More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000690 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000690  ABC-type uncharacterized transport system component  100 
 
 		 555 aa  1148    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001577  ABC-type uncharacterized transport system component  36.78 
 
 		 551 aa  398  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.826243  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1024  putative ABC transporter, substrate-binding protein  31.96 
 
 		 579 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0932  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  28.32 
 
 		 579 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0935  putative ABC transporter, substrate-binding protein  31.01 
 
 		 579 aa  133  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.13566e-23 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0748  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  31.65 
 
 		 579 aa  133  9e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0230399  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0895  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.91 
 
 		 586 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0743  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  30.64 
 
 		 579 aa  130  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601164  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0616  transcriptional regulator SgrR  24 
 
 		 551 aa  129  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0296144 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0799  ABC transporter substrate-binding protein  30.98 
 
 		 579 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0839  ABC transporter substrate-binding protein  30.98 
 
 		 579 aa  128  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.689681  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3616  transcriptional regulator SgrR  27.91 
 
 		 552 aa  126  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.455862  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0115  transcriptional regulator SgrR  28.03 
 
 		 552 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0118  transcriptional regulator SgrR  28.03 
 
 		 552 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217334  normal  0.271533 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0122  transcriptional regulator SgrR  28.03 
 
 		 552 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0122  transcriptional regulator SgrR  28.03 
 
 		 552 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.40957  decreased coverage  0.00940564 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0117  transcriptional regulator SgrR  28.03 
 
 		 552 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.947764  normal  0.240994 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0074  transcriptional regulator SgrR  26.64 
 
 		 551 aa  124  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3805  transcriptional regulator SgrR  27.91 
 
 		 552 aa  124  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0076  transcriptional regulator SgrR  26.64 
 
 		 552 aa  124  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0062  transcriptional regulator SgrR  26.64 
 
 		 551 aa  124  6e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3588  transcriptional regulator SgrR  26.64 
 
 		 551 aa  124  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000489241 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0072  transcriptional regulator SgrR  26.64 
 
 		 551 aa  124  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0074  transcriptional regulator SgrR  26.64 
 
 		 552 aa  124  6e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.492998 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00071  DNA-binding transcriptional regulator  26.64 
 
 		 551 aa  123  7e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00070  hypothetical protein  26.64 
 
 		 551 aa  123  7e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2687  solute-binding family 5 protein  24.44 
 
 		 578 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.240712  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2612  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein  24.47 
 
 		 578 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.808743  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2881  solute-binding family 5 protein  24.44 
 
 		 578 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629347  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0738  transcriptional regulator SgrR  24.25 
 
 		 553 aa  121  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2898  extracellular solute-binding protein  23.6 
 
 		 578 aa  120  7e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0908192  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2884  extracellular solute-binding protein  24.3 
 
 		 578 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0154142 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2689  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 571 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.377797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2636  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein  24.3 
 
 		 578 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0624  transcriptional regulator SgrR  25.75 
 
 		 553 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.172958  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3540  transcriptional regulator SgrR  24.19 
 
 		 553 aa  119  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2942  transcriptional regulator SgrR  24.19 
 
 		 553 aa  119  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.940242 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3411  transcriptional regulator SgrR  24.19 
 
 		 553 aa  119  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0521  hypothetical protein  25.96 
 
 		 565 aa  117  6e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05812  hypothetical protein  27.8 
 
 		 568 aa  117  7.999999999999999e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2347  extracellular solute-binding protein  23.09 
 
 		 578 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0243341  normal  0.0193694 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0585  transcriptional regulator SgrR  21.76 
 
 		 555 aa  113  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1552  extracellular solute-binding protein  22.46 
 
 		 563 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.851364 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000178  SgrR sugar-phosphate stress transcriptional activator of SgrS small RNA  26.77 
 
 		 569 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.976786  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2932  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 		 578 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000417004  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4249  HTH-type transcriptional regulator SgrR  25.26 
 
 		 596 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4069  HTH-type transcriptional regulator SgrR  25.61 
 
 		 596 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4191  HTH-type transcriptional regulator SgrR  25.26 
 
 		 596 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.415119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4085  HTH-type transcriptional regulator SgrR  25.26 
 
 		 596 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2920  solute-binding family 5 protein  22.78 
 
 		 578 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00308535  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4141  HTH-type transcriptional regulator SgrR  24.91 
 
 		 596 aa  99  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.898899  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2953  ABC transporter substrate-binding protein  22.42 
 
 		 554 aa  97.1  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0313683  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0653  putative extracellular solute-binding protein  24.39 
 
 		 569 aa  96.7  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001411  putative transport protein  24.52 
 
 		 585 aa  96.7  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1749  extracellular solute-binding protein family 5  33.73 
 
 		 538 aa  92.4  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1211  putative extracellular solute-binding protein  25.17 
 
 		 495 aa  91.3  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1253  hypothetical protein  23.27 
 
 		 637 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00065566  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1920  extracellular solute-binding protein  30.36 
 
 		 607 aa  84  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689476  normal  0.0152046 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06325  hypothetical protein  24.05 
 
 		 536 aa  81.6  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  29.45 
 
 		 489 aa  78.6  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0515  extracellular solute-binding protein, family 5  20.1 
 
 		 566 aa  77.4  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03322  hypothetical protein  21.29 
 
 		 589 aa  77  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4328  extracellular solute-binding protein family 5  26.92 
 
 		 551 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.310509  normal  0.0771259 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4268  extracellular solute-binding protein family 5  26.92 
 
 		 551 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0407  extracellular solute-binding protein family 5  32.18 
 
 		 528 aa  76.3  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00229954  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0559  extracellular solute-binding protein  19.93 
 
 		 566 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111824  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1097  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein, putative  28.04 
 
 		 518 aa  75.5  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1843  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  21.3 
 
 		 569 aa  75.5  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5772  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 		 534 aa  75.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.228919  normal  0.273878 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00397  predicted transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  20.14 
 
 		 566 aa  75.5  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3187  extracellular solute-binding protein  20.14 
 
 		 566 aa  75.5  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00401  hypothetical protein  20.14 
 
 		 566 aa  75.5  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  27.75 
 
 		 511 aa  75.5  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0505  extracellular solute-binding protein family 5  20.07 
 
 		 566 aa  74.7  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.679744  normal  0.144898 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  27.93 
 
 		 520 aa  74.7  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3881  extracellular solute-binding protein  32.76 
 
 		 515 aa  74.7  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.441306  normal  0.0413131 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0481  solute-binding family 5 protein  20.14 
 
 		 566 aa  74.3  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0368  extracellular solute-binding protein  20.14 
 
 		 566 aa  73.9  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3164  extracellular solute-binding protein family 5  20 
 
 		 566 aa  73.9  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0496  extracellular solute-binding protein, family 5  19.76 
 
 		 566 aa  73.9  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7194  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  35 
 
 		 528 aa  73.9  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169026  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0522  solute-binding family 5 protein  20.1 
 
 		 566 aa  73.9  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0612149  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0531  extracellular solute-binding protein  19.96 
 
 		 566 aa  73.9  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.585387  normal  0.74128 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0488  solute-binding family 5 protein  20.14 
 
 		 566 aa  73.9  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.189151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3226  extracellular solute-binding protein  22.01 
 
 		 567 aa  73.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3045  hypothetical protein  21.38 
 
 		 567 aa  73.2  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2105  extracellular solute-binding protein family 5  28.66 
 
 		 538 aa  72.4  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0251373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0161  extracellular solute-binding protein family 5  33.55 
 
 		 505 aa  72.8  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5289  ABC transporter  28.57 
 
 		 517 aa  72.8  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0912186  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2933  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC-type transport system periplasmic component  20 
 
 		 559 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000113765 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3084  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  21.83 
 
 		 567 aa  72  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0617058  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4211  extracellular solute-binding protein  29.34 
 
 		 504 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18790  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  35.22 
 
 		 540 aa  72  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00232176  normal  0.206883 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1313  extracellular solute-binding protein  30.43 
 
 		 493 aa  71.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2781  extracellular solute-binding protein family 5  28.37 
 
 		 519 aa  71.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.187703  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5381  ABC transporter substrate binding protein (dipeptide)  25.63 
 
 		 524 aa  71.6  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.121189  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  26.67 
 
 		 515 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  32.58 
 
 		 534 aa  70.9  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  30.91 
 
 		 494 aa  70.9  0.00000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  26.96 
 
 		 528 aa  70.1  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>