More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0585 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00071  DNA-binding transcriptional regulator  66.43 
 
 		 551 aa  765    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0624  transcriptional regulator SgrR  77.9 
 
 		 553 aa  903    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.172958  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0076  transcriptional regulator SgrR  66.55 
 
 		 552 aa  766    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0585  transcriptional regulator SgrR  100 
 
 		 555 aa  1127    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3540  transcriptional regulator SgrR  67.81 
 
 		 553 aa  783    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3616  transcriptional regulator SgrR  69.75 
 
 		 552 aa  810    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.455862  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3411  transcriptional regulator SgrR  67.81 
 
 		 553 aa  783    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3805  transcriptional regulator SgrR  70.65 
 
 		 552 aa  811    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0074  transcriptional regulator SgrR  66.91 
 
 		 552 aa  768    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.492998 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0738  transcriptional regulator SgrR  69.8 
 
 		 553 aa  795    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00070  hypothetical protein  66.43 
 
 		 551 aa  765    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0118  transcriptional regulator SgrR  67.51 
 
 		 552 aa  761    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.217334  normal  0.271533 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0122  transcriptional regulator SgrR  67.69 
 
 		 552 aa  764    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.40957  decreased coverage  0.00940564 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2942  transcriptional regulator SgrR  67.63 
 
 		 553 aa  780    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.940242 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0072  transcriptional regulator SgrR  66.06 
 
 		 551 aa  762    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0062  transcriptional regulator SgrR  66.43 
 
 		 551 aa  766    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0074  transcriptional regulator SgrR  66.25 
 
 		 551 aa  763    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3588  transcriptional regulator SgrR  66.43 
 
 		 551 aa  766    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000489241 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0616  transcriptional regulator SgrR  66.55 
 
 		 551 aa  770    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0296144 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0115  transcriptional regulator SgrR  67.69 
 
 		 552 aa  764    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0122  transcriptional regulator SgrR  67.87 
 
 		 552 aa  766    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0117  transcriptional regulator SgrR  67.51 
 
 		 552 aa  762    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.947764  normal  0.240994 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4249  HTH-type transcriptional regulator SgrR  41.85 
 
 		 596 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4191  HTH-type transcriptional regulator SgrR  41.85 
 
 		 596 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.415119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4069  HTH-type transcriptional regulator SgrR  41.68 
 
 		 596 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4085  HTH-type transcriptional regulator SgrR  41.51 
 
 		 596 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4141  HTH-type transcriptional regulator SgrR  41.51 
 
 		 596 aa  422  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.898899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0521  hypothetical protein  35.63 
 
 		 565 aa  340  4e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05812  hypothetical protein  34.75 
 
 		 568 aa  323  3e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000178  SgrR sugar-phosphate stress transcriptional activator of SgrS small RNA  34.74 
 
 		 569 aa  322  1.9999999999999998e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.976786  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0653  putative extracellular solute-binding protein  31.81 
 
 		 569 aa  318  2e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1253  hypothetical protein  31.38 
 
 		 637 aa  234  3e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00065566  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001411  putative transport protein  28.35 
 
 		 585 aa  206  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1103  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 		 575 aa  203  6e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000365076 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1552  extracellular solute-binding protein  30.23 
 
 		 563 aa  201  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.851364 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2933  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC-type transport system periplasmic component  28.8 
 
 		 559 aa  189  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000113765 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0559  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 566 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06325  hypothetical protein  27.27 
 
 		 536 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0505  extracellular solute-binding protein family 5  28.12 
 
 		 566 aa  181  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.679744  normal  0.144898 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0515  extracellular solute-binding protein, family 5  28.12 
 
 		 566 aa  181  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0496  extracellular solute-binding protein, family 5  27.95 
 
 		 566 aa  180  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3084  putative ABC transporter, periplasmic binding protein  26.74 
 
 		 567 aa  176  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0617058  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03322  hypothetical protein  25 
 
 		 589 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3226  extracellular solute-binding protein  26.56 
 
 		 567 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3045  hypothetical protein  26.56 
 
 		 567 aa  174  3.9999999999999995e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0912  extracellular solute-binding protein  27.6 
 
 		 566 aa  172  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0481  solute-binding family 5 protein  28.15 
 
 		 566 aa  170  6e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0488  solute-binding family 5 protein  28.15 
 
 		 566 aa  170  7e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.189151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0368  extracellular solute-binding protein  28.15 
 
 		 566 aa  170  7e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0531  extracellular solute-binding protein  28.15 
 
 		 566 aa  170  8e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.585387  normal  0.74128 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0522  solute-binding family 5 protein  27.63 
 
 		 566 aa  169  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0612149  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00397  predicted transporter subunit: periplasmic-binding component of ABC superfamily  27.98 
 
 		 566 aa  167  5e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3164  extracellular solute-binding protein family 5  27.98 
 
 		 566 aa  167  5e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00401  hypothetical protein  27.98 
 
 		 566 aa  167  5e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3187  extracellular solute-binding protein  27.98 
 
 		 566 aa  167  5e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0538168 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0895  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.25 
 
 		 586 aa  144  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02700  hypothetical protein  32.64 
 
 		 345 aa  144  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1024  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.81 
 
 		 579 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0748  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  28.29 
 
 		 579 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0230399  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0935  putative ABC transporter, substrate-binding protein  28.1 
 
 		 579 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.13566e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0932  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  28.05 
 
 		 579 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0743  oligopeptide ABC transporter, solute-binding protein  27.42 
 
 		 579 aa  139  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0799  ABC transporter substrate-binding protein  27.98 
 
 		 579 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0839  ABC transporter substrate-binding protein  27.98 
 
 		 579 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.689681  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1211  putative extracellular solute-binding protein  31.29 
 
 		 495 aa  130  9.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2884  extracellular solute-binding protein  21.58 
 
 		 578 aa  120  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0154142 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2687  solute-binding family 5 protein  21.4 
 
 		 578 aa  120  9e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.240712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2636  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein  21.58 
 
 		 578 aa  120  9e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2881  solute-binding family 5 protein  21.4 
 
 		 578 aa  120  9e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629347  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2612  oligopeptide ABC transporter, substrate-binding protein  21.2 
 
 		 578 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.808743  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2347  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 578 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0243341  normal  0.0193694 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2898  extracellular solute-binding protein  21.65 
 
 		 578 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0908192  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000690  ABC-type uncharacterized transport system component  21.76 
 
 		 555 aa  113  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2932  extracellular solute-binding protein  21.18 
 
 		 578 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000417004  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2689  extracellular solute-binding protein  20.07 
 
 		 571 aa  109  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.377797  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2920  solute-binding family 5 protein  24.09 
 
 		 578 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00308535  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2953  ABC transporter substrate-binding protein  21.49 
 
 		 554 aa  103  6e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0313683  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1843  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  27.54 
 
 		 569 aa  94.4  5e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0387  extracellular solute-binding protein family 5  23.42 
 
 		 503 aa  82  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000219856  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  29.74 
 
 		 516 aa  82  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13240  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  29.56 
 
 		 504 aa  80.9  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0803154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  27.37 
 
 		 514 aa  80.1  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  28.35 
 
 		 505 aa  79.3  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4690  extracellular solute-binding protein family 5  30.23 
 
 		 524 aa  78.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2388  extracellular solute-binding protein  36.17 
 
 		 522 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  28.33 
 
 		 512 aa  77.8  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  28.21 
 
 		 516 aa  76.6  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3131  extracellular solute-binding protein  25.89 
 
 		 508 aa  75.9  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.792469  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  29.72 
 
 		 533 aa  76.3  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1433  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  27.48 
 
 		 538 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.948157  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  30.29 
 
 		 532 aa  74.7  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0810  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 		 489 aa  74.7  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2069  extracellular solute-binding protein family 5  35.86 
 
 		 518 aa  73.9  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1661  extracellular solute-binding protein  24.93 
 
 		 511 aa  73.6  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5416  extracellular solute-binding protein  32.34 
 
 		 534 aa  72.8  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1234  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 		 538 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.871598  normal  0.318753 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  32.34 
 
 		 534 aa  72  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  28.77 
 
 		 533 aa  71.2  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1077  extracellular solute-binding protein  31.21 
 
 		 522 aa  70.9  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.108497 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001577  ABC-type uncharacterized transport system component  22.88 
 
 		 551 aa  70.9  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.826243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>