 aa  190  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1420  2,5-didehydrogluconate reductase  46.64 
 
 
274 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.917399  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00205  hypothetical protein  40.6 
 
 
267 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.125752  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3458  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.6 
 
 
267 aa  191  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.412559  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1880  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.16 
 
 
267 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0220  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.6 
 
 
267 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.167357  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5116  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.54 
 
 
267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745449  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0222  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.6 
 
 
267 aa  190  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0705129  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03276  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  44.9 
 
 
246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1048  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  41.64 
 
 
267 aa  189  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00311623  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3351  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.11 
 
 
268 aa  189  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0904766 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0672  aldo/keto reductase  40.77 
 
 
280 aa  189  4e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851781  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2042  aldo/keto reductase  41.6 
 
 
280 aa  189  5e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3899  aldo/keto reductase  43.28 
 
 
269 aa  189  5e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.986138  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0213  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.23 
 
 
267 aa  189  5.999999999999999e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0554444  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1101  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  41.64 
 
 
267 aa  189  5.999999999999999e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5298  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  41.57 
 
 
268 aa  188  9e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.222173 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1501  2,5-didehydrogluconate reductase  41.44 
 
 
274 aa  187  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7952  2,5-didehydrogluconate reductase  43.48 
 
 
270 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0968  aldo/keto reductase  45.31 
 
 
274 aa  187  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12986  oxidoreductase  44.14 
 
 
282 aa  187  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02792  probable oxidoreductase  38.71 
 
 
278 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4753  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  41.2 
 
 
268 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10147  normal  0.725846 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0285  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.23 
 
 
274 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0299  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.6 
 
 
274 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1721  2,5-didehydrogluconate reductase  43.14 
 
 
276 aa  186  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222212  normal  0.459314 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5462  aldo/keto reductase  43.89 
 
 
276 aa  186  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414898  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0519  2,5-didehydrogluconate reductase  40.08 
 
 
275 aa  185  5e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00901409  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0293  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.23 
 
 
274 aa  185  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.896057 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5364  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.16 
 
 
267 aa  185  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108532  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09980  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.91 
 
 
272 aa  185  6e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00527099  normal  0.878507 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2161  2,5-didehydrogluconate reductase  43.48 
 
 
279 aa  185  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0612  aldo/keto reductase  39.46 
 
 
268 aa  184  9e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293395  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5283  aldo/keto reductase  44.08 
 
 
282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0154862 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1938  2,5-didehydrogluconate reductase  43.58 
 
 
283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.499109  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1984  2,5-didehydrogluconate reductase  43.58 
 
 
283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.062143  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0084  aldo/keto reductase  45.45 
 
 
276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1839  2,5-didehydrogluconate reductase  38.89 
 
 
277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1875  2,5-didehydrogluconate reductase  38.89 
 
 
277 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3984  aldo/keto reductase  40.25 
 
 
277 aa  183  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0278  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.23 
 
 
267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4225  oxidoreductase  38.52 
 
 
276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1180  aldo/keto reductase  40.23 
 
 
267 aa  182  6e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>