More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2306 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2306  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  100 
 
 		 268 aa  548  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0833333  hitchhiker  0.000000150497 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2695  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  95.52 
 
 		 268 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0240  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  85.82 
 
 		 268 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4858  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  85.45 
 
 		 268 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5450  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  85.45 
 
 		 268 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5412  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  85.45 
 
 		 268 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948984  decreased coverage  0.00302815 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5298  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  83.96 
 
 		 268 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.222173 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4753  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  84.33 
 
 		 268 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10147  normal  0.725846 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3351  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  84.33 
 
 		 268 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0904766 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0422  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  81.34 
 
 		 268 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495467  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2153  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  81.34 
 
 		 268 aa  450  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0925  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  73.51 
 
 		 272 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5364  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  74.72 
 
 		 267 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108532  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2368  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  73.96 
 
 		 267 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1975  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  73.96 
 
 		 267 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  0.128704 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3327  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  73.58 
 
 		 267 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5116  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  73.58 
 
 		 267 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745449  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09980  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  72.01 
 
 		 272 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00527099  normal  0.878507 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1880  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  73.21 
 
 		 267 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0904  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  72.08 
 
 		 267 aa  388  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0204  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.55 
 
 		 267 aa  372  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1865  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  68.3 
 
 		 267 aa  372  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329772  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00200  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.17 
 
 		 267 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148488  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0285  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.55 
 
 		 274 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68197 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3401  aldo/keto reductase  67.55 
 
 		 267 aa  369  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0213  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.55 
 
 		 267 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0554444  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0293  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.55 
 
 		 274 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.896057 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0299  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.55 
 
 		 274 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0220  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.92 
 
 		 267 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.167357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00205  hypothetical protein  67.17 
 
 		 267 aa  369  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.125752  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3458  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.55 
 
 		 267 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.412559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0222  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.17 
 
 		 267 aa  367  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0705129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0211  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  66.79 
 
 		 267 aa  367  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0362263  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1180  aldo/keto reductase  67.17 
 
 		 267 aa  367  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0278  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.55 
 
 		 267 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1101  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  66.04 
 
 		 267 aa  363  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1048  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  66.04 
 
 		 267 aa  363  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00311623  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0287  2,5-didehydrogluconate reductase  65.66 
 
 		 277 aa  361  6e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.941845 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3899  aldo/keto reductase  67.42 
 
 		 269 aa  359  3e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.986138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0280  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.17 
 
 		 274 aa  357  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1154  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  64.53 
 
 		 283 aa  349  3e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.254496  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0945  aldo/keto reductase  63.77 
 
 		 273 aa  337  9.999999999999999e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03276  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  64.23 
 
 		 246 aa  330  1e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0068  aldo/keto reductase  60.45 
 
 		 267 aa  311  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0210  aldo/keto reductase  52.24 
 
 		 268 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1316  aldo/keto reductase  53.58 
 
 		 271 aa  282  4.0000000000000003e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.904393  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4134  aldo/keto reductase  49.24 
 
 		 273 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3599  aldo/keto reductase  50 
 
 		 280 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02792  probable oxidoreductase  48.15 
 
 		 278 aa  262  3e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02282  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  47.76 
 
 		 267 aa  262  4e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2717  aldo/keto reductase  47.76 
 
 		 274 aa  239  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0580  aldo/keto reductase  47.01 
 
 		 275 aa  232  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4789  putative aldo/keto reductase  43.98 
 
 		 272 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0288  2,5-didehydrogluconate reductase  46.07 
 
 		 274 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.206569  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1306  aldo/keto reductase  43.23 
 
 		 274 aa  217  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0578  aldo/keto reductase  42.7 
 
 		 276 aa  216  2e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.113038  normal  0.346661 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1167  aldo/keto reductase  46.61 
 
 		 277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.23428 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2432  2,5-didehydrogluconate reductase  40.45 
 
 		 272 aa  211  7e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812147  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3052  aldo/keto reductase  45.32 
 
 		 274 aa  209  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2108  aldo/keto reductase  43.49 
 
 		 282 aa  208  6e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2929  aldo/keto reductase  44.36 
 
 		 274 aa  207  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3339  2,5-didehydrogluconate reductase  41.35 
 
 		 272 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06660  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  44.44 
 
 		 277 aa  206  5e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3571  aldo/keto reductase  42.86 
 
 		 277 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3073  2,5-didehydrogluconate reductase  40.98 
 
 		 272 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1329  aldo/keto reductase  41.73 
 
 		 274 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245506  normal  0.195487 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4776  aldo/keto reductase  43.28 
 
 		 274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0368  aldo/keto reductase  43.56 
 
 		 279 aa  198  6e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.67539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0968  aldo/keto reductase  42.69 
 
 		 274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3895  aldo/keto reductase  40.6 
 
 		 274 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.216872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6096  aldo/keto reductase  43.49 
 
 		 268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3984  aldo/keto reductase  43.53 
 
 		 277 aa  193  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7952  2,5-didehydrogluconate reductase  44.4 
 
 		 270 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4225  oxidoreductase  39.69 
 
 		 276 aa  192  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30490  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  43.73 
 
 		 282 aa  192  6e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2381  2,5-didehydrogluconate reductase  38.6 
 
 		 272 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308673  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0084  aldo/keto reductase  43.46 
 
 		 276 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5283  aldo/keto reductase  42.63 
 
 		 282 aa  188  5.999999999999999e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0154862 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0861  aldo/keto reductase  41.09 
 
 		 274 aa  188  9e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.274237  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2058  aldo/keto reductase  40.6 
 
 		 274 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2445  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  41.95 
 
 		 273 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2042  aldo/keto reductase  38.11 
 
 		 280 aa  187  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2214  aldo/keto reductase  40.91 
 
 		 268 aa  186  4e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5462  aldo/keto reductase  41.7 
 
 		 276 aa  185  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1501  2,5-didehydrogluconate reductase  38.93 
 
 		 274 aa  184  9e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1420  2,5-didehydrogluconate reductase  41.13 
 
 		 274 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.917399  normal  0.103944 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2041  aldo/keto reductase  40.89 
 
 		 272 aa  181  8.000000000000001e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.962738  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3671  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.85 
 
 		 274 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  0.0165196 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2522  2,5-didehydrogluconate reductase  38.02 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0538132  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0672  aldo/keto reductase  38.22 
 
 		 280 aa  181  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851781  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0727  2,5-didehydrogluconate reductase  36.64 
 
 		 279 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0743  2,5-didehydrogluconate reductase  36.64 
 
 		 279 aa  181  1e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03850  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  41.27 
 
 		 282 aa  181  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0858  aldo/keto reductase  40.07 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3853  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.34 
 
 		 312 aa  180  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230626  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4230  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  41.34 
 
 		 275 aa  180  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1615  2,5-didehydrogluconate reductase  40.77 
 
 		 272 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.808798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3928  2,5-didehydrogluconate reductase  40.94 
 
 		 275 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0821638  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3214  2,5-didehydrogluconate reductase  42.47 
 
 		 280 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00515928  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2161  2,5-didehydrogluconate reductase  42.69 
 
 		 279 aa  179  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>