229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03496 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03496  export protein  100 
 
 
318 aa  624  1e-178  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1762  integral membrane protein TerC  81.76 
 
 
319 aa  528  1e-149  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.974772  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1829  export protein  81.45 
 
 
320 aa  525  1e-148  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.942389  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  79 
 
 
320 aa  502  1e-141  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  59.25 
 
 
320 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  58.39 
 
 
325 aa  369  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4461  integral membrane protein TerC  59.87 
 
 
334 aa  362  6e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.105782 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  57.61 
 
 
317 aa  354  1e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  58.77 
 
 
322 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  58.77 
 
 
322 aa  352  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  58.77 
 
 
322 aa  352  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  58.77 
 
 
322 aa  352  5.9999999999999994e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  59.42 
 
 
321 aa  352  7e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  57.61 
 
 
317 aa  352  7e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  59.42 
 
 
321 aa  351  8e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  59.42 
 
 
321 aa  350  1e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  59.42 
 
 
321 aa  350  1e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  59.42 
 
 
321 aa  351  1e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  57.28 
 
 
317 aa  351  1e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  59.42 
 
 
321 aa  351  1e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  59.42 
 
 
320 aa  350  1e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  58.77 
 
 
337 aa  351  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  59.42 
 
 
321 aa  350  1e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  55.84 
 
 
325 aa  350  2e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3555  protein Alx  59.09 
 
 
321 aa  349  3e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  55.87 
 
 
325 aa  349  3e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3132  Integral membrane protein TerC  59.01 
 
 
327 aa  349  4e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3859  integral membrane protein TerC  58.7 
 
 
327 aa  347  1e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.891237  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  55.81 
 
 
323 aa  342  5e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3381  Integral membrane protein TerC  59.22 
 
 
319 aa  339  2.9999999999999998e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3543  integral membrane protein TerC  58.12 
 
 
322 aa  336  2.9999999999999997e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4318  integral membrane protein TerC  56.17 
 
 
325 aa  332  5e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0510  hypothetical protein  54.52 
 
 
316 aa  331  9e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  52.1 
 
 
317 aa  325  5e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2113  hypothetical protein  52.1 
 
 
317 aa  321  9.999999999999999e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  49.36 
 
 
328 aa  294  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1080  integral membrane protein TerC  52.26 
 
 
315 aa  294  2e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.132797  normal  0.336795 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  50.48 
 
 
329 aa  287  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  47.95 
 
 
331 aa  285  7e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  49.06 
 
 
328 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  48.74 
 
 
328 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  46.95 
 
 
320 aa  273  3e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2667  integral membrane protein TerC  44.87 
 
 
318 aa  269  5e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1946  Integral membrane protein TerC  44.98 
 
 
337 aa  266  4e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.683729  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  49.83 
 
 
328 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  45.22 
 
 
330 aa  265  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  45.42 
 
 
321 aa  263  3e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  46.08 
 
 
327 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  47.02 
 
 
338 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  46.67 
 
 
308 aa  262  6.999999999999999e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  46.52 
 
 
313 aa  261  8e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  48.71 
 
 
325 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  45.65 
 
 
327 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  44.12 
 
 
321 aa  260  2e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  49.83 
 
 
314 aa  260  2e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  45.31 
 
 
327 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  45.83 
 
 
359 aa  259  3e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  43.52 
 
 
311 aa  259  4e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  47.85 
 
 
314 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0056  integral membrane protein TerC  46.88 
 
 
329 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  42.48 
 
 
306 aa  255  5e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  46.33 
 
 
327 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  46.79 
 
 
313 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  42.38 
 
 
311 aa  253  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  48.1 
 
 
347 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  48.1 
 
 
346 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  49.83 
 
 
334 aa  250  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  43.63 
 
 
318 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  41.5 
 
 
307 aa  247  2e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  44.83 
 
 
321 aa  246  3e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  45.31 
 
 
312 aa  246  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2543  integral membrane protein TerC  42.99 
 
 
327 aa  246  4e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2610  integral membrane protein TerC  42.99 
 
 
327 aa  246  4e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2710  integral membrane protein TerC  42.99 
 
 
325 aa  246  4e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2438  integral membrane protein TerC  45.79 
 
 
329 aa  246  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622946  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1747  hypothetical protein  42.99 
 
 
325 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3680  integral membrane protein TerC  45.67 
 
 
330 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  43.81 
 
 
354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4279  hypothetical protein  42.68 
 
 
325 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2793  Integral membrane protein TerC  43.22 
 
 
328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1557  integral membrane protein TerC  43.22 
 
 
328 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  43.81 
 
 
354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1553  integral membrane protein TerC  43.22 
 
 
328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.729834  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  41.88 
 
 
310 aa  243  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1586  integral membrane protein TerC  42.9 
 
 
328 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  43.63 
 
 
354 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  42.86 
 
 
354 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  44.95 
 
 
312 aa  242  5e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  44.26 
 
 
312 aa  242  7e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  44.26 
 
 
352 aa  241  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1443  integral membrane protein TerC  43.18 
 
 
305 aa  241  1e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.145143  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  41.72 
 
 
354 aa  241  1e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1451  integral membrane protein TerC  42.9 
 
 
328 aa  241  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  43.45 
 
 
322 aa  240  2.9999999999999997e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0479  hypothetical protein  45.39 
 
 
318 aa  239  4e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000001102  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5359  TerC family protein  44.38 
 
 
325 aa  239  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.114229  hitchhiker  0.00169974 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  44.41 
 
 
318 aa  239  5.999999999999999e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0942  integral membrane protein TerC  42.99 
 
 
328 aa  238  8e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  43.18 
 
 
311 aa  238  1e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  43.09 
 
 
322 aa  238  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>