More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4191 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4191  HTH-type transcriptional regulator SgrR  100 
 
 		 596 aa  1222    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.415119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4141  HTH-type transcriptional regulator SgrR  99.5 
 
 		 596 aa  1217    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.898899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4085  HTH-type transcriptional regulator SgrR  99.5 
 
 		 596 aa  1218    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4069  HTH-type transcriptional regulator SgrR  98.66 
 
 		 596 aa  1211    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4249  HTH-type transcriptional regulator SgrR  99.66 
 
 		 596 aa  1217    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3805  transcriptional regulator SgrR  40.65 
 
 		 552 aa  439  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3616  transcriptional regulator SgrR  40.82 
 
 		 552 aa  441  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.455862  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3540  transcriptional regulator SgrR  40.99 
 
 		 553 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0585  transcriptional regulator SgrR  41.85 
 
 		 555 aa  426  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2942  transcriptional regulator SgrR  40.99 
 
 		 553 aa  427  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.940242 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3411  transcriptional regulator SgrR  40.99 
 
 		 553 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0738  transcriptional regulator SgrR  40.82 
 
 		 553 aa  427  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0624  transcriptional regulator SgrR  41.34 
 
 		 553 aa  423  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.172958  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0616  transcriptional regulator SgrR  38.94 
 
 		 551 aa  409  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0296144 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0072  transcriptional regulator SgrR  40.17 
 
 		 551 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0122  transcriptional regulator SgrR  39.66 
 
 		 552 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.40957  decreased coverage  0.00940564 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0074  transcriptional regulator SgrR  40.17 
 
 		 551 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0118  transcriptional regulator SgrR  39.49 
 
 		 552 aa  405  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217334  normal  0.271533 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0117  transcriptional regulator SgrR  39.42 
 
 		 552 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.947764  normal  0.240994 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0062  transcriptional regulator SgrR  39.83 
 
 		 551 aa  402  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0122  transcriptional regulator SgrR  39.59 
 
 		 552 aa  405  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0115  transcriptional regulator SgrR  39.49 
 
 		 552 aa  405  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3588  transcriptional regulator SgrR  40 
 
 		 551 aa  405  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000489241 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00071  DNA-binding transcriptional regulator  39.83 
 
 		 551 aa  402  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0076  transcriptional regulator SgrR  39.66 
 
 		 552 aa  402  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00070  hypothetical protein  39.83 
 
 		 551 aa  402  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0074  transcriptional regulator SgrR  39.66 
 
 		 552 aa  401  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.492998 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0521  hypothetical protein  31.99 
 
 		 565 aa  295  2e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05812  hypothetical protein  30.2 
 
 		 568 aa  281  3e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000178  SgrR sugar-phosphate stress transcriptional activator of SgrS small RNA  29.75 
 
 		 569 aa  273  9e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.976786  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0653  putative extracellular solute-binding protein  28.28 
 
 		 569 aa  266  5.999999999999999e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2933  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC-type transport system periplasmic component  28.9 
 
 		 559 aa  200  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000113765 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001411  putative transport protein  27.94 
 
 		 585 aa  197  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3164  extracellular solute-binding protein family 5  31.25 
 
 		 566 aa  197  6e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0368  extracellular solute-binding protein  30.96 
 
 		 566 aa  195  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0488  solute-binding family 5 protein  31.25 
 
 		 566 aa  195  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.189151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0481  solute-binding family 5 protein  31.25 
 
 		 566 aa  195  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0522  solute-binding family 5 protein  30.96 
 
 		 566 aa  195  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0612149  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0531  extracellular solute-binding protein  30.79 
 
 		 566 aa  193  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.585387  normal  0.74128 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0912  extracellular solute-binding protein  28.69 
 
 		 566 aa  193  7e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00397  predicted transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  30.79 
 
 		 566 aa  192  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00401  hypothetical protein  30.79 
 
 		 566 aa  192  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0505  extracellular solute-binding protein family 5  30.32 
 
 		 566 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.679744  normal  0.144898 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0515  extracellular solute-binding protein, family 5  30.15 
 
 		 566 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3187  extracellular solute-binding protein  30.79 
 
 		 566 aa  192  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0559  extracellular solute-binding protein  30.03 
 
 		 566 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0496  extracellular solute-binding protein, family 5  29.87 
 
 		 566 aa  190  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1253  hypothetical protein  27.24 
 
 		 637 aa  184  6e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00065566  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3084  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  27.3 
 
 		 567 aa  180  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0617058  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3045  hypothetical protein  27.3 
 
 		 567 aa  178  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3226  extracellular solute-binding protein  27.3 
 
 		 567 aa  179  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1552  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 		 563 aa  177  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.851364 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1103  extracellular solute-binding protein  33.76 
 
 		 575 aa  171  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365076 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06325  hypothetical protein  26.13 
 
 		 536 aa  163  7e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03322  hypothetical protein  24.27 
 
 		 589 aa  151  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02700  hypothetical protein  28.34 
 
 		 345 aa  139  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2636  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein  23.18 
 
 		 578 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2884  extracellular solute-binding protein  23.18 
 
 		 578 aa  135  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0154142 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1211  putative extracellular solute-binding protein  29.57 
 
 		 495 aa  134  6.999999999999999e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2612  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein  23.01 
 
 		 578 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.808743  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2932  extracellular solute-binding protein  28.02 
 
 		 578 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000417004  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2920  solute-binding family 5 protein  28.02 
 
 		 578 aa  125  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00308535  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2687  solute-binding family 5 protein  27.73 
 
 		 578 aa  124  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.240712  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2881  solute-binding family 5 protein  27.73 
 
 		 578 aa  124  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629347  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0748  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  28.8 
 
 		 579 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0230399  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1024  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.8 
 
 		 579 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0935  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.8 
 
 		 579 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.13566e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0932  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  28.8 
 
 		 579 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0743  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  28.16 
 
 		 579 aa  120  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0799  ABC transporter substrate-binding protein  28.8 
 
 		 579 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0839  ABC transporter substrate-binding protein  28.8 
 
 		 579 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.689681  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0895  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.48 
 
 		 586 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2347  extracellular solute-binding protein  27.5 
 
 		 578 aa  117  5e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0243341  normal  0.0193694 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2898  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 578 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0908192  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2689  extracellular solute-binding protein  22.3 
 
 		 571 aa  110  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.377797  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000690  ABC-type uncharacterized transport system component  25.26 
 
 		 555 aa  102  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  33.14 
 
 		 489 aa  91.7  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2953  ABC transporter substrate-binding protein  26.23 
 
 		 554 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0313683  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4444  extracellular solute-binding protein  31.85 
 
 		 517 aa  81.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.300506  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  28.39 
 
 		 505 aa  77.8  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1949  extracellular solute-binding protein  32.45 
 
 		 506 aa  77  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.806443  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1950  extracellular solute-binding protein  30.37 
 
 		 506 aa  76.6  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.412794  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1755  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  32.12 
 
 		 511 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1843  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  25.8 
 
 		 569 aa  75.5  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0450  extracellular solute-binding protein family 5  26.32 
 
 		 519 aa  74.7  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.15126 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001577  ABC-type uncharacterized transport system component  23 
 
 		 551 aa  73.9  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.826243  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  27.5 
 
 		 516 aa  73.9  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  30.67 
 
 		 537 aa  73.9  0.000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  34 
 
 		 522 aa  73.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2388  extracellular solute-binding protein  32.64 
 
 		 522 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1569  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30.3 
 
 		 511 aa  73.6  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0431  extracellular solute-binding protein  29.38 
 
 		 522 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2405  extracellular solute-binding protein family 5  34.07 
 
 		 518 aa  72  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  29.3 
 
 		 526 aa  72  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1935  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  30.91 
 
 		 511 aa  71.6  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5067  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 		 495 aa  71.2  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68424  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  28.22 
 
 		 512 aa  71.2  0.00000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0157  twin-arginine translocation pathway signal  33.75 
 
 		 545 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.695568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5080  extracellular solute-binding protein  29.1 
 
 		 502 aa  70.9  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0526207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  28.57 
 
 		 514 aa  70.9  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>