More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1843 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_1843  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  100 
 
 		 569 aa  1177    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0748  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.82 
 
 		 579 aa  206  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0230399  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0935  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.91 
 
 		 579 aa  206  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.13566e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1024  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.73 
 
 		 579 aa  205  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0895  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.09 
 
 		 586 aa  205  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0932  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  25.95 
 
 		 579 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0799  ABC transporter substrate-binding protein  25.55 
 
 		 579 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0839  ABC transporter substrate-binding protein  25.55 
 
 		 579 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.689681  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0743  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.27 
 
 		 579 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601164  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2689  extracellular solute-binding protein  26.68 
 
 		 571 aa  144  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.377797  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2347  extracellular solute-binding protein  26.38 
 
 		 578 aa  136  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0243341  normal  0.0193694 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2898  extracellular solute-binding protein  26.47 
 
 		 578 aa  134  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0908192  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2920  solute-binding family 5 protein  25.32 
 
 		 578 aa  128  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00308535  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2687  solute-binding family 5 protein  25.53 
 
 		 578 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.240712  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2881  solute-binding family 5 protein  25.53 
 
 		 578 aa  128  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629347  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2612  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein  25.53 
 
 		 578 aa  127  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.808743  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2884  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 		 578 aa  127  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0154142 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2636  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein  25.53 
 
 		 578 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2932  extracellular solute-binding protein  25.11 
 
 		 578 aa  126  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000417004  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1552  extracellular solute-binding protein  23.76 
 
 		 563 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.851364 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0624  transcriptional regulator SgrR  26.51 
 
 		 553 aa  110  8.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.172958  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0521  hypothetical protein  27.11 
 
 		 565 aa  110  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05812  hypothetical protein  28.48 
 
 		 568 aa  108  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000178  SgrR sugar-phosphate stress transcriptional activator of SgrS small RNA  26.32 
 
 		 569 aa  105  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.976786  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0616  transcriptional regulator SgrR  26.91 
 
 		 551 aa  95.5  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0296144 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3805  transcriptional regulator SgrR  25.71 
 
 		 552 aa  94.7  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0585  transcriptional regulator SgrR  27.54 
 
 		 555 aa  94.4  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1103  extracellular solute-binding protein  25.41 
 
 		 575 aa  93.2  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365076 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0072  transcriptional regulator SgrR  24.92 
 
 		 551 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0062  transcriptional regulator SgrR  24.92 
 
 		 551 aa  92.4  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1253  hypothetical protein  24.24 
 
 		 637 aa  91.7  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00065566  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3616  transcriptional regulator SgrR  24.45 
 
 		 552 aa  91.7  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.455862  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2953  ABC transporter substrate-binding protein  22.07 
 
 		 554 aa  91.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0313683  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00071  DNA-binding transcriptional regulator  24.58 
 
 		 551 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  23.53 
 
 		 510 aa  90.9  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0074  transcriptional regulator SgrR  24.58 
 
 		 551 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3588  transcriptional regulator SgrR  24.58 
 
 		 551 aa  90.9  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000489241 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00070  hypothetical protein  24.58 
 
 		 551 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0076  transcriptional regulator SgrR  24.58 
 
 		 552 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00397  predicted transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  25.08 
 
 		 566 aa  90.5  8e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3187  extracellular solute-binding protein  25.08 
 
 		 566 aa  90.5  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00401  hypothetical protein  25.08 
 
 		 566 aa  90.5  8e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0738  transcriptional regulator SgrR  25.81 
 
 		 553 aa  89.7  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001411  putative transport protein  25.3 
 
 		 585 aa  90.1  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0122  transcriptional regulator SgrR  24.02 
 
 		 552 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.40957  decreased coverage  0.00940564 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0074  transcriptional regulator SgrR  24.25 
 
 		 552 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.492998 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0122  transcriptional regulator SgrR  24.02 
 
 		 552 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3540  transcriptional regulator SgrR  24.38 
 
 		 553 aa  89.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0117  transcriptional regulator SgrR  23.96 
 
 		 552 aa  89  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.947764  normal  0.240994 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3411  transcriptional regulator SgrR  24.38 
 
 		 553 aa  89.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2942  transcriptional regulator SgrR  24.38 
 
 		 553 aa  89  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.940242 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3164  extracellular solute-binding protein family 5  24.76 
 
 		 566 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0118  transcriptional regulator SgrR  24.02 
 
 		 552 aa  88.6  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217334  normal  0.271533 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0488  solute-binding family 5 protein  24.76 
 
 		 566 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.189151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0368  extracellular solute-binding protein  24.76 
 
 		 566 aa  88.6  3e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0481  solute-binding family 5 protein  24.76 
 
 		 566 aa  88.6  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0115  transcriptional regulator SgrR  25.5 
 
 		 552 aa  88.6  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0522  solute-binding family 5 protein  24.76 
 
 		 566 aa  87.8  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0612149  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0653  putative extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 		 569 aa  87.4  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1211  putative extracellular solute-binding protein  30.6 
 
 		 495 aa  87  8e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0531  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 		 566 aa  86.7  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.585387  normal  0.74128 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0496  extracellular solute-binding protein, family 5  23.05 
 
 		 566 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0559  extracellular solute-binding protein  23.7 
 
 		 566 aa  85.5  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0515  extracellular solute-binding protein, family 5  23.7 
 
 		 566 aa  85.1  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0505  extracellular solute-binding protein family 5  23.7 
 
 		 566 aa  85.1  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.679744  normal  0.144898 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3226  extracellular solute-binding protein  23.05 
 
 		 567 aa  82  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0271  extracellular solute-binding protein family 5  31.84 
 
 		 516 aa  82  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.848307  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3045  hypothetical protein  23.05 
 
 		 567 aa  82  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4344  extracellular solute-binding protein  23.66 
 
 		 526 aa  82  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2645  4-phytase  25.34 
 
 		 532 aa  80.5  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3084  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  23.05 
 
 		 567 aa  79.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0617058  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 		 511 aa  79  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  29.19 
 
 		 510 aa  78.6  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0263  extracellular solute-binding protein family 5  26.2 
 
 		 516 aa  78.2  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0801202  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06325  hypothetical protein  28.47 
 
 		 536 aa  77  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5416  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 		 534 aa  77  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4458  opine ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  29.47 
 
 		 526 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.124294  hitchhiker  0.0000632484 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16230  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  26.48 
 
 		 516 aa  76.3  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.884302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0782  extracellular solute-binding protein  27.46 
 
 		 494 aa  76.6  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.319175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  23.18 
 
 		 532 aa  76.6  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000690  ABC-type uncharacterized transport system component  21.3 
 
 		 555 aa  75.5  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4069  HTH-type transcriptional regulator SgrR  25.8 
 
 		 596 aa  76.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4085  HTH-type transcriptional regulator SgrR  25.8 
 
 		 596 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4191  HTH-type transcriptional regulator SgrR  25.8 
 
 		 596 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.415119  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2587  extracellular solute-binding protein family 5  29.07 
 
 		 502 aa  74.7  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3985  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 499 aa  74.7  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3391  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 		 512 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  31.15 
 
 		 505 aa  74.7  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3453  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 		 512 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0954042  normal  0.238639 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3175  extracellular solute-binding protein family 5  24.42 
 
 		 554 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000918408 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3401  extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 		 512 aa  74.7  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0558  extracellular solute-binding protein  33.12 
 
 		 561 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.760139  hitchhiker  0.00152331 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4912  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.74 
 
 		 535 aa  73.9  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4249  HTH-type transcriptional regulator SgrR  25.8 
 
 		 596 aa  73.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0239  extracellular solute-binding protein  28.06 
 
 		 529 aa  73.6  0.000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.884064 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  25.96 
 
 		 526 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0790  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, periplasmic ligand binding protein  24.87 
 
 		 554 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3906  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  25.96 
 
 		 526 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.938997 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3950  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  25.96 
 
 		 526 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3842  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  25.96 
 
 		 526 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>