218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6050 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6050  integral membrane protein TerC  100 
 
 		 330 aa  652    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.022574  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2005  Integral membrane protein TerC  71.08 
 
 		 324 aa  432  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.466329 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5513  Integral membrane protein TerC  64.33 
 
 		 330 aa  399  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.195308  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3363  integral membrane protein TerC  61.74 
 
 		 332 aa  379  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3135  integral membrane protein TerC  61.07 
 
 		 332 aa  375  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25830  tellurium resistance membrane protein TerC  58.01 
 
 		 336 aa  369  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.322541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3760  Integral membrane protein TerC  55.03 
 
 		 399 aa  364  1e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495579  normal  0.0658998 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2025  putative transporter membrane protein  55.83 
 
 		 337 aa  356  1.9999999999999998e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.348042  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3019  Integral membrane protein TerC  54.82 
 
 		 343 aa  355  6.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.863775  normal  0.353723 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1533  Integral membrane protein TerC  55.28 
 
 		 333 aa  348  6e-95  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1772  Integral membrane protein TerC  54.1 
 
 		 332 aa  348  7e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.682835  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1962  Integral membrane protein TerC  58.23 
 
 		 369 aa  345  8.999999999999999e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121597  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3882  integral membrane protein TerC  52.23 
 
 		 352 aa  338  5e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06090  tellurium resistance membrane protein TerC  51.82 
 
 		 333 aa  333  2e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186577  normal  0.851737 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1955  Integral membrane protein TerC  52.05 
 
 		 352 aa  332  5e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1961  Integral membrane protein TerC  52.91 
 
 		 387 aa  332  7.000000000000001e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2183  Integral membrane protein TerC  51.52 
 
 		 330 aa  330  1e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157717  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2182  Integral membrane protein TerC  52.63 
 
 		 328 aa  329  4e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5646  Integral membrane protein TerC  54.66 
 
 		 367 aa  324  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0287071  normal  0.141305 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1534  Integral membrane protein TerC  55.45 
 
 		 328 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1104  integral membrane protein TerC  54.91 
 
 		 329 aa  320  3e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13030  tellurium resistance membrane protein TerC  48.96 
 
 		 342 aa  314  1.9999999999999998e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0291333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4785  integral membrane protein TerC  53.41 
 
 		 346 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0724265  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4871  integral membrane protein TerC  53.41 
 
 		 346 aa  313  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.878645  normal  0.656899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5171  integral membrane protein TerC  53.41 
 
 		 346 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657774  normal  0.0510984 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2071  integral membrane protein TerC  50.29 
 
 		 362 aa  313  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243682  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2194  Integral membrane protein TerC  51.49 
 
 		 350 aa  311  1e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1405  integral membrane protein TerC  52.8 
 
 		 348 aa  309  4e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5385  integral membrane protein TerC  51.19 
 
 		 341 aa  309  5e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00407258 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1249  Integral membrane protein TerC  52.05 
 
 		 330 aa  307  2.0000000000000002e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0563072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0919  integral membrane protein TerC  51.08 
 
 		 398 aa  305  5.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0742  membrane protein  52.6 
 
 		 328 aa  305  6e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0650  Integral membrane protein TerC  53.31 
 
 		 348 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1811  Integral membrane protein TerC  52.23 
 
 		 342 aa  301  1e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000488909 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2476  Integral membrane protein TerC  54.43 
 
 		 334 aa  298  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368959  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1056  Integral membrane protein TerC  49.84 
 
 		 360 aa  293  3e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30000  tellurium resistance membrane protein TerC  52.8 
 
 		 400 aa  288  7e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3228  integral membrane protein TerC  53.02 
 
 		 399 aa  288  9e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3290  integral membrane protein TerC  53.02 
 
 		 399 aa  288  9e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.459496 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3239  integral membrane protein TerC  53.02 
 
 		 399 aa  288  9e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0367734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1008  Integral membrane protein TerC  49.69 
 
 		 399 aa  288  1e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.200826 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5168  integral membrane protein TerC  54.4 
 
 		 338 aa  285  5e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.35637  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2919  Integral membrane protein TerC  56.84 
 
 		 337 aa  285  8e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1164  integral membrane protein TerC  55.79 
 
 		 337 aa  267  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.76671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4836  Integral membrane protein TerC  54.81 
 
 		 337 aa  264  1e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12736  integral membrane protein  49.33 
 
 		 397 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.616365 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0869  integral membrane protein TerC  53.9 
 
 		 346 aa  255  9e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11230  tellurium resistance membrane protein TerC  49.31 
 
 		 419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.530504  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  47.59 
 
 		 308 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  43.16 
 
 		 360 aa  251  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0285  integral membrane protein TerC  45.14 
 
 		 337 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22390  tellurium resistance membrane protein TerC  46.43 
 
 		 474 aa  249  4e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.335048  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  45.66 
 
 		 322 aa  248  9e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  45.66 
 
 		 322 aa  248  9e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  45.66 
 
 		 322 aa  248  9e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  43.87 
 
 		 344 aa  247  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  44.16 
 
 		 313 aa  247  3e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  41.46 
 
 		 325 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  49.27 
 
 		 334 aa  244  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  41.57 
 
 		 334 aa  242  5e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  44.03 
 
 		 321 aa  242  7.999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  42.49 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  43.31 
 
 		 329 aa  238  8e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  41.25 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1628  integral membrane protein TerC  45.31 
 
 		 334 aa  237  3e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  41.74 
 
 		 331 aa  235  8e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  43.37 
 
 		 339 aa  233  4.0000000000000004e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  41.08 
 
 		 321 aa  230  2e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2946  integral membrane protein TerC  42.06 
 
 		 322 aa  231  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0216006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  43.4 
 
 		 344 aa  228  8e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  40.32 
 
 		 311 aa  228  8e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3613  integral membrane protein TerC  43.08 
 
 		 342 aa  228  9e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  40.87 
 
 		 320 aa  228  9e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  38.98 
 
 		 321 aa  228  1e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1829  export protein  40.92 
 
 		 320 aa  228  2e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.942389  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2267  integral membrane protein TerC  44.38 
 
 		 346 aa  227  2e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26281  normal  0.0356305 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  39.93 
 
 		 308 aa  226  3e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  40.65 
 
 		 306 aa  226  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2053  integral membrane protein TerC  47.33 
 
 		 373 aa  226  6e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1762  integral membrane protein TerC  40.5 
 
 		 319 aa  225  7e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.974772  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  40.62 
 
 		 320 aa  223  4e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  41.22 
 
 		 318 aa  223  4e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  39.06 
 
 		 322 aa  223  4e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  40.62 
 
 		 312 aa  222  6e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  40.51 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  42.76 
 
 		 359 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  43.99 
 
 		 313 aa  218  8.999999999999998e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  38.89 
 
 		 325 aa  218  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2297  Integral membrane protein TerC  40.42 
 
 		 286 aa  218  1e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.610971  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11220  tellurium resistance membrane protein TerC  52.97 
 
 		 310 aa  218  1e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000188  membrane protein TerC  40.36 
 
 		 339 aa  216  5.9999999999999996e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000121417  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1094  protein alx  40.78 
 
 		 314 aa  215  9e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.901246  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0027  protein alx  40.78 
 
 		 314 aa  215  9e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  40.49 
 
 		 323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2123  integral membrane protein TerC  45.6 
 
 		 346 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.756712  normal  0.0151869 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  39.01 
 
 		 325 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  41.69 
 
 		 312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  41.31 
 
 		 338 aa  211  9e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0479  hypothetical protein  41.53 
 
 		 318 aa  209  4e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000001102  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  37.69 
 
 		 311 aa  209  6e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>