More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0037 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0029  ornithine decarboxylase  98.21 
 
 		 391 aa  796    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0037  ornithine decarboxylase  100 
 
 		 391 aa  808    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4247  ornithine decarboxylase  59.64 
 
 		 387 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12320  Ornithine decarboxylase  59.64 
 
 		 387 aa  496  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0908  ornithine decarboxylase  59.38 
 
 		 387 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226551 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4314  ornithine decarboxylase  59.38 
 
 		 387 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0146694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0801  ornithine decarboxylase  59.38 
 
 		 387 aa  491  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0894  ornithine decarboxylase  59.13 
 
 		 387 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.199626 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0801  ornithine decarboxylase  59.9 
 
 		 387 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.430321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5135  ornithine decarboxylase  58.87 
 
 		 387 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58630  ornithine decarboxylase  58.61 
 
 		 387 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0077  ornithine decarboxylase  59.17 
 
 		 391 aa  487  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0864  ornithine decarboxylase  60.65 
 
 		 371 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0390948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0541  diaminopimelate decarboxylase  57.07 
 
 		 391 aa  478  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0699456  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2175  ornithine decarboxylase  57.69 
 
 		 388 aa  480  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.174065 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4572  pyridoxal-dependent decarboxylase, pyridoxal binding domain protein  61.43 
 
 		 359 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3854  diaminopimelate decarboxylase  56.56 
 
 		 391 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000739123  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0465  diaminopimelate decarboxylase  56.56 
 
 		 391 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000104832  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0486  diaminopimelate decarboxylase  56.56 
 
 		 391 aa  475  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000602971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0489  Diaminopimelate decarboxylase  56.56 
 
 		 391 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000118387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0445  ornithine decarboxylase  57.07 
 
 		 391 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00713541  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4136  decarboxylase, pyridoxal-dependent  56.81 
 
 		 391 aa  474  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0410  ornithine decarboxylase  57.33 
 
 		 391 aa  472  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3392  ornithine decarboxylase  57.58 
 
 		 391 aa  474  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000026968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3682  ornithine decarboxylase  56.81 
 
 		 391 aa  474  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00110632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3507  ornithine decarboxylase  56.81 
 
 		 391 aa  474  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00021864  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1109  pyridoxal-dependent family decarboxylase  58.27 
 
 		 389 aa  471  1.0000000000000001e-131  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3075  diaminopimelate decarboxylase  57.07 
 
 		 391 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000605202  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3405  diaminopimelate decarboxylase  56.81 
 
 		 391 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1416  ornithine decarboxylase  54.78 
 
 		 392 aa  455  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2177  ornithine decarboxylase  53.7 
 
 		 390 aa  431  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.024937  normal  0.209204 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0576  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  51.3 
 
 		 392 aa  394  1e-108  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2715  ornithine decarboxylase  49.86 
 
 		 377 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2140  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  50.42 
 
 		 376 aa  366  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4547  ornithine decarboxylase  48.95 
 
 		 380 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.727864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4837  ornithine decarboxylase  49.21 
 
 		 380 aa  365  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3234  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  49.73 
 
 		 433 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.17502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0924  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  49.6 
 
 		 380 aa  364  1e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.215223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0856  ornithine decarboxylase  49.86 
 
 		 380 aa  364  1e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.310254 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3419  ornithine decarboxylase  48.68 
 
 		 380 aa  364  1e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.268803  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4245  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  49.86 
 
 		 377 aa  363  3e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0100  ornithine/DAP/arginine decarboxylase family decarboxylase 2  49.86 
 
 		 377 aa  361  1e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.938006  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0092  ornithine/DAP/arginine decarboxylase family decarboxylase 2  49.86 
 
 		 377 aa  361  1e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0938  Ornithine decarboxylase  49.32 
 
 		 380 aa  360  2e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1157  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  49.86 
 
 		 376 aa  360  3e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0214354 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3390  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  48.76 
 
 		 377 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.151925 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3689  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  48.76 
 
 		 377 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192406  normal  0.735507 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1090  pyridoxal-dependent decarboxylase  48.21 
 
 		 377 aa  352  8.999999999999999e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.41465  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2772  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  49.04 
 
 		 377 aa  350  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3806  ornithine decarboxylase  47.11 
 
 		 377 aa  350  3e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.16357  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1080  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  47.99 
 
 		 376 aa  349  4e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.143277 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1349  ornithine decarboxylase  49.86 
 
 		 380 aa  347  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.758302  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1693  ornithine decarboxylase  48.53 
 
 		 421 aa  339  5e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2057  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  45.16 
 
 		 376 aa  335  9e-91  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4655  ornithine decarboxylase  45.87 
 
 		 388 aa  333  4e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.203932 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5654  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  46.26 
 
 		 397 aa  331  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1649  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  46.63 
 
 		 388 aa  331  2e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.648031  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0446  ornithine decarboxylase  46.63 
 
 		 390 aa  328  7e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0877313 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3110  ornithine decarboxylase  44.11 
 
 		 390 aa  325  8.000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1375  ornithine decarboxylase  44.77 
 
 		 398 aa  325  9e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.291612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2320  Ornithine decarboxylase  43.73 
 
 		 388 aa  323  3e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.724632  normal  0.55371 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2045  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  43.73 
 
 		 388 aa  323  3e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2006  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  44.27 
 
 		 388 aa  322  6e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.447532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0801  ornithine decarboxylase  43.84 
 
 		 389 aa  322  9.000000000000001e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24620  ornithine decarboxylase  44.2 
 
 		 389 aa  320  3.9999999999999996e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2180  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  43.17 
 
 		 376 aa  302  5.000000000000001e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0693915  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0684  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  40.68 
 
 		 393 aa  291  1e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1333  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  41.64 
 
 		 386 aa  288  1e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000335599  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5043  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  40.8 
 
 		 403 aa  283  5.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0531  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.1 
 
 		 390 aa  273  4.0000000000000004e-72  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.077204  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0946  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.77 
 
 		 388 aa  263  4e-69  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000933718  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0924  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  38.5 
 
 		 388 aa  263  6e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000324435  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1510  Ornithine decarboxylase  38.36 
 
 		 400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000015857  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1964  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  35.66 
 
 		 391 aa  207  3e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3803  Ornithine decarboxylase  30.98 
 
 		 392 aa  176  6e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.390604  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1046  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  32.15 
 
 		 397 aa  166  5e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.627883  normal  0.114267 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2447  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.85 
 
 		 404 aa  162  7e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_90612  ornithine decarboxylase  29.85 
 
 		 458 aa  162  1e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.253647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0693  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.75 
 
 		 379 aa  159  7e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0879  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30.67 
 
 		 379 aa  156  6e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03846  ornithine decarboxylase (Eurofung)  29.67 
 
 		 434 aa  151  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000212473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0274  ornithine decarboxylase  30.54 
 
 		 398 aa  150  4e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000805907  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04890  ornithine decarboxylase, putative  27.97 
 
 		 527 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.447794  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2321  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  26.95 
 
 		 387 aa  134  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671563  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1461  diaminopimelate decarboxylase  29.3 
 
 		 421 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0318  diaminopimelate decarboxylase  26.87 
 
 		 394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.833211 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12642  ornithine decarboxylase 2  28.43 
 
 		 390 aa  132  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1490  diaminopimelate decarboxylase  29.3 
 
 		 421 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00291349  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2547  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2:Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  30 
 
 		 397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.211268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0541  diaminopimelate decarboxylase  29.83 
 
 		 418 aa  125  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0209  diaminopimelate decarboxylase  29.75 
 
 		 415 aa  125  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3089  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  27.85 
 
 		 381 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.334962 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1991  putative ornithine decarboxylase  26.81 
 
 		 381 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1847  diaminopimelate decarboxylase  29.34 
 
 		 418 aa  125  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0701  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  26.81 
 
 		 381 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2394  diaminopimelate decarboxylase  29.21 
 
 		 417 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.362349  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0041  diaminopimelate decarboxylase  30.75 
 
 		 414 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2027  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  31.93 
 
 		 406 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0377  ornithine decarboxylase  29.13 
 
 		 417 aa  124  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.412388  normal  0.928081 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0238  diaminopimelate decarboxylase  28.37 
 
 		 414 aa  123  6e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24058  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>