More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1087 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1087  ABC transporter related  100 
 
 
307 aa  597  1e-170  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.545891  normal  0.0171241 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2142  ABC transporter related  71.05 
 
 
305 aa  450  1e-125  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1960  ABC transporter related  72.7 
 
 
306 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000146397  hitchhiker  0.00000000000000983668 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0216  ABC transporter related  71.15 
 
 
308 aa  417  9.999999999999999e-116  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.337663 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31750  sulfate ABC transporter  48.08 
 
 
323 aa  213  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1105  ABC transporter related  43 
 
 
319 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.788183  normal  0.492293 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3853  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  50.64 
 
 
357 aa  211  9e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0311  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein CysA  46.95 
 
 
326 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0197  sulphate transport system permease protein 1  46.56 
 
 
329 aa  209  5e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0081  ABC transporter  47.33 
 
 
326 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5228  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.18 
 
 
329 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138595  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0371  sulfate transport protein CysA  46.95 
 
 
329 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.322306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03650  sulfate transport protein CysA  46.95 
 
 
329 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00236886  hitchhiker  0.00000000727844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5075  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.8 
 
 
329 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.207952  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5168  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.8 
 
 
329 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.644217 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5470  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  48.15 
 
 
364 aa  207  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.867721  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0294  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.56 
 
 
329 aa  206  3e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.491051 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1383  ABC transporter related  49.06 
 
 
368 aa  206  6e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4874  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.28 
 
 
360 aa  206  6e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544883  normal  0.368971 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1186  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.25 
 
 
330 aa  205  7e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1495  sulphate transport system permease protein 1  43.4 
 
 
338 aa  204  1e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625572  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  48.96 
 
 
344 aa  204  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0913  ABC transporter related  45.21 
 
 
361 aa  204  1e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  49.55 
 
 
362 aa  204  1e-51  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3091  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.87 
 
 
330 aa  204  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2195  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  48.16 
 
 
339 aa  202  5e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.643313  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4219  ABC transporter related  49.79 
 
 
399 aa  202  5e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.116014  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3415  ABC transporter related protein  36.11 
 
 
354 aa  201  9.999999999999999e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00408185  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0201  ABC transporter related  45.24 
 
 
350 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.490731 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2366  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.81 
 
 
367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3284  ABC transporter related  46.28 
 
 
350 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.77037  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3218  ABC transporter related  41.23 
 
 
379 aa  200  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146375  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0243  ABC transporter related  41.3 
 
 
342 aa  200  3e-50  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.251428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7384  ABC transporter related protein  51.05 
 
 
360 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3162  ABC transporter related  48.18 
 
 
341 aa  199  5e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  40.63 
 
 
358 aa  198  9e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1199  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  46.69 
 
 
357 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1047  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.08 
 
 
330 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5048  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  43.4 
 
 
338 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1735  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  46.09 
 
 
368 aa  197  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000353928 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2777  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  47.47 
 
 
332 aa  198  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04080  ABC-type spermidine/putrescine transport system, ATPase component  43.43 
 
 
316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.716043 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1829  ABC transporter related  43.43 
 
 
328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.853496 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3754  ABC transporter related  46.12 
 
 
353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3171  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.91 
 
 
333 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.659319  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1180  ABC transporter related  40.38 
 
 
312 aa  197  2.0000000000000003e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.584734 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0969  ABC transporter related  44.4 
 
 
362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0177973  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2841  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.8 
 
 
346 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0714016  normal  0.325359 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1935  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.34 
 
 
357 aa  196  3e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.786432  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3984  ABC transporter related  47.03 
 
 
354 aa  196  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.194815 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2681  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.91 
 
 
344 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.255864  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4608  ABC transporter related  47.35 
 
 
342 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1049  ABC transporter-related protein  43.83 
 
 
333 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1128  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA  46.69 
 
 
357 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5131  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.63 
 
 
381 aa  195  6e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0609  sulphate transport system permease protein 1  45.75 
 
 
359 aa  195  6e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.863407  normal  0.7165 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1328  ABC transporter related  44.81 
 
 
328 aa  196  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207377  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4348  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.8 
 
 
332 aa  196  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3450  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.4 
 
 
351 aa  195  7e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0285  ABC transporter related  45 
 
 
334 aa  195  7e-49  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0897858  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0974  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  45.87 
 
 
378 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.255279  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1613  sperimidine/putrescine ABC transporter ATP-binding protein  44.4 
 
 
365 aa  195  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  47.23 
 
 
370 aa  195  9e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0674  ABC transporter, ATP-binding protein  46.69 
 
 
353 aa  194  1e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4232  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.51 
 
 
353 aa  195  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0112  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  43.39 
 
 
353 aa  195  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178265  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1271  polyamine ABC transporter, ATP-binding protein  42.68 
 
 
378 aa  195  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4655  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  43.82 
 
 
354 aa  194  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0497  ABC transporter component  47.06 
 
 
366 aa  194  1e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1829  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  42.02 
 
 
354 aa  194  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3030  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  43.4 
 
 
390 aa  194  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000240164  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2329  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  47.43 
 
 
326 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000238837  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6063  ABC transporter related  44.27 
 
 
353 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.127278  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.13 
 
 
355 aa  193  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0718  ABC transporter, ATP-binding protein  46.69 
 
 
353 aa  193  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 
355 aa  194  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1759  ABC transporter related  45.64 
 
 
353 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.483638  normal  0.015539 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2136  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.07 
 
 
372 aa  194  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4541  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.43 
 
 
367 aa  193  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68861  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3492  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  47.27 
 
 
343 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.993193  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1680  sulphate transport system permease protein 1  44.94 
 
 
338 aa  193  3e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.070095  normal  0.46795 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2951  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.97 
 
 
352 aa  193  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1699  ABC transporter related  45.08 
 
 
355 aa  193  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3479  sulphate transport system permease protein 1  47.27 
 
 
343 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3542  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  47.27 
 
 
343 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2534  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.64 
 
 
354 aa  193  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2800  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  44.66 
 
 
330 aa  193  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0102  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  46.19 
 
 
353 aa  192  4e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12958  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3843  ABC transporter related  39.13 
 
 
353 aa  192  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0869  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  47.74 
 
 
371 aa  193  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0353  ABC transporter, ATP-binding protein  46.21 
 
 
347 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315996  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1014  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.87 
 
 
357 aa  192  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1785  ABC transporter, ATP-binding protein  46.21 
 
 
347 aa  192  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4911  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.31 
 
 
336 aa  192  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2917  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.26 
 
 
378 aa  192  5e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0239568  normal  0.458628 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2999  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.26 
 
 
378 aa  192  5e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0253252  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6758  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  41.28 
 
 
346 aa  192  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420036  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3096  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  42.26 
 
 
378 aa  192  5e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0831246  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5739  ABC transporter-related protein  48.71 
 
 
348 aa  192  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4439  ABC transporter related  43.7 
 
 
348 aa  192  5e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>