More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5973 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_5973  ABC transporter related  100 
 
 		 254 aa  513  1e-144  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0262  ABC transporter related  76.28 
 
 		 254 aa  391  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3658  ABC transporter related  75.2 
 
 		 254 aa  387  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3978  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  74.8 
 
 		 254 aa  384  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.1221  decreased coverage  0.00203887 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  63.31 
 
 		 254 aa  335  5e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2168  ABC transporter related  54.4 
 
 		 274 aa  283  2.0000000000000002e-75  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  47.2 
 
 		 264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  47.6 
 
 		 265 aa  240  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2495  ABC transporter related protein  48.58 
 
 		 271 aa  238  8e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.503368  normal  0.0315467 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1208  ABC transporter related  47.79 
 
 		 270 aa  237  1e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0321335  normal  0.470514 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  46.8 
 
 		 259 aa  232  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  44.8 
 
 		 256 aa  227  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2551  ABC transporter-related protein  45.97 
 
 		 256 aa  227  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  44.98 
 
 		 271 aa  223  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0837  ABC transporter related  45.6 
 
 		 255 aa  221  8e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  45.78 
 
 		 276 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2653  ABC transporter-like protein  44.13 
 
 		 268 aa  219  3.9999999999999997e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000291563  hitchhiker  0.00412304 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  42.63 
 
 		 251 aa  218  5e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2474  ABC transporter related  43.08 
 
 		 257 aa  218  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  45.17 
 
 		 257 aa  217  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  44.8 
 
 		 255 aa  217  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1877  ABC transporter-related protein  42.97 
 
 		 260 aa  215  5e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0761  ABC transporter-related protein  43.82 
 
 		 258 aa  215  5e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000105936 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  44.71 
 
 		 257 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0642  ABC transporter related  43.48 
 
 		 278 aa  214  8e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  42.8 
 
 		 256 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  45.02 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0355  ABC transporter related  43.72 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  44.8 
 
 		 250 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42 
 
 		 256 aa  214  1.9999999999999998e-54  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0365  ABC transporter related  45.24 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000174953  unclonable  0.0000000581692 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2710  ABC transporter related  42.97 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.868345  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3362  ABC transporter related  42.97 
 
 		 260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.557965 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  45.06 
 
 		 255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  44.88 
 
 		 260 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2218  ABC transporter related  39.68 
 
 		 274 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  42.8 
 
 		 255 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2127  ABC transporter related  43.82 
 
 		 250 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0953  ABC transporter related  40.08 
 
 		 274 aa  210  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.513158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2278  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.08 
 
 		 279 aa  210  2e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3794  ABC transporter related  41.83 
 
 		 255 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  44.4 
 
 		 250 aa  209  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2103  ABC transporter related  41.77 
 
 		 257 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4421  ABC transporter related  42.63 
 
 		 259 aa  209  3e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11811  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4072  ABC transporter related  43.2 
 
 		 261 aa  209  3e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1125  putative ABC transporter ATP-binding protein  42.23 
 
 		 258 aa  209  4e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334087  normal  0.177035 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1731  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.76 
 
 		 250 aa  208  5e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.385774  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3206  ABC transporter related  42.23 
 
 		 255 aa  208  6e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204307  normal  0.785488 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1674  ABC transporter related  43.6 
 
 		 251 aa  208  6e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  40.96 
 
 		 258 aa  208  7e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  42.57 
 
 		 258 aa  208  8e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  42.57 
 
 		 258 aa  208  8e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.49 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2438  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.57 
 
 		 257 aa  207  1e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  41.37 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1290  ABC transporter related  41.37 
 
 		 257 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  42.34 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0111  ABC transporter related  44.66 
 
 		 257 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.683249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0064  ABC transporter related  46.03 
 
 		 265 aa  206  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.220859 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0357  ABC transporter related  43.08 
 
 		 261 aa  205  4e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5536  ABC transporter related  42.69 
 
 		 258 aa  205  5e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2394  ABC transporter related  43.68 
 
 		 262 aa  205  6e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3003  ABC transporter related  42.86 
 
 		 271 aa  204  7e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.727934  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2999  ABC transporter related  42.57 
 
 		 264 aa  204  1e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.156321  normal  0.553322 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2318  ABC transporter related protein  44.35 
 
 		 589 aa  204  1e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4097  ABC transporter related  42.75 
 
 		 292 aa  203  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.362688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  43.15 
 
 		 275 aa  203  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3170  ABC transporter related  42.57 
 
 		 256 aa  203  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.181916  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  42.52 
 
 		 273 aa  202  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  43.15 
 
 		 275 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  43.15 
 
 		 275 aa  203  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  41.53 
 
 		 258 aa  202  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  41.53 
 
 		 258 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  39.68 
 
 		 255 aa  202  4e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1425  ABC transporter related  42 
 
 		 253 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.715565  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0097  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.23 
 
 		 302 aa  202  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.232532 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  41.53 
 
 		 258 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  41.53 
 
 		 258 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.13 
 
 		 258 aa  202  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  41.94 
 
 		 258 aa  202  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  41.94 
 
 		 261 aa  202  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0475  ABC transporter related  42.8 
 
 		 256 aa  202  5e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2477  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  41.04 
 
 		 255 aa  202  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  40.56 
 
 		 256 aa  202  5e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  42.4 
 
 		 255 aa  202  6e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3057  ABC transporter related  42.34 
 
 		 334 aa  202  6e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0799758  hitchhiker  0.0000824418 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  39.37 
 
 		 259 aa  202  6e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5352  ABC transporter related  45.38 
 
 		 264 aa  201  7e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.03 
 
 		 254 aa  201  8e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5693  ABC transporter related  44.05 
 
 		 271 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0103926 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3501  ABC transporter related  41.34 
 
 		 282 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.111605  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1662  ABC transporter related  42.86 
 
 		 243 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3571  ABC transporter related  42.74 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0233348 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  41.6 
 
 		 256 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  42.06 
 
 		 255 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  43.7 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0836  ABC transporter-related protein  41.94 
 
 		 253 aa  199  3e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0470  ABC transporter-like  42.23 
 
 		 259 aa  199  3e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.451824  normal  0.105084 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1260  ABC transporter related  40.49 
 
 		 256 aa  199  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  40.65 
 
 		 288 aa  199  3e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>