More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2908 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
264 aa  508  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.933978  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3658  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.46 
 
 
250 aa  193  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.27 
 
 
253 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000354255 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3070  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.09 
 
 
254 aa  186  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.131558 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.04 
 
 
253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.435336  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2415  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.09 
 
 
255 aa  163  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0149136  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
253 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.196322  normal  0.805943 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1799  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 
261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.23 
 
 
262 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0311  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.27 
 
 
262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0923  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.68 
 
 
261 aa  125  5e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0092  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.73 
 
 
261 aa  124  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.658304  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.5 
 
 
262 aa  122  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0112  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.13 
 
 
263 aa  119  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
247 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.417621 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2072  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.29 
 
 
259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.66 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.85 
 
 
234 aa  116  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.590159  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1226  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.72 
 
 
263 aa  117  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2263  short chain dehydrogenase  34.11 
 
 
255 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00829126  normal  0.0703688 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0816  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.72 
 
 
271 aa  116  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0462  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.99 
 
 
267 aa  115  5e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07435  putative short-chain dehydrogenase/reductase  30.71 
 
 
269 aa  115  6e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.492431  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3588  hypothetical protein  33.06 
 
 
254 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.00208776  normal  0.410255 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2757  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00507501  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3817  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  31.58 
 
 
247 aa  113  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000217117  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
265 aa  113  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.602708  normal  0.800249 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2036  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.68 
 
 
258 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3257  putative 3-oxoacyl-acyl carrier protein reductase  35.02 
 
 
259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0566153  normal  0.418945 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 
260 aa  112  6e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1545  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.12 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00435006  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.18 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.288132 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
259 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.154867  normal  0.0871554 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 
262 aa  110  3e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 
254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.64 
 
 
260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1017  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.63 
 
 
325 aa  108  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.43 
 
 
259 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0333473 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6446  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.05 
 
 
259 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00522333  unclonable  4.08177e-18 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1300  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.4 
 
 
262 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5619  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.36 
 
 
277 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0753007  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2119  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.83 
 
 
257 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.88 
 
 
259 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.861645  normal  0.226141 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2101  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.45 
 
 
253 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.044107  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.68 
 
 
254 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 
264 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.37 
 
 
276 aa  107  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3830  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
259 aa  107  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2039  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 
255 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0111409  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4356  short chain dehydrogenase  35.08 
 
 
254 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4626  short chain dehydrogenase  34.27 
 
 
254 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130325  normal  0.180414 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2062  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 
256 aa  105  5e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.624972 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 
259 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.400056 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1080  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.47 
 
 
276 aa  105  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0130  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.84 
 
 
259 aa  105  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000437524  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1606  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.1 
 
 
231 aa  105  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.39 
 
 
261 aa  105  9e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4257  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.8 
 
 
262 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0797349  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.35 
 
 
263 aa  104  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.544381  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
259 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.47 
 
 
257 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2505  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 
262 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.80685  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1680  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
285 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0641216  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4144  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 
234 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.312324 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1178  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.98 
 
 
262 aa  103  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4610  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.77 
 
 
234 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.906179 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1388  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.63 
 
 
259 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.82 
 
 
265 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3607  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 
261 aa  103  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.197864  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.59 
 
 
250 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.328906 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2330  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
259 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2208  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.46 
 
 
259 aa  102  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.336154  normal  0.942948 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3570  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.82 
 
 
259 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00199675 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1992  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.56 
 
 
362 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00359465  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2667  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  27.67 
 
 
249 aa  102  5e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000680764  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2723  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  31.56 
 
 
255 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.849254  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1344  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.2 
 
 
246 aa  102  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.118162  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2554  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 
258 aa  102  8e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.465274  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1510  short chain dehydrogenase  29.96 
 
 
249 aa  102  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.360234 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2383  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.01 
 
 
263 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.378112  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1518  short chain dehydrogenase  33.2 
 
 
254 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0138518 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1882  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.24 
 
 
259 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0800306  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1983  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.01 
 
 
263 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6972  short chain dehydrogenase  31.54 
 
 
251 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6233  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
262 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.220115  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
262 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.245464  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0361  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.24 
 
 
259 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0730868  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6635  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.07 
 
 
262 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.242399  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1243  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.24 
 
 
259 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00809972  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1078  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.24 
 
 
259 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.296983  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0789  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.24 
 
 
259 aa  101  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0355352  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1234  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.24 
 
 
259 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
261 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.274647 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.2 
 
 
251 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755812  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.24 
 
 
259 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.198291 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1494  short chain dehydrogenase  33.46 
 
 
255 aa  101  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000180405  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4522  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.91 
 
 
261 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1803  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 
262 aa  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1220  short chain dehydrogenase  35.63 
 
 
254 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0140677 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3177  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.95 
 
 
258 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.567568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>