More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0580 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0580  aldo/keto reductase  100 
 
 		 275 aa  564  1e-160  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2717  aldo/keto reductase  68.25 
 
 		 274 aa  404  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3052  aldo/keto reductase  63.27 
 
 		 274 aa  358  4e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2929  aldo/keto reductase  58.39 
 
 		 274 aa  328  5.0000000000000004e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0288  2,5-didehydrogluconate reductase  48.91 
 
 		 274 aa  285  5e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.206569  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3339  2,5-didehydrogluconate reductase  49.27 
 
 		 272 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2432  2,5-didehydrogluconate reductase  47.81 
 
 		 272 aa  277  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812147  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4789  putative aldo/keto reductase  47.45 
 
 		 272 aa  272  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3571  aldo/keto reductase  49.08 
 
 		 277 aa  272  3e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3073  2,5-didehydrogluconate reductase  47.81 
 
 		 272 aa  268  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2381  2,5-didehydrogluconate reductase  44.53 
 
 		 272 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308673  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0368  aldo/keto reductase  50.55 
 
 		 279 aa  255  5e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.67539  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1154  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.71 
 
 		 283 aa  245  6e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.254496  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1880  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  47.01 
 
 		 267 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1990  aldo/keto reductase  47.43 
 
 		 286 aa  244  1.9999999999999999e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1975  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.9 
 
 		 267 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  0.128704 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3327  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.52 
 
 		 267 aa  241  7e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1167  aldo/keto reductase  46.09 
 
 		 277 aa  240  2e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.23428 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0240  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  47.58 
 
 		 268 aa  240  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2368  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  44.78 
 
 		 267 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5116  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  46.64 
 
 		 267 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745449  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2695  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  48.13 
 
 		 268 aa  239  4e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3351  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  47.94 
 
 		 268 aa  239  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0904766 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09980  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  46.72 
 
 		 272 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00527099  normal  0.878507 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1329  aldo/keto reductase  42.34 
 
 		 274 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245506  normal  0.195487 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0556  aldo/keto reductase  47.2 
 
 		 277 aa  236  4e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6096  aldo/keto reductase  46.35 
 
 		 268 aa  236  4e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1306  aldo/keto reductase  43.54 
 
 		 274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0925  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.99 
 
 		 272 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5298  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  46.47 
 
 		 268 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.222173 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5450  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  46.84 
 
 		 268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4753  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  46.84 
 
 		 268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10147  normal  0.725846 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4858  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  46.84 
 
 		 268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5283  aldo/keto reductase  44.77 
 
 		 282 aa  233  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0154862 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5412  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  46.84 
 
 		 268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948984  decreased coverage  0.00302815 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0422  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  46.47 
 
 		 268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495467  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2153  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  46.47 
 
 		 268 aa  233  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5364  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  45.15 
 
 		 267 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2108  aldo/keto reductase  42.16 
 
 		 282 aa  232  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2306  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  47.01 
 
 		 268 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0833333  hitchhiker  0.000000150497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4776  aldo/keto reductase  41.97 
 
 		 274 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0945  aldo/keto reductase  43.27 
 
 		 273 aa  230  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3895  aldo/keto reductase  40.88 
 
 		 274 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.216872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0287  2,5-didehydrogluconate reductase  45.69 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.941845 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0299  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  44.65 
 
 		 274 aa  226  4e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2232  aldo/keto reductase  41.67 
 
 		 274 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1865  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.54 
 
 		 267 aa  223  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1316  aldo/keto reductase  44.19 
 
 		 271 aa  224  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.904393  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3899  aldo/keto reductase  44.81 
 
 		 269 aa  222  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.986138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0285  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.54 
 
 		 274 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0293  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.54 
 
 		 274 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.896057 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1048  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.66 
 
 		 267 aa  219  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00311623  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1101  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.66 
 
 		 267 aa  219  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3458  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.07 
 
 		 267 aa  218  6e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.412559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0213  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.07 
 
 		 267 aa  218  7e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0554444  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0220  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.45 
 
 		 267 aa  218  7e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.167357  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3401  aldo/keto reductase  43.07 
 
 		 267 aa  218  8.999999999999998e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0068  aldo/keto reductase  45.32 
 
 		 267 aa  217  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00200  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.7 
 
 		 267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148488  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0210  aldo/keto reductase  44.03 
 
 		 268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00205  hypothetical protein  42.7 
 
 		 267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.125752  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0222  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.7 
 
 		 267 aa  215  5e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0705129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0211  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.32 
 
 		 267 aa  215  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0362263  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0204  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.7 
 
 		 267 aa  215  5.9999999999999996e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0280  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.54 
 
 		 274 aa  215  5.9999999999999996e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2228  aldo/keto reductase  40.07 
 
 		 274 aa  214  8e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0904  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  41.79 
 
 		 267 aa  214  8e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2041  aldo/keto reductase  43.78 
 
 		 272 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.962738  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4134  aldo/keto reductase  41.3 
 
 		 273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0278  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.66 
 
 		 267 aa  213  3.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2058  aldo/keto reductase  40.22 
 
 		 274 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02282  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.67 
 
 		 267 aa  211  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3671  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.85 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  0.0165196 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1800  2,5-didehydrogluconate reductase  42.97 
 
 		 282 aa  210  2e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.195279  hitchhiker  0.00925516 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2445  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.15 
 
 		 273 aa  209  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0183  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.15 
 
 		 275 aa  206  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.285008  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1160  2,5-didehydrogluconate reductase  42.31 
 
 		 276 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0519  2,5-didehydrogluconate reductase  42.63 
 
 		 275 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00901409  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1380  2,5-didehydrogluconate reductase  42.35 
 
 		 275 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1180  aldo/keto reductase  40.07 
 
 		 267 aa  202  5e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0164  aldo/keto reductase family oxidoreductase  40.77 
 
 		 357 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.432724  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02792  probable oxidoreductase  40.93 
 
 		 278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03276  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  44.08 
 
 		 246 aa  200  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38150  Aldo/keto reductase  39.85 
 
 		 277 aa  199  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.451685  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7952  2,5-didehydrogluconate reductase  42.06 
 
 		 270 aa  199  3.9999999999999996e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3547  2,5-didehydrogluconate reductase  40.46 
 
 		 278 aa  199  5e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.802476  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4912  aldo/keto reductase  37.59 
 
 		 277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0232607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3013  2,5-didehydrogluconate reductase  39.62 
 
 		 276 aa  196  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.856221  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0578  aldo/keto reductase  40.96 
 
 		 276 aa  195  7e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.113038  normal  0.346661 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3599  aldo/keto reductase  41.22 
 
 		 280 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1501  2,5-didehydrogluconate reductase  39.08 
 
 		 274 aa  194  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3214  2,5-didehydrogluconate reductase  41.73 
 
 		 280 aa  194  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00515928  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5462  aldo/keto reductase  39.77 
 
 		 276 aa  192  5e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4207  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  40.55 
 
 		 275 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4697  2,5-didehydrogluconate reductase  37.88 
 
 		 282 aa  191  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.973362  normal  0.111177 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2042  aldo/keto reductase  37.69 
 
 		 280 aa  190  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1297  2,5-didehydrogluconate reductase  38.74 
 
 		 280 aa  189  4e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.140644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1030  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  39.76 
 
 		 275 aa  189  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3853  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.84 
 
 		 312 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.230626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4006  aldo/keto reductase family oxidoreductase  39.84 
 
 		 275 aa  188  9e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000973326  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>