223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0184 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  100 
 
 		 321 aa  645    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  92.21 
 
 		 321 aa  612  9.999999999999999e-175  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  95.13 
 
 		 308 aa  600  1.0000000000000001e-171  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  53.44 
 
 		 328 aa  347  2e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  52.94 
 
 		 329 aa  340  2.9999999999999998e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  50.32 
 
 		 331 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  50.99 
 
 		 322 aa  327  2.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  48.2 
 
 		 311 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  49.36 
 
 		 321 aa  314  9.999999999999999e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  51.16 
 
 		 312 aa  312  3.9999999999999997e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  49.36 
 
 		 320 aa  311  7.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  51.84 
 
 		 318 aa  310  2e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  49.83 
 
 		 306 aa  309  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  53.44 
 
 		 313 aa  309  4e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  50.67 
 
 		 307 aa  308  8e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  50.35 
 
 		 328 aa  307  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  48.69 
 
 		 311 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  50 
 
 		 328 aa  305  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  46.89 
 
 		 310 aa  305  6e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  51.01 
 
 		 313 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  47.98 
 
 		 325 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  53.38 
 
 		 314 aa  302  4.0000000000000003e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  48.22 
 
 		 318 aa  301  7.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  51.03 
 
 		 314 aa  301  9e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  45 
 
 		 339 aa  301  1e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  49.16 
 
 		 311 aa  300  2e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  49.2 
 
 		 325 aa  297  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  48.85 
 
 		 312 aa  296  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10498  membrane protein, TerC family protein  48.39 
 
 		 322 aa  294  1e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  50.55 
 
 		 328 aa  293  3e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  44.66 
 
 		 322 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  44.77 
 
 		 360 aa  290  3e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  44.66 
 
 		 322 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  44.55 
 
 		 359 aa  290  3e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  44.66 
 
 		 322 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1443  integral membrane protein TerC  46.82 
 
 		 305 aa  289  5.0000000000000004e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.145143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  46.21 
 
 		 320 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2667  integral membrane protein TerC  46.91 
 
 		 318 aa  288  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  44.14 
 
 		 354 aa  288  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  48.84 
 
 		 323 aa  287  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  49.63 
 
 		 334 aa  286  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1947  Integral membrane protein TerC  47.67 
 
 		 320 aa  285  9e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204992  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  45 
 
 		 335 aa  283  3.0000000000000004e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  48.76 
 
 		 314 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  46.08 
 
 		 344 aa  282  4.0000000000000003e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  41.9 
 
 		 334 aa  282  6.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  48.32 
 
 		 317 aa  280  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1862  Integral membrane protein TerC  46.59 
 
 		 320 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201743  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2946  integral membrane protein TerC  42.9 
 
 		 322 aa  280  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0216006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2343  integral membrane protein TerC  44.3 
 
 		 324 aa  280  2e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.912158  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  43.73 
 
 		 344 aa  280  3e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  47.27 
 
 		 320 aa  278  9e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  49.67 
 
 		 325 aa  278  1e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2053  integral membrane protein TerC  47.67 
 
 		 373 aa  276  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  45.19 
 
 		 330 aa  276  4e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  45.17 
 
 		 354 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  46.73 
 
 		 312 aa  275  7e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0056  integral membrane protein TerC  44.55 
 
 		 329 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3613  integral membrane protein TerC  46.33 
 
 		 342 aa  272  5.000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  47.25 
 
 		 325 aa  272  6e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  46.31 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  44.04 
 
 		 354 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3680  integral membrane protein TerC  46.41 
 
 		 330 aa  270  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  46.31 
 
 		 337 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  46.31 
 
 		 322 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  46.31 
 
 		 322 aa  270  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  44.19 
 
 		 327 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  44.9 
 
 		 308 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  45.97 
 
 		 322 aa  268  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5359  TerC family protein  41.48 
 
 		 325 aa  268  8.999999999999999e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  hitchhiker  0.00169974 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  47.14 
 
 		 321 aa  267  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  47.14 
 
 		 321 aa  267  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  45.45 
 
 		 317 aa  268  1e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  47.14 
 
 		 321 aa  267  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  47.14 
 
 		 321 aa  267  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  47.14 
 
 		 320 aa  267  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1628  integral membrane protein TerC  43.62 
 
 		 334 aa  267  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  47.14 
 
 		 321 aa  268  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  47.14 
 
 		 321 aa  267  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  47.14 
 
 		 321 aa  268  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  47.39 
 
 		 327 aa  265  5e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2438  integral membrane protein TerC  44.84 
 
 		 329 aa  266  5e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3555  protein Alx  46.8 
 
 		 321 aa  266  5e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2993  integral membrane protein TerC  44.74 
 
 		 339 aa  265  8e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  48.34 
 
 		 338 aa  264  1e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  44.59 
 
 		 317 aa  264  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0510  hypothetical protein  45.31 
 
 		 316 aa  264  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  42.9 
 
 		 354 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  46.2 
 
 		 327 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  44.29 
 
 		 352 aa  263  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  44.16 
 
 		 354 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3543  integral membrane protein TerC  47.32 
 
 		 322 aa  262  4.999999999999999e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  46.86 
 
 		 327 aa  261  8e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  43.43 
 
 		 346 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2113  hypothetical protein  45.45 
 
 		 317 aa  260  2e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  44.11 
 
 		 317 aa  259  3e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  43.03 
 
 		 347 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  46.25 
 
 		 320 aa  256  3e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1946  Integral membrane protein TerC  39.7 
 
 		 337 aa  256  4e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.683729  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1943  Integral membrane protein TerC  46.53 
 
 		 332 aa  256  5e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>