More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3073 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3073  2,5-didehydrogluconate reductase  100 
 
 		 272 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2381  2,5-didehydrogluconate reductase  81.62 
 
 		 272 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308673  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3571  aldo/keto reductase  81.11 
 
 		 277 aa  471  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3339  2,5-didehydrogluconate reductase  73.9 
 
 		 272 aa  437  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2432  2,5-didehydrogluconate reductase  70.59 
 
 		 272 aa  419  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812147  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4789  putative aldo/keto reductase  69.12 
 
 		 272 aa  414  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0288  2,5-didehydrogluconate reductase  50.92 
 
 		 274 aa  286  2e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.206569  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2717  aldo/keto reductase  49.64 
 
 		 274 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.158921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0580  aldo/keto reductase  47.81 
 
 		 275 aa  268  5e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1167  aldo/keto reductase  50 
 
 		 277 aa  266  4e-70  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.23428 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0368  aldo/keto reductase  49.81 
 
 		 279 aa  257  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.67539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1990  aldo/keto reductase  50.79 
 
 		 286 aa  254  8e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3052  aldo/keto reductase  45.42 
 
 		 274 aa  249  3e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0556  aldo/keto reductase  46.88 
 
 		 277 aa  239  2.9999999999999997e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6096  aldo/keto reductase  46.52 
 
 		 268 aa  235  6e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.118169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2108  aldo/keto reductase  45.39 
 
 		 282 aa  232  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2929  aldo/keto reductase  42.86 
 
 		 274 aa  229  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1306  aldo/keto reductase  42.97 
 
 		 274 aa  228  9e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.798961  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2445  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  43.22 
 
 		 273 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5283  aldo/keto reductase  43.82 
 
 		 282 aa  221  9.999999999999999e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0154862 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5116  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.86 
 
 		 267 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.745449  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1329  aldo/keto reductase  39.93 
 
 		 274 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.245506  normal  0.195487 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2041  aldo/keto reductase  43.5 
 
 		 272 aa  211  1e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.962738  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0287  2,5-didehydrogluconate reductase  44.36 
 
 		 277 aa  208  8e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.816728  normal  0.941845 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4776  aldo/keto reductase  40.66 
 
 		 274 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.368358  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02282  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.25 
 
 		 267 aa  207  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.418989  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1316  aldo/keto reductase  41.13 
 
 		 271 aa  207  2e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.904393  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02792  probable oxidoreductase  39.43 
 
 		 278 aa  206  3e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3895  aldo/keto reductase  40.29 
 
 		 274 aa  205  7e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.216872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0904  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.11 
 
 		 267 aa  204  9e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0925  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  41.18 
 
 		 272 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816676  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1154  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  41.95 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.254496  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1865  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.07 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2058  aldo/keto reductase  41.73 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3671  aldo/keto reductase family oxidoreductase  41.73 
 
 		 274 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.144397  normal  0.0165196 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5364  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  41.33 
 
 		 267 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0222  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.85 
 
 		 267 aa  203  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0705129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0204  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.85 
 
 		 267 aa  203  3e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1975  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40 
 
 		 267 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399005  normal  0.128704 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4697  2,5-didehydrogluconate reductase  41.44 
 
 		 282 aa  203  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.973362  normal  0.111177 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2306  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.98 
 
 		 268 aa  202  4e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0833333  hitchhiker  0.000000150497 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3327  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40 
 
 		 267 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0519  2,5-didehydrogluconate reductase  42.8 
 
 		 275 aa  202  6e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00901409  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3458  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.85 
 
 		 267 aa  202  7e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.412559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0299  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.22 
 
 		 274 aa  202  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2368  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40 
 
 		 267 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2228  aldo/keto reductase  40.82 
 
 		 274 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.53028 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0220  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.22 
 
 		 267 aa  201  9e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.167357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0211  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.85 
 
 		 267 aa  201  9e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0362263  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1880  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.38 
 
 		 267 aa  201  9e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3401  aldo/keto reductase  39.85 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1380  2,5-didehydrogluconate reductase  42.4 
 
 		 275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2695  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.6 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0578  aldo/keto reductase  41.98 
 
 		 276 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.113038  normal  0.346661 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0213  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.48 
 
 		 267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0554444  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00200  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.48 
 
 		 267 aa  199  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.148488  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00205  hypothetical protein  39.48 
 
 		 267 aa  199  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.125752  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4912  aldo/keto reductase  40.96 
 
 		 277 aa  199  5e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0232607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09980  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  41.33 
 
 		 272 aa  199  5e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00527099  normal  0.878507 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0422  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.75 
 
 		 268 aa  198  6e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.495467  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38150  Aldo/keto reductase  41.97 
 
 		 277 aa  198  7.999999999999999e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.451685  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1160  2,5-didehydrogluconate reductase  43.12 
 
 		 276 aa  198  7.999999999999999e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0672  aldo/keto reductase  40.96 
 
 		 280 aa  198  9e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.851781  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0285  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.85 
 
 		 274 aa  198  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2232  aldo/keto reductase  40.45 
 
 		 274 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3351  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  41.35 
 
 		 268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0904766 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5462  aldo/keto reductase  41.15 
 
 		 276 aa  196  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0293  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.48 
 
 		 274 aa  196  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.896057 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2153  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40 
 
 		 268 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1360  2,5-didehydrogluconate reductase  40.68 
 
 		 282 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.603872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1378  2,5-didehydrogluconate reductase  40.68 
 
 		 282 aa  196  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1615  2,5-didehydrogluconate reductase  41.96 
 
 		 272 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.808798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0240  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.93 
 
 		 268 aa  195  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0861  aldo/keto reductase  40.46 
 
 		 274 aa  194  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.274237  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0278  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  40.15 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4134  aldo/keto reductase  36.74 
 
 		 273 aa  194  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1394  2,5-didehydrogluconate reductase  40.3 
 
 		 282 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1082  aldo/keto reductase  40.45 
 
 		 274 aa  193  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2042  aldo/keto reductase  38.8 
 
 		 280 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2582  aldo/keto reductase  41.77 
 
 		 276 aa  193  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0247931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1038  aldo/keto reductase  40.45 
 
 		 274 aa  193  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4225  oxidoreductase  38.17 
 
 		 276 aa  193  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4858  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.55 
 
 		 268 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5450  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.55 
 
 		 268 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5412  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  39.55 
 
 		 268 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.948984  decreased coverage  0.00302815 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0068  aldo/keto reductase  41.35 
 
 		 267 aa  192  5e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4086  aldo/keto reductase  41.15 
 
 		 276 aa  192  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.968066 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0945  aldo/keto reductase  39.54 
 
 		 273 aa  191  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0280  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  42.36 
 
 		 274 aa  191  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0210  aldo/keto reductase  37.74 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3899  aldo/keto reductase  39.78 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.986138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2028  2,5-didehydrogluconate reductase  40.96 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3900  aldo/keto reductase  40.08 
 
 		 308 aa  190  2e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.835176  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0968  aldo/keto reductase  40.77 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1769  2,5-didehydrogluconate reductase  39.16 
 
 		 281 aa  190  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.904108  normal  0.360608 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3013  2,5-didehydrogluconate reductase  38.31 
 
 		 276 aa  190  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.856221  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3547  2,5-didehydrogluconate reductase  39.45 
 
 		 278 aa  189  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.802476  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5298  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  38.43 
 
 		 268 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.222173 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1850  2,5-didehydrogluconate reductase  42.26 
 
 		 277 aa  189  5e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.671813  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4753  2,5-diketo-D-gluconate reductase B  38.81 
 
 		 268 aa  188  9e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10147  normal  0.725846 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>