More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4789 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4789  putative aldo/keto reductase  100 
 
 		 272 aa  563  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3339  2,5-didehydrogluconate reductase  73.53 
 
 		 272 aa  432  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2432  2,5-didehydrogluconate reductase  72.43 
 
 		 272 aa  433  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812147  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3571  aldo/keto reductase  71.48 
 
 		 277 aa  424  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2381  2,5-didehydrogluconate reductase  72.43 
 
 		 272 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308673  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3073  2,5-didehydrogluconate reductase  69.12 
 
 		 272 aa  414  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0288  2,5-didehydrogluconate reductase  51.28 
 
 		 274 aa  293  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.206569  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0580  aldo/keto reductase  47.45 
 
 		 275 aa  272  3e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2717  aldo/keto reductase  48.91 
 
 		 274 aa  270  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0368  aldo/keto reductase  50.37 
 
 		 279 aa  268  1e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.67539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1167  aldo/keto reductase  49.22 
 
 		 277 aa  258  6e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.23428 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1990  aldo/keto reductase  48.24 
 
 		 286 aa  246  3e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2929  aldo/keto reductase  44.69 
 
 		 274 aa  244  9e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6096  aldo/keto reductase  47.62 
 
 		 268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3052  aldo/keto reductase  44.69 
 
 		 274 aa  243  3e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0556  aldo/keto reductase  48.03 
 
 		 277 aa  243  3.9999999999999997e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1306  aldo/keto reductase  44.87 
 
 		 274 aa  238  5e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5283  aldo/keto reductase  43.82 
 
 		 282 aa  236  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0154862 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2108  aldo/keto reductase  43.17 
 
 		 282 aa  229  3e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5116  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  44.53 
 
 		 267 aa  227  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745449  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2306  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.98 
 
 		 268 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0833333  hitchhiker  0.000000150497 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1316  aldo/keto reductase  45.28 
 
 		 271 aa  226  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.904393  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3351  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  44.53 
 
 		 268 aa  226  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0904766 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2695  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.23 
 
 		 268 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0240  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.07 
 
 		 268 aa  223  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0287  2,5-didehydrogluconate reductase  45.49 
 
 		 277 aa  224  2e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.941845 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4858  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.07 
 
 		 268 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5450  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.07 
 
 		 268 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5412  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.07 
 
 		 268 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948984  decreased coverage  0.00302815 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0068  aldo/keto reductase  46.04 
 
 		 267 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1154  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.86 
 
 		 283 aa  222  6e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.254496  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02282  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  41.89 
 
 		 267 aa  221  9e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0672  aldo/keto reductase  44.11 
 
 		 280 aa  221  9.999999999999999e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851781  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5298  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.32 
 
 		 268 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.222173 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1865  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.86 
 
 		 267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0422  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  44.53 
 
 		 268 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495467  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2153  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.77 
 
 		 268 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2445  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  44.69 
 
 		 273 aa  219  5e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4753  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.32 
 
 		 268 aa  218  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10147  normal  0.725846 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0578  aldo/keto reductase  43.51 
 
 		 276 aa  218  7e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.113038  normal  0.346661 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0904  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.02 
 
 		 267 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1975  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.26 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  0.128704 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0945  aldo/keto reductase  41.44 
 
 		 273 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5364  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.26 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1880  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.64 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02792  probable oxidoreductase  40.14 
 
 		 278 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4134  aldo/keto reductase  40.91 
 
 		 273 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0925  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.64 
 
 		 272 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2042  aldo/keto reductase  41.51 
 
 		 280 aa  211  1e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3327  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  41.13 
 
 		 267 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2368  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  41.51 
 
 		 267 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09980  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.26 
 
 		 272 aa  209  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00527099  normal  0.878507 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4776  aldo/keto reductase  41.03 
 
 		 274 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1329  aldo/keto reductase  39.56 
 
 		 274 aa  208  6e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245506  normal  0.195487 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1048  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.38 
 
 		 267 aa  209  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00311623  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0222  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.38 
 
 		 267 aa  208  7e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0705129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1101  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.38 
 
 		 267 aa  208  7e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4225  oxidoreductase  41.09 
 
 		 276 aa  208  9e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1360  2,5-didehydrogluconate reductase  42.28 
 
 		 282 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.603872  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0210  aldo/keto reductase  40.38 
 
 		 268 aa  207  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1378  2,5-didehydrogluconate reductase  42.28 
 
 		 282 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4697  2,5-didehydrogluconate reductase  40.61 
 
 		 282 aa  207  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.973362  normal  0.111177 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0519  2,5-didehydrogluconate reductase  42.63 
 
 		 275 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00901409  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1394  2,5-didehydrogluconate reductase  40.59 
 
 		 282 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0204  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.38 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3895  aldo/keto reductase  39.19 
 
 		 274 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.216872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1501  2,5-didehydrogluconate reductase  41.06 
 
 		 274 aa  206  3e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0299  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.78 
 
 		 274 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2228  aldo/keto reductase  40.82 
 
 		 274 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0211  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.38 
 
 		 267 aa  205  6e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0362263  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3458  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.38 
 
 		 267 aa  205  7e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.412559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0213  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.38 
 
 		 267 aa  204  9e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0554444  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4912  aldo/keto reductase  40.96 
 
 		 277 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0232607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0220  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.75 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.167357  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3401  aldo/keto reductase  40.38 
 
 		 267 aa  203  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00205  hypothetical protein  40 
 
 		 267 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.125752  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00200  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40 
 
 		 267 aa  203  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148488  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2058  aldo/keto reductase  40.07 
 
 		 274 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2041  aldo/keto reductase  40.96 
 
 		 272 aa  203  3e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.962738  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0285  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.41 
 
 		 274 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0293  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.78 
 
 		 274 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.896057 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2214  aldo/keto reductase  43.73 
 
 		 268 aa  202  4e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5462  aldo/keto reductase  41.63 
 
 		 276 aa  201  9e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1380  2,5-didehydrogluconate reductase  40.8 
 
 		 275 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2232  aldo/keto reductase  40.07 
 
 		 274 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0084  aldo/keto reductase  42.8 
 
 		 276 aa  199  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03276  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.39 
 
 		 246 aa  199  5e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3671  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.7 
 
 		 274 aa  199  5e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  0.0165196 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1615  2,5-didehydrogluconate reductase  42.75 
 
 		 272 aa  198  6e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.808798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3899  aldo/keto reductase  41.57 
 
 		 269 aa  198  9e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.986138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0280  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.78 
 
 		 274 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2581  2,5-didehydrogluconate reductase  38.93 
 
 		 282 aa  196  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1769  2,5-didehydrogluconate reductase  39.15 
 
 		 281 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.904108  normal  0.360608 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0278  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.25 
 
 		 267 aa  195  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3534  2,5-didehydrogluconate reductase  42.25 
 
 		 272 aa  195  7e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  0.675115 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1180  aldo/keto reductase  38.11 
 
 		 267 aa  195  8.000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1082  aldo/keto reductase  40.98 
 
 		 274 aa  194  1e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1038  aldo/keto reductase  40.98 
 
 		 274 aa  194  1e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06660  aldo/keto reductase, diketogulonate reductase  40.7 
 
 		 277 aa  193  2e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3984  aldo/keto reductase  39.09 
 
 		 277 aa  193  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>