More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0616 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00071  DNA-binding transcriptional regulator  78.58 
 
 		 551 aa  922    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0076  transcriptional regulator SgrR  78.77 
 
 		 552 aa  922    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00070  hypothetical protein  78.58 
 
 		 551 aa  922    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3540  transcriptional regulator SgrR  63.41 
 
 		 553 aa  743    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3588  transcriptional regulator SgrR  78.4 
 
 		 551 aa  922    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000489241 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0122  transcriptional regulator SgrR  81.34 
 
 		 552 aa  942    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.40957  decreased coverage  0.00940564 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0616  transcriptional regulator SgrR  100 
 
 		 551 aa  1135    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0296144 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0738  transcriptional regulator SgrR  66.12 
 
 		 553 aa  772    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0074  transcriptional regulator SgrR  78.22 
 
 		 551 aa  919    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0118  transcriptional regulator SgrR  81.16 
 
 		 552 aa  940    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217334  normal  0.271533 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0115  transcriptional regulator SgrR  80.98 
 
 		 552 aa  939    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0074  transcriptional regulator SgrR  78.77 
 
 		 552 aa  926    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.492998 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3411  transcriptional regulator SgrR  63.41 
 
 		 553 aa  743    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3616  transcriptional regulator SgrR  62.79 
 
 		 552 aa  733    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.455862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2942  transcriptional regulator SgrR  63.41 
 
 		 553 aa  743    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.940242 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0585  transcriptional regulator SgrR  66.55 
 
 		 555 aa  769    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0117  transcriptional regulator SgrR  81.16 
 
 		 552 aa  940    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.947764  normal  0.240994 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0062  transcriptional regulator SgrR  78.77 
 
 		 551 aa  923    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0072  transcriptional regulator SgrR  78.22 
 
 		 551 aa  920    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3805  transcriptional regulator SgrR  63.34 
 
 		 552 aa  737    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0122  transcriptional regulator SgrR  81.16 
 
 		 552 aa  941    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0624  transcriptional regulator SgrR  63.88 
 
 		 553 aa  739    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.172958  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4191  HTH-type transcriptional regulator SgrR  38.94 
 
 		 596 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.415119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4085  HTH-type transcriptional regulator SgrR  38.42 
 
 		 596 aa  405  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4069  HTH-type transcriptional regulator SgrR  38.59 
 
 		 596 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4249  HTH-type transcriptional regulator SgrR  38.94 
 
 		 596 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4141  HTH-type transcriptional regulator SgrR  38.42 
 
 		 596 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.898899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0521  hypothetical protein  34.1 
 
 		 565 aa  328  2.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000178  SgrR sugar-phosphate stress transcriptional activator of SgrS small RNA  33.98 
 
 		 569 aa  324  3e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.976786  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05812  hypothetical protein  34.16 
 
 		 568 aa  320  3.9999999999999996e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0653  putative extracellular solute-binding protein  30.88 
 
 		 569 aa  302  1e-80  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1253  hypothetical protein  28.15 
 
 		 637 aa  209  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00065566  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001411  putative transport protein  26.61 
 
 		 585 aa  206  7e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0559  extracellular solute-binding protein  28.89 
 
 		 566 aa  203  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0515  extracellular solute-binding protein, family 5  28.72 
 
 		 566 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0505  extracellular solute-binding protein family 5  28.72 
 
 		 566 aa  201  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.679744  normal  0.144898 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0496  extracellular solute-binding protein, family 5  28.55 
 
 		 566 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1552  extracellular solute-binding protein  29.65 
 
 		 563 aa  195  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.851364 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0481  solute-binding family 5 protein  29.64 
 
 		 566 aa  194  4e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0531  extracellular solute-binding protein  29.64 
 
 		 566 aa  193  8e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.585387  normal  0.74128 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0368  extracellular solute-binding protein  29.64 
 
 		 566 aa  193  8e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0522  solute-binding family 5 protein  29.58 
 
 		 566 aa  192  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0612149  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2933  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC-type transport system periplasmic component  27.91 
 
 		 559 aa  192  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000113765 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0488  solute-binding family 5 protein  29.27 
 
 		 566 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.189151  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00397  predicted transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  29.46 
 
 		 566 aa  191  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00401  hypothetical protein  29.46 
 
 		 566 aa  191  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3187  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 		 566 aa  191  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3164  extracellular solute-binding protein family 5  28.82 
 
 		 566 aa  190  5e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06325  hypothetical protein  26.75 
 
 		 536 aa  188  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0912  extracellular solute-binding protein  28.15 
 
 		 566 aa  187  6e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1103  extracellular solute-binding protein  26.69 
 
 		 575 aa  184  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365076 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03322  hypothetical protein  24.31 
 
 		 589 aa  179  9e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3084  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  25.22 
 
 		 567 aa  170  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0617058  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3226  extracellular solute-binding protein  25.22 
 
 		 567 aa  170  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3045  hypothetical protein  25.22 
 
 		 567 aa  169  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0895  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.55 
 
 		 586 aa  134  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1024  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.93 
 
 		 579 aa  134  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0935  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.93 
 
 		 579 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.13566e-23 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02700  hypothetical protein  29.58 
 
 		 345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0932  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  25.36 
 
 		 579 aa  130  6e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0748  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.64 
 
 		 579 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0230399  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000690  ABC-type uncharacterized transport system component  24 
 
 		 555 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0799  ABC transporter substrate-binding protein  26.14 
 
 		 579 aa  127  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0839  ABC transporter substrate-binding protein  26.14 
 
 		 579 aa  127  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.689681  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0743  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  24.79 
 
 		 579 aa  127  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601164  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2347  extracellular solute-binding protein  21.92 
 
 		 578 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0243341  normal  0.0193694 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2884  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 		 578 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0154142 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2636  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein  25.39 
 
 		 578 aa  114  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2612  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein  25.39 
 
 		 578 aa  114  6e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.808743  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2898  extracellular solute-binding protein  22.46 
 
 		 578 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0908192  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1211  putative extracellular solute-binding protein  27.43 
 
 		 495 aa  113  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2687  solute-binding family 5 protein  21.27 
 
 		 578 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.240712  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2881  solute-binding family 5 protein  21.27 
 
 		 578 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2932  extracellular solute-binding protein  21.51 
 
 		 578 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000417004  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2689  extracellular solute-binding protein  20.8 
 
 		 571 aa  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.377797  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2920  solute-binding family 5 protein  24.84 
 
 		 578 aa  103  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00308535  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1843  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  26.91 
 
 		 569 aa  95.5  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2953  ABC transporter substrate-binding protein  20.04 
 
 		 554 aa  90.5  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0313683  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 		 489 aa  81.6  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 		 505 aa  75.5  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0195  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 		 526 aa  75.1  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001577  ABC-type uncharacterized transport system component  22.37 
 
 		 551 aa  74.7  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.826243  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1077  extracellular solute-binding protein  29.59 
 
 		 522 aa  73.2  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  25.23 
 
 		 504 aa  73.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2223  extracellular solute-binding protein family 5  24.45 
 
 		 502 aa  72.8  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  25.3 
 
 		 516 aa  71.6  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6472  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  31.58 
 
 		 495 aa  71.2  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.149439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3508  extracellular solute-binding protein family 5  30.83 
 
 		 508 aa  71.2  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0424359 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6010  extracellular solute-binding protein family 5  22.82 
 
 		 527 aa  70.9  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4444  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 		 517 aa  70.9  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.300506  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  25.28 
 
 		 538 aa  70.5  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4690  extracellular solute-binding protein family 5  30.92 
 
 		 524 aa  70.5  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  25.88 
 
 		 538 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0218  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 		 537 aa  69.3  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.219975  normal  0.837771 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0191  extracellular solute-binding protein  31.82 
 
 		 495 aa  68.6  0.0000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  25.9 
 
 		 505 aa  68.6  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4029  extracellular solute-binding protein  29.31 
 
 		 502 aa  68.2  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2790  extracellular solute-binding protein family 5  27.93 
 
 		 527 aa  68.2  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1950  extracellular solute-binding protein  25.84 
 
 		 506 aa  68.2  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412794  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5796  extracellular solute-binding protein  33.04 
 
 		 526 aa  67.8  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00815808  hitchhiker  0.00391201 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>