More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_5412 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4858  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  100 
 
 
268 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5450  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  100 
 
 
268 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5412  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  100 
 
 
268 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948984  decreased coverage  0.00302815 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5298  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  97.39 
 
 
268 aa  533  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.222173 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4753  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  97.39 
 
 
268 aa  531  1e-150  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10147  normal  0.725846 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0240  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  94.4 
 
 
268 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3351  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  90.67 
 
 
268 aa  498  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0904766 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2695  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  87.69 
 
 
268 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2306  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  85.45 
 
 
268 aa  472  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0833333  hitchhiker  0.000000150497 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2153  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  83.96 
 
 
268 aa  463  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0422  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  82.46 
 
 
268 aa  454  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495467  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5364  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  76.6 
 
 
267 aa  414  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108532  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09980  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  74.72 
 
 
272 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00527099  normal  0.878507 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0925  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  74.25 
 
 
272 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3327  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  75.09 
 
 
267 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1975  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  74.34 
 
 
267 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  0.128704 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2368  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  74.72 
 
 
267 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5116  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  74.34 
 
 
267 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745449  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1880  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  72.45 
 
 
267 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0904  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  72.08 
 
 
267 aa  381  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0293  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  69.06 
 
 
274 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.896057 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0285  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  68.68 
 
 
274 aa  370  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0299  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  68.68 
 
 
274 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1180  aldo/keto reductase  67.55 
 
 
267 aa  365  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0278  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  68.68 
 
 
267 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0287  2,5-didehydrogluconate reductase  66.04 
 
 
277 aa  365  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.941845 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0204  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.55 
 
 
267 aa  363  1e-99  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1865  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  66.42 
 
 
267 aa  363  1e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329772  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1048  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.55 
 
 
267 aa  363  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00311623  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0213  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.55 
 
 
267 aa  362  3e-99  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0554444  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3458  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.55 
 
 
267 aa  362  3e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.412559  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1101  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.55 
 
 
267 aa  362  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0220  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.92 
 
 
267 aa  362  4e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.167357  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0222  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.17 
 
 
267 aa  360  1e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0705129  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00200  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.17 
 
 
267 aa  360  1e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148488  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3401  aldo/keto reductase  67.55 
 
 
267 aa  360  1e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00205  hypothetical protein  67.17 
 
 
267 aa  360  1e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.125752  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0280  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  68.68 
 
 
274 aa  360  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0211  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  67.17 
 
 
267 aa  360  1e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0362263  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1154  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  65.66 
 
 
283 aa  357  9.999999999999999e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.254496  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3899  aldo/keto reductase  68.54 
 
 
269 aa  356  1.9999999999999998e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.986138  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03276  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  66.67 
 
 
246 aa  333  1e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0945  aldo/keto reductase  62.92 
 
 
273 aa  329  2e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0068  aldo/keto reductase  63.06 
 
 
267 aa  326  3e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1316  aldo/keto reductase  52.45 
 
 
271 aa  272  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.904393  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0210  aldo/keto reductase  50 
 
 
268 aa  269  5e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02282  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  46.64 
 
 
267 aa  259  5.0000000000000005e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3599  aldo/keto reductase  47.76 
 
 
280 aa  254  8e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4134  aldo/keto reductase  47.35 
 
 
273 aa  251  7e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02792  probable oxidoreductase  47.97 
 
 
278 aa  249  3e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2717  aldo/keto reductase  46.84 
 
 
274 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158921  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0580  aldo/keto reductase  46.84 
 
 
275 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160331  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1306  aldo/keto reductase  44.36 
 
 
274 aa  227  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4789  putative aldo/keto reductase  43.07 
 
 
272 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0578  aldo/keto reductase  43.4 
 
 
276 aa  222  6e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.113038  normal  0.346661 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3052  aldo/keto reductase  45.9 
 
 
274 aa  218  8.999999999999998e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0288  2,5-didehydrogluconate reductase  45.32 
 
 
274 aa  216  4e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.206569  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2929  aldo/keto reductase  45.9 
 
 
274 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4776  aldo/keto reductase  44.36 
 
 
274 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2432  2,5-didehydrogluconate reductase  39.93 
 
 
272 aa  210  2e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812147  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1329  aldo/keto reductase  42.48 
 
 
274 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245506  normal  0.195487 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1167  aldo/keto reductase  44.05 
 
 
277 aa  206  4e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.23428 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2108  aldo/keto reductase  42.44 
 
 
282 aa  205  6e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3895  aldo/keto reductase  41.73 
 
 
274 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.216872  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06660  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  45.17 
 
 
277 aa  202  5e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2445  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.07 
 
 
273 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3339  2,5-didehydrogluconate reductase  39.7 
 
 
272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3571  aldo/keto reductase  41.2 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0084  aldo/keto reductase  44.31 
 
 
276 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3073  2,5-didehydrogluconate reductase  39.55 
 
 
272 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2058  aldo/keto reductase  41.35 
 
 
274 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0368  aldo/keto reductase  44.09 
 
 
279 aa  193  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.67539  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3671  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.98 
 
 
274 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  0.0165196 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6096  aldo/keto reductase  42.32 
 
 
268 aa  191  9e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.118169  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5283  aldo/keto reductase  43.15 
 
 
282 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0154862 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30490  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  44.27 
 
 
282 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2228  aldo/keto reductase  40.23 
 
 
274 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0968  aldo/keto reductase  41.31 
 
 
274 aa  188  7e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2381  2,5-didehydrogluconate reductase  38.06 
 
 
272 aa  188  9e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308673  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2232  aldo/keto reductase  41.35 
 
 
274 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0861  aldo/keto reductase  41.7 
 
 
274 aa  186  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.274237  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3214  2,5-didehydrogluconate reductase  43.48 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00515928  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4230  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  41.34 
 
 
275 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3853  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.34 
 
 
312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230626  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3928  2,5-didehydrogluconate reductase  40.94 
 
 
275 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0821638  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4225  oxidoreductase  39 
 
 
276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7952  2,5-didehydrogluconate reductase  42.91 
 
 
270 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2042  aldo/keto reductase  38.4 
 
 
280 aa  182  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4006  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.94 
 
 
275 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000973326  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4319  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.94 
 
 
275 aa  182  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4121  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  40.94 
 
 
275 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000119845 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4166  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.94 
 
 
275 aa  182  7e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3839  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.94 
 
 
275 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03850  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  40.23 
 
 
282 aa  181  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2522  2,5-didehydrogluconate reductase  38.04 
 
 
273 aa  179  4e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0538132  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1501  2,5-didehydrogluconate reductase  37.8 
 
 
274 aa  179  4.999999999999999e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1587  2,5-didehydrogluconate reductase  40.68 
 
 
276 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0625741  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1030  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  40.94 
 
 
275 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0672  aldo/keto reductase  38.93 
 
 
280 aa  179  5.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851781  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4207  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  40.55 
 
 
275 aa  178  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>