More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1333 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1333  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  100 
 
 		 386 aa  781    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000335599  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0684  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  68.7 
 
 		 393 aa  560  1e-158  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0946  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  55.16 
 
 		 388 aa  428  1e-119  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000933718  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0924  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  54.89 
 
 		 388 aa  427  1e-118  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000324435  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0531  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  54.89 
 
 		 390 aa  415  9.999999999999999e-116  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.077204  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12320  Ornithine decarboxylase  45.77 
 
 		 387 aa  310  4e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0801  ornithine decarboxylase  44.03 
 
 		 387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.430321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4247  ornithine decarboxylase  44.18 
 
 		 387 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1080  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  45.43 
 
 		 376 aa  300  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.143277 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3419  ornithine decarboxylase  45.4 
 
 		 380 aa  300  2e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.268803  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0576  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  43.09 
 
 		 392 aa  300  3e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3806  ornithine decarboxylase  46.7 
 
 		 377 aa  300  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.16357  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5135  ornithine decarboxylase  44.15 
 
 		 387 aa  298  9e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58630  ornithine decarboxylase  43.88 
 
 		 387 aa  297  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0924  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  45.1 
 
 		 380 aa  296  3e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.215223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2175  ornithine decarboxylase  45.55 
 
 		 388 aa  296  6e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.174065 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4547  ornithine decarboxylase  44.54 
 
 		 380 aa  295  7e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.727864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2715  ornithine decarboxylase  45.38 
 
 		 377 aa  294  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4572  pyridoxal-dependent decarboxylase, pyridoxal binding domain protein  45.05 
 
 		 359 aa  293  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1157  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  44.01 
 
 		 376 aa  293  3e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214354 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0801  ornithine decarboxylase  43.12 
 
 		 387 aa  293  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1090  pyridoxal-dependent decarboxylase  44.57 
 
 		 377 aa  293  5e-78  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.41465  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4314  ornithine decarboxylase  42.33 
 
 		 387 aa  292  7e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0146694 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0894  ornithine decarboxylase  42.59 
 
 		 387 aa  291  1e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.199626 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1109  pyridoxal-dependent family decarboxylase  43.21 
 
 		 389 aa  290  2e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0908  ornithine decarboxylase  42.59 
 
 		 387 aa  291  2e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226551 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2140  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  44.01 
 
 		 376 aa  290  3e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4245  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  44.82 
 
 		 377 aa  290  3e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0864  ornithine decarboxylase  42.82 
 
 		 371 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0410  ornithine decarboxylase  43.58 
 
 		 391 aa  289  7e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2772  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  45.56 
 
 		 377 aa  288  1e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0037  ornithine decarboxylase  41.64 
 
 		 391 aa  288  1e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3689  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  44.48 
 
 		 377 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192406  normal  0.735507 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0092  ornithine/DAP/arginine decarboxylase family decarboxylase 2  44.82 
 
 		 377 aa  286  4e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0100  ornithine/DAP/arginine decarboxylase family decarboxylase 2  44.82 
 
 		 377 aa  286  4e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.938006  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0029  ornithine decarboxylase  41.91 
 
 		 391 aa  286  4e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3390  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  44.75 
 
 		 377 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151925 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3392  ornithine decarboxylase  43.01 
 
 		 391 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000026968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0938  Ornithine decarboxylase  43.7 
 
 		 380 aa  285  8e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4837  ornithine decarboxylase  43.58 
 
 		 380 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3234  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  43.73 
 
 		 433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.17502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0077  ornithine decarboxylase  42.67 
 
 		 391 aa  283  3.0000000000000004e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0856  ornithine decarboxylase  43.42 
 
 		 380 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.310254 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3110  ornithine decarboxylase  41.76 
 
 		 390 aa  282  7.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0445  ornithine decarboxylase  42.47 
 
 		 391 aa  280  3e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00713541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2006  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  43.29 
 
 		 388 aa  280  4e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.447532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1349  ornithine decarboxylase  44.29 
 
 		 380 aa  280  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758302  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2045  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  43.29 
 
 		 388 aa  279  5e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2320  Ornithine decarboxylase  43.29 
 
 		 388 aa  279  6e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.724632  normal  0.55371 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2177  ornithine decarboxylase  40.16 
 
 		 390 aa  279  7e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.024937  normal  0.209204 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0541  diaminopimelate decarboxylase  42.4 
 
 		 391 aa  279  7e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0699456  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3507  ornithine decarboxylase  42.2 
 
 		 391 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00021864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0465  diaminopimelate decarboxylase  42.2 
 
 		 391 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000104832  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0486  diaminopimelate decarboxylase  42.2 
 
 		 391 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000602971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3075  diaminopimelate decarboxylase  43.4 
 
 		 391 aa  278  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000605202  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3854  diaminopimelate decarboxylase  42.2 
 
 		 391 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000739123  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4655  ornithine decarboxylase  42.19 
 
 		 388 aa  278  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.203932 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0489  Diaminopimelate decarboxylase  42.2 
 
 		 391 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000118387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3682  ornithine decarboxylase  42.2 
 
 		 391 aa  278  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00110632  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4136  decarboxylase, pyridoxal-dependent  42.2 
 
 		 391 aa  276  3e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0801  ornithine decarboxylase  40 
 
 		 389 aa  275  1.0000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0446  ornithine decarboxylase  43.01 
 
 		 390 aa  273  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0877313 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3405  diaminopimelate decarboxylase  42.4 
 
 		 391 aa  272  7e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2057  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  41.06 
 
 		 376 aa  271  2e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1649  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  42.19 
 
 		 388 aa  270  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.648031  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1693  ornithine decarboxylase  43.01 
 
 		 421 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1375  ornithine decarboxylase  41.11 
 
 		 398 aa  267  2e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.291612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2180  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  41.94 
 
 		 376 aa  264  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0693915  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1416  ornithine decarboxylase  39.9 
 
 		 392 aa  263  3e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1510  Ornithine decarboxylase  39.94 
 
 		 400 aa  257  3e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000015857  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5654  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  37.6 
 
 		 397 aa  247  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24620  ornithine decarboxylase  36.97 
 
 		 389 aa  246  6e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1964  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  36.59 
 
 		 391 aa  246  6e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5043  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.11 
 
 		 403 aa  239  8e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3803  Ornithine decarboxylase  30.27 
 
 		 392 aa  192  8e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.390604  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1046  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.94 
 
 		 397 aa  173  3.9999999999999995e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.627883  normal  0.114267 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0879  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.33 
 
 		 379 aa  170  4e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03846  ornithine decarboxylase (Eurofung)  29.81 
 
 		 434 aa  169  5e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000212473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2447  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.4 
 
 		 404 aa  169  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0274  ornithine decarboxylase  29.83 
 
 		 398 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000805907  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0693  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.13 
 
 		 379 aa  161  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0353  diaminopimelate decarboxylase  31.17 
 
 		 422 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90612  ornithine decarboxylase  28.53 
 
 		 458 aa  151  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.253647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4070  diaminopimelate decarboxylase  30.35 
 
 		 427 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1588  diaminopimelate decarboxylase  31.34 
 
 		 407 aa  150  5e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  29.49 
 
 		 420 aa  149  7e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4193  diaminopimelate decarboxylase  30.6 
 
 		 427 aa  149  9e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4218  diaminopimelate decarboxylase  30.6 
 
 		 427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15741  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4145  diaminopimelate decarboxylase  27.78 
 
 		 417 aa  145  9e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6020  diaminopimelate decarboxylase  28.96 
 
 		 415 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4055  diaminopimelate decarboxylase  27.78 
 
 		 417 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0214  diaminopimelate decarboxylase  27.17 
 
 		 401 aa  142  7e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0377  ornithine decarboxylase  32.42 
 
 		 417 aa  142  7e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.412388  normal  0.928081 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2895  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.81 
 
 		 382 aa  140  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000922142 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0086  diaminopimelate decarboxylase  26.46 
 
 		 432 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0834  diaminopimelate decarboxylase  28.14 
 
 		 418 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1301  diaminopimelate decarboxylase  28.57 
 
 		 412 aa  139  8.999999999999999e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0271  diaminopimelate decarboxylase  28.46 
 
 		 403 aa  139  1e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.760215  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69670  diaminopimelate decarboxylase  28.42 
 
 		 415 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3740  diaminopimelate decarboxylase  28.61 
 
 		 419 aa  137  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>