More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BT9727_2953 on replicon NC_005957
Organism: Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005957  BT9727_2953  ABC transporter substrate-binding protein  100 
 
 
554 aa  1146    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0313683  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0799  ABC transporter substrate-binding protein  26.33 
 
 
579 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0839  ABC transporter substrate-binding protein  26.33 
 
 
579 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.689681  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0743  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  25.87 
 
 
579 aa  148  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601164  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0748  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  26.51 
 
 
579 aa  144  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0230399  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0895  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.22 
 
 
586 aa  144  6e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1024  putative ABC transporter, substrate-binding protein  26.11 
 
 
579 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0932  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  26.34 
 
 
579 aa  141  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0935  putative ABC transporter, substrate-binding protein  25.52 
 
 
579 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.13566e-23 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05812  hypothetical protein  23.69 
 
 
568 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0653  putative extracellular solute-binding protein  23.17 
 
 
569 aa  129  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000178  SgrR sugar-phosphate stress transcriptional activator of SgrS small RNA  23.21 
 
 
569 aa  124  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.976786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2689  extracellular solute-binding protein  23.01 
 
 
571 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.377797  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2942  transcriptional regulator SgrR  21.85 
 
 
553 aa  111  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.940242 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3411  transcriptional regulator SgrR  21.85 
 
 
553 aa  111  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3540  transcriptional regulator SgrR  21.85 
 
 
553 aa  111  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0521  hypothetical protein  23.02 
 
 
565 aa  110  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1552  extracellular solute-binding protein  20.75 
 
 
563 aa  109  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.851364 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2884  extracellular solute-binding protein  22.88 
 
 
578 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0154142 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2612  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein  22.88 
 
 
578 aa  105  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.808743  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2636  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein  22.88 
 
 
578 aa  105  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2347  extracellular solute-binding protein  22.68 
 
 
578 aa  104  4e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0243341  normal  0.0193694 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3616  transcriptional regulator SgrR  21.77 
 
 
552 aa  104  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.455862  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0585  transcriptional regulator SgrR  21.49 
 
 
555 aa  103  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3805  transcriptional regulator SgrR  21.88 
 
 
552 aa  103  8e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2687  solute-binding family 5 protein  22.7 
 
 
578 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.240712  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2881  solute-binding family 5 protein  22.7 
 
 
578 aa  102  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629347  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2898  extracellular solute-binding protein  22.74 
 
 
578 aa  101  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0908192  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2932  extracellular solute-binding protein  22.54 
 
 
578 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000417004  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000690  ABC-type uncharacterized transport system component  22.42 
 
 
555 aa  97.1  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0115  transcriptional regulator SgrR  20.62 
 
 
552 aa  94.4  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0122  transcriptional regulator SgrR  20.8 
 
 
552 aa  94  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.40957  decreased coverage  0.00940564 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0117  transcriptional regulator SgrR  20.8 
 
 
552 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.947764  normal  0.240994 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0118  transcriptional regulator SgrR  20.8 
 
 
552 aa  93.2  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217334  normal  0.271533 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0122  transcriptional regulator SgrR  20.62 
 
 
552 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00071  DNA-binding transcriptional regulator  20.28 
 
 
551 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2920  solute-binding family 5 protein  22.15 
 
 
578 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00308535  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00070  hypothetical protein  20.28 
 
 
551 aa  92.4  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0624  transcriptional regulator SgrR  25.81 
 
 
553 aa  92.4  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.172958  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1843  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  22.07 
 
 
569 aa  91.7  4e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0616  transcriptional regulator SgrR  20.04 
 
 
551 aa  90.5  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0296144 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3588  transcriptional regulator SgrR  20.11 
 
 
551 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000489241 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0074  transcriptional regulator SgrR  20.11 
 
 
551 aa  89.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2933  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC-type transport system periplasmic component  26.24 
 
 
559 aa  90.1  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000113765 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0062  transcriptional regulator SgrR  19.93 
 
 
551 aa  89.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0076  transcriptional regulator SgrR  19.93 
 
 
552 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0072  transcriptional regulator SgrR  19.93 
 
 
551 aa  89.4  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0074  transcriptional regulator SgrR  19.43 
 
 
552 aa  89  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.492998 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0738  transcriptional regulator SgrR  20.49 
 
 
553 aa  88.6  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4069  HTH-type transcriptional regulator SgrR  26.89 
 
 
596 aa  87.4  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4085  HTH-type transcriptional regulator SgrR  26.56 
 
 
596 aa  87  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4249  HTH-type transcriptional regulator SgrR  26.23 
 
 
596 aa  86.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4191  HTH-type transcriptional regulator SgrR  26.23 
 
 
596 aa  86.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.415119  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4141  HTH-type transcriptional regulator SgrR  26.95 
 
 
596 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.898899  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1253  hypothetical protein  26.1 
 
 
637 aa  83.2  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00065566  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001411  putative transport protein  26.42 
 
 
585 aa  82  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1211  putative extracellular solute-binding protein  24.83 
 
 
495 aa  80.1  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1103  extracellular solute-binding protein  19.65 
 
 
575 aa  80.1  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000365076 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4534  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein, putative  30.77 
 
 
504 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00397  predicted transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  25.91 
 
 
566 aa  77  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00401  hypothetical protein  25.91 
 
 
566 aa  77  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3187  extracellular solute-binding protein  25.91 
 
 
566 aa  77  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0538168 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3164  extracellular solute-binding protein family 5  25.61 
 
 
566 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0488  solute-binding family 5 protein  25.61 
 
 
566 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.189151  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0481  solute-binding family 5 protein  25.61 
 
 
566 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0522  solute-binding family 5 protein  25.3 
 
 
566 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0612149  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0368  extracellular solute-binding protein  25.61 
 
 
566 aa  76.6  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0496  extracellular solute-binding protein, family 5  22.85 
 
 
566 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4211  extracellular solute-binding protein  30.77 
 
 
504 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744589  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0559  extracellular solute-binding protein  22.85 
 
 
566 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111824  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0505  extracellular solute-binding protein family 5  22.85 
 
 
566 aa  75.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.679744  normal  0.144898 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0531  extracellular solute-binding protein  25.3 
 
 
566 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.585387  normal  0.74128 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0515  extracellular solute-binding protein, family 5  22.85 
 
 
566 aa  74.7  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02700  hypothetical protein  26.48 
 
 
345 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  29.01 
 
 
489 aa  67.8  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  28.06 
 
 
504 aa  66.6  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06325  hypothetical protein  25.57 
 
 
536 aa  66.6  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  26.85 
 
 
538 aa  65.9  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5088  extracellular solute-binding protein family 5  28.16 
 
 
553 aa  65.5  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.416607 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3045  hypothetical protein  19 
 
 
567 aa  64.7  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3084  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  19 
 
 
567 aa  64.3  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0617058  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3226  extracellular solute-binding protein  19 
 
 
567 aa  64.7  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  30.86 
 
 
514 aa  63.9  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0265  oligopeptide-binding protein OppA  26.67 
 
 
566 aa  63.9  0.000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4392  extracellular solute-binding protein  27.42 
 
 
521 aa  63.5  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0247  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein, putative  26.25 
 
 
567 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.460021  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0912  extracellular solute-binding protein  21.7 
 
 
566 aa  63.2  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0208  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 
575 aa  62.4  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4201  extracellular solute-binding protein family 5  28.98 
 
 
508 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001577  ABC-type uncharacterized transport system component  20.07 
 
 
551 aa  62  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.826243  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3248  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  25.85 
 
 
503 aa  62  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336639  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5439  extracellular solute-binding protein family 5  23.78 
 
 
593 aa  61.6  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.157729 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3982  extracellular solute-binding protein  25.85 
 
 
503 aa  62  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  25.38 
 
 
532 aa  60.8  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5080  oligopeptide-binding protein OppA  30.2 
 
 
575 aa  60.5  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5641  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  28.33 
 
 
508 aa  60.8  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0207  extracellular solute-binding protein  26.29 
 
 
567 aa  60.8  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0245  oligopeptide-binding protein OppA  30.2 
 
 
575 aa  60.8  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0551474  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2761  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 
515 aa  60.5  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.364418  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1988  ABC peptide transporter, periplasmic ligand binding protein  28.09 
 
 
505 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.693495  normal  0.584075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>