More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_p840_70 on replicon NC_011311
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011311  VSAL_p840_70  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  507  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1113  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39 
 
 
264 aa  186  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3788  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.21 
 
 
264 aa  177  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2415  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.29 
 
 
255 aa  97.4  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0149136  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26 
 
 
253 aa  95.5  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.196322  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.02 
 
 
261 aa  86.7  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.85 
 
 
261 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.8 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00435006  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0679  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.37 
 
 
228 aa  72  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.66 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.274647 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.05 
 
 
263 aa  72  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.544381  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.11 
 
 
260 aa  72.4  0.000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.81 
 
 
262 aa  71.2  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.3 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.92 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154867  normal  0.0871554 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1077  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.44 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.11 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  19.76 
 
 
262 aa  67.8  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02266  putative 3-hydroxybutyrate dehydrogenase  24.11 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1151  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  23.23 
 
 
234 aa  67.8  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.256582 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  19.85 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  21.83 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  21.03 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.199007  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  21.91 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0333473 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1298  2-deoxy-D-gluconate 3-dehydrogenase  22.49 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.145366  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4328  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.27 
 
 
294 aa  65.9  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1976  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  24.6 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3570  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  21.05 
 
 
259 aa  64.7  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00199675 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2816  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  23.64 
 
 
257 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04161  putative dehydrogenase  25.38 
 
 
254 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1440  short chain dehydrogenase  26.09 
 
 
250 aa  63.2  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.637118  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3257  putative 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  22.75 
 
 
259 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0566153  normal  0.418945 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0325  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.1 
 
 
271 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1646  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.03 
 
 
237 aa  62.4  0.000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5619  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  21.62 
 
 
277 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0753007  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0791  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.71 
 
 
238 aa  62.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.1335 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1580  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.64 
 
 
237 aa  62.4  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4114  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.03 
 
 
259 aa  62.4  0.000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.245647 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6446  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.88 
 
 
259 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00522333  unclonable  4.08177e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4208  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  25.68 
 
 
248 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5639  short chain dehydrogenase  25 
 
 
250 aa  61.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.308131  hitchhiker  0.00207751 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4091  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  24.68 
 
 
258 aa  60.8  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.894673  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  21.54 
 
 
259 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  21.54 
 
 
259 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.400056 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  20.23 
 
 
264 aa  60.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.933978  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.9 
 
 
248 aa  60.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0423365  hitchhiker  0.00643231 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1768  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase NodG  23.32 
 
 
245 aa  60.5  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.323162  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2180  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  23.17 
 
 
234 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2505  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  20.16 
 
 
262 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.80685  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0610  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  23.42 
 
 
268 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1017  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  22.53 
 
 
325 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  21.54 
 
 
285 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0641216  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  18.9 
 
 
263 aa  59.7  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1097  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase  25.29 
 
 
248 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.434868  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4625  short chain dehydrogenase  23.2 
 
 
249 aa  59.3  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.402352  normal  0.18483 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7138  short chain dehydrogenase  23.62 
 
 
260 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.998532  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1324  D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase  20.93 
 
 
260 aa  59.7  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  21.65 
 
 
251 aa  59.7  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1208  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.15 
 
 
278 aa  59.3  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0664091 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.29 
 
 
259 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.861645  normal  0.226141 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1537  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.92 
 
 
259 aa  59.3  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.460679  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  21.18 
 
 
264 aa  59.3  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4922  short chain dehydrogenase  25.2 
 
 
248 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06178  dehydrogenase with different specificities  21.43 
 
 
250 aa  58.9  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0668651  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00988  dehydrogenase with different specificities  21.43 
 
 
250 aa  58.9  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2571  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  22.66 
 
 
239 aa  58.9  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0716578  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25 
 
 
250 aa  58.9  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  21.05 
 
 
261 aa  58.5  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.203638  normal  0.0877648 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2301  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.23 
 
 
234 aa  58.5  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1129  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.42 
 
 
254 aa  58.5  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.40266  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0571  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  22.44 
 
 
245 aa  58.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.653945  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  20.93 
 
 
266 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  27.1 
 
 
249 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1638  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.03 
 
 
269 aa  58.5  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0480  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  20.08 
 
 
251 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.81 
 
 
265 aa  57.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.254427 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1210  putative 3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  23.57 
 
 
260 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.475284  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.23 
 
 
259 aa  57.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.560822  normal  0.0105475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  20.86 
 
 
250 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0112  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.2 
 
 
263 aa  57.8  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.56 
 
 
277 aa  57  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0837629  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3440  putative short chain dehydrogenase  22.52 
 
 
261 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.83 
 
 
254 aa  57  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2277  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  20 
 
 
259 aa  57  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.44 
 
 
254 aa  57  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5774  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  19.92 
 
 
266 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.98 
 
 
253 aa  57  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237012  normal  0.451819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2496  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  22.27 
 
 
235 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2971  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  18.9 
 
 
254 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2753  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  24.62 
 
 
260 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.53957  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5846  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.84 
 
 
262 aa  56.6  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.704953 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.13 
 
 
253 aa  56.6  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3075  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  23.94 
 
 
262 aa  56.6  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209308  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3085  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.52 
 
 
261 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.696622  normal  0.57076 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2450  short chain dehydrogenase  25.1 
 
 
248 aa  55.8  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00157623  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1790  short chain dehydrogenase  23.11 
 
 
254 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156193  normal  0.309102 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3053  oxidoreductase  22.88 
 
 
260 aa  55.8  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.42458  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1346  3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase (3-ketoacyl-acyl carrier protein reductase)  24.42 
 
 
248 aa  55.8  0.0000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1510  short chain dehydrogenase  23.11 
 
 
249 aa  55.8  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.360234 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3264  acetoin dehydrogenase  20.29 
 
 
253 aa  55.5  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0298905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>