More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BAS2687 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_2920  solute-binding family 5 protein  86.98 
 
 
578 aa  1039    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00308535  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2687  solute-binding family 5 protein  100 
 
 
578 aa  1201    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.240712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2636  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein  98.27 
 
 
578 aa  1176    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2612  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein  97.92 
 
 
578 aa  1173    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.808743  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2881  solute-binding family 5 protein  100 
 
 
578 aa  1201    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629347  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2884  extracellular solute-binding protein  98.27 
 
 
578 aa  1177    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0154142 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2898  extracellular solute-binding protein  83.88 
 
 
578 aa  1018    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0908192  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2689  extracellular solute-binding protein  70.58 
 
 
571 aa  868    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.377797  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2932  extracellular solute-binding protein  88.75 
 
 
578 aa  1077    Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000417004  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2347  extracellular solute-binding protein  83.88 
 
 
578 aa  1018    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0243341  normal  0.0193694 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0748  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  29.48 
 
 
579 aa  254  3e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0230399  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0895  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.98 
 
 
586 aa  252  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0743  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  28.5 
 
 
579 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601164  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1024  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.26 
 
 
579 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0935  putative ABC transporter, substrate-binding protein  29.6 
 
 
579 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.13566e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0932  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  28.81 
 
 
579 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0799  ABC transporter substrate-binding protein  28.67 
 
 
579 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0839  ABC transporter substrate-binding protein  28.67 
 
 
579 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.689681  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05812  hypothetical protein  23.86 
 
 
568 aa  145  3e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2942  transcriptional regulator SgrR  24.19 
 
 
553 aa  144  5e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.940242 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3540  transcriptional regulator SgrR  24.19 
 
 
553 aa  143  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3411  transcriptional regulator SgrR  24.19 
 
 
553 aa  143  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000178  SgrR sugar-phosphate stress transcriptional activator of SgrS small RNA  24.14 
 
 
569 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.976786  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0624  transcriptional regulator SgrR  22.77 
 
 
553 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.172958  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1552  extracellular solute-binding protein  24.01 
 
 
563 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.851364 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0521  hypothetical protein  22.39 
 
 
565 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1103  extracellular solute-binding protein  21.48 
 
 
575 aa  130  9.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000365076 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4069  HTH-type transcriptional regulator SgrR  23.09 
 
 
596 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1843  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  25.53 
 
 
569 aa  128  4.0000000000000003e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0738  transcriptional regulator SgrR  22.71 
 
 
553 aa  127  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3616  transcriptional regulator SgrR  21.6 
 
 
552 aa  126  9e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.455862  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4085  HTH-type transcriptional regulator SgrR  28.04 
 
 
596 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4249  HTH-type transcriptional regulator SgrR  27.73 
 
 
596 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4191  HTH-type transcriptional regulator SgrR  27.73 
 
 
596 aa  124  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.415119  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0559  extracellular solute-binding protein  21.32 
 
 
566 aa  123  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111824  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0496  extracellular solute-binding protein, family 5  21.79 
 
 
566 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0505  extracellular solute-binding protein family 5  21.32 
 
 
566 aa  123  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.679744  normal  0.144898 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000690  ABC-type uncharacterized transport system component  24.44 
 
 
555 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4141  HTH-type transcriptional regulator SgrR  27.73 
 
 
596 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.898899  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0515  extracellular solute-binding protein, family 5  21.15 
 
 
566 aa  121  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1253  hypothetical protein  21.38 
 
 
637 aa  121  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00065566  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3805  transcriptional regulator SgrR  24.09 
 
 
552 aa  120  6e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0481  solute-binding family 5 protein  21.13 
 
 
566 aa  120  7e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0531  extracellular solute-binding protein  21.13 
 
 
566 aa  120  7e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.585387  normal  0.74128 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0488  solute-binding family 5 protein  21.72 
 
 
566 aa  120  9e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.189151  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0368  extracellular solute-binding protein  21.13 
 
 
566 aa  120  9e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0585  transcriptional regulator SgrR  21.4 
 
 
555 aa  120  9e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3164  extracellular solute-binding protein family 5  21.64 
 
 
566 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3226  extracellular solute-binding protein  20 
 
 
567 aa  118  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3045  hypothetical protein  20.1 
 
 
567 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0522  solute-binding family 5 protein  20.97 
 
 
566 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0612149  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3084  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  20.76 
 
 
567 aa  116  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0617058  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00397  predicted transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  20.8 
 
 
566 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00401  hypothetical protein  20.8 
 
 
566 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3187  extracellular solute-binding protein  20.8 
 
 
566 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001411  putative transport protein  21.64 
 
 
585 aa  114  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03322  hypothetical protein  20.54 
 
 
589 aa  113  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0653  putative extracellular solute-binding protein  21.93 
 
 
569 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0616  transcriptional regulator SgrR  21.27 
 
 
551 aa  112  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0296144 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0074  transcriptional regulator SgrR  21.45 
 
 
552 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.492998 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0117  transcriptional regulator SgrR  23.96 
 
 
552 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.947764  normal  0.240994 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0062  transcriptional regulator SgrR  21.03 
 
 
551 aa  109  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0076  transcriptional regulator SgrR  20.85 
 
 
552 aa  109  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00071  DNA-binding transcriptional regulator  21.03 
 
 
551 aa  109  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0122  transcriptional regulator SgrR  23.96 
 
 
552 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.40957  decreased coverage  0.00940564 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0118  transcriptional regulator SgrR  23.96 
 
 
552 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217334  normal  0.271533 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0115  transcriptional regulator SgrR  24.76 
 
 
552 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0122  transcriptional regulator SgrR  24.76 
 
 
552 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00070  hypothetical protein  21.03 
 
 
551 aa  109  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0074  transcriptional regulator SgrR  23.96 
 
 
551 aa  108  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3588  transcriptional regulator SgrR  23.96 
 
 
551 aa  107  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000489241 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0072  transcriptional regulator SgrR  23.96 
 
 
551 aa  107  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  27.65 
 
 
532 aa  106  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0912  extracellular solute-binding protein  20.76 
 
 
566 aa  105  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2953  ABC transporter substrate-binding protein  22.7 
 
 
554 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0313683  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3174  dipeptide ABC transporter substrate-binding protein  22.57 
 
 
523 aa  101  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02700  hypothetical protein  24.25 
 
 
345 aa  101  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  23.76 
 
 
535 aa  100  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001577  ABC-type uncharacterized transport system component  23.28 
 
 
551 aa  99.4  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.826243  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  22.95 
 
 
534 aa  97.1  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  25.18 
 
 
524 aa  95.9  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0212  extracellular solute-binding protein  25 
 
 
538 aa  94.7  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0260102  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3988  extracellular solute-binding protein  25.53 
 
 
540 aa  94.7  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2933  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC-type transport system periplasmic component  21.05 
 
 
559 aa  94  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000113765 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4458  opine ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  31.84 
 
 
526 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.124294  hitchhiker  0.0000632484 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3255  ABC peptide transporter, periplasmic binding protein  25.26 
 
 
540 aa  93.2  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.433609  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1185  putative oligopeptide ABC transporter binding protein  29.23 
 
 
541 aa  91.7  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000666118  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  33.14 
 
 
530 aa  90.5  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  22.02 
 
 
544 aa  90.1  9e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2475  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 
521 aa  89  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0955412  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  21.92 
 
 
520 aa  89  2e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3275  hypothetical protein  25 
 
 
540 aa  89.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.349389  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06325  hypothetical protein  20.04 
 
 
536 aa  89  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2012  ABC-type dipeptide transport system periplasmic component-like protein  23.84 
 
 
545 aa  87.8  4e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1749  extracellular solute-binding protein family 5  32.7 
 
 
538 aa  87.4  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483604  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3881  extracellular solute-binding protein  28.93 
 
 
515 aa  87  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.441306  normal  0.0413131 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0310  extracellular solute-binding protein family 5  29.38 
 
 
512 aa  87  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.630415  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4344  extracellular solute-binding protein  30.96 
 
 
526 aa  86.3  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.133353  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  23.14 
 
 
520 aa  85.5  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3028  twin-arginine translocation pathway signal  31.63 
 
 
562 aa  84.7  0.000000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000374916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>