232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2602 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  637    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  61.68 
 
 		 325 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  61.9 
 
 		 320 aa  401  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  60.19 
 
 		 325 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  64.54 
 
 		 323 aa  394  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  59.11 
 
 		 317 aa  383  1e-105  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  58.6 
 
 		 321 aa  374  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  58.6 
 
 		 321 aa  374  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  58.6 
 
 		 321 aa  374  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  58.6 
 
 		 321 aa  375  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  56.05 
 
 		 317 aa  375  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  56.23 
 
 		 317 aa  376  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  58.6 
 
 		 321 aa  375  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  58.6 
 
 		 321 aa  375  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  58.28 
 
 		 321 aa  373  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2113  hypothetical protein  59.11 
 
 		 317 aa  371  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3555  protein Alx  58.28 
 
 		 321 aa  373  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4318  integral membrane protein TerC  58.79 
 
 		 325 aa  374  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  56.55 
 
 		 322 aa  372  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  58.6 
 
 		 320 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  56.55 
 
 		 322 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  56.09 
 
 		 317 aa  371  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  56.23 
 
 		 337 aa  368  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0510  hypothetical protein  59.61 
 
 		 316 aa  369  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  56.23 
 
 		 322 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  56.23 
 
 		 322 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4461  integral membrane protein TerC  59.68 
 
 		 334 aa  362  5.0000000000000005e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105782 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3543  integral membrane protein TerC  58.79 
 
 		 322 aa  362  5.0000000000000005e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  57.59 
 
 		 320 aa  352  4e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1762  integral membrane protein TerC  55.24 
 
 		 319 aa  348  8e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.974772  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3381  Integral membrane protein TerC  55.95 
 
 		 319 aa  347  1e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1829  export protein  55.1 
 
 		 320 aa  346  4e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.942389  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03496  export protein  55.87 
 
 		 318 aa  339  5e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3859  integral membrane protein TerC  56.6 
 
 		 327 aa  328  6e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.891237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3132  Integral membrane protein TerC  56.6 
 
 		 327 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1080  integral membrane protein TerC  56.99 
 
 		 315 aa  317  2e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.132797  normal  0.336795 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  53.94 
 
 		 331 aa  317  2e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  52.85 
 
 		 320 aa  310  2.9999999999999997e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  52.35 
 
 		 329 aa  307  2.0000000000000002e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  52.06 
 
 		 328 aa  303  2.0000000000000002e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  50.46 
 
 		 330 aa  292  6e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  52.58 
 
 		 328 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  51.55 
 
 		 328 aa  290  2e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  52.73 
 
 		 338 aa  287  1e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  53.95 
 
 		 314 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2667  integral membrane protein TerC  50 
 
 		 318 aa  282  5.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  49.67 
 
 		 321 aa  281  8.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  46.18 
 
 		 311 aa  280  2e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  46.25 
 
 		 306 aa  280  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  49.67 
 
 		 321 aa  278  1e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  48.72 
 
 		 313 aa  277  2e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  54.55 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  50.8 
 
 		 359 aa  277  2e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  50.34 
 
 		 308 aa  276  3e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1946  Integral membrane protein TerC  47.65 
 
 		 337 aa  276  3e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.683729  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  45.05 
 
 		 311 aa  276  4e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  53.94 
 
 		 334 aa  275  9e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  49.53 
 
 		 352 aa  273  4.0000000000000004e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0056  integral membrane protein TerC  48.6 
 
 		 329 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  47.09 
 
 		 321 aa  272  6e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  50 
 
 		 325 aa  271  9e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  45.28 
 
 		 307 aa  271  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  47.06 
 
 		 327 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  44.23 
 
 		 310 aa  267  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  50 
 
 		 314 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  49.35 
 
 		 313 aa  263  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  47.52 
 
 		 327 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3680  integral membrane protein TerC  46.36 
 
 		 330 aa  263  3e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  48.74 
 
 		 327 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  46.52 
 
 		 318 aa  261  8e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  45.45 
 
 		 354 aa  261  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1586  integral membrane protein TerC  46.53 
 
 		 328 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0942  integral membrane protein TerC  46.18 
 
 		 328 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2543  integral membrane protein TerC  46.85 
 
 		 327 aa  258  7e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2610  integral membrane protein TerC  46.85 
 
 		 327 aa  258  7e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1747  hypothetical protein  45.92 
 
 		 325 aa  258  9e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2710  integral membrane protein TerC  46.22 
 
 		 325 aa  258  1e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  48.4 
 
 		 320 aa  257  2e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  47.91 
 
 		 312 aa  257  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1553  integral membrane protein TerC  46.22 
 
 		 328 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.729834  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2793  Integral membrane protein TerC  46.22 
 
 		 328 aa  257  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1557  integral membrane protein TerC  45.92 
 
 		 328 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4279  hypothetical protein  45.62 
 
 		 325 aa  256  4e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  47.57 
 
 		 312 aa  256  5e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1451  integral membrane protein TerC  45.32 
 
 		 328 aa  255  9e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5359  TerC family protein  46.25 
 
 		 325 aa  255  9e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  hitchhiker  0.00169974 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  48.43 
 
 		 347 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  44.62 
 
 		 322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1947  Integral membrane protein TerC  49.47 
 
 		 320 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204992  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  47.83 
 
 		 354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  48.68 
 
 		 354 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  49.2 
 
 		 346 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  47.84 
 
 		 354 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  45.66 
 
 		 312 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1862  Integral membrane protein TerC  49.11 
 
 		 320 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201743  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  48.99 
 
 		 354 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3199  integral membrane protein TerC  45.57 
 
 		 329 aa  252  6e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  47.1 
 
 		 314 aa  252  7e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  44.6 
 
 		 318 aa  252  8.000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  44.79 
 
 		 311 aa  250  2e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>