230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3859 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3859  integral membrane protein TerC  100 
 
 
327 aa  642    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.891237  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3132  Integral membrane protein TerC  99.39 
 
 
327 aa  637    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4461  integral membrane protein TerC  81.87 
 
 
334 aa  509  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.105782 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  60.65 
 
 
320 aa  379  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  58.2 
 
 
320 aa  377  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03496  export protein  58.7 
 
 
318 aa  371  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  59.22 
 
 
325 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1762  integral membrane protein TerC  56.92 
 
 
319 aa  370  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.974772  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1829  export protein  57.93 
 
 
320 aa  366  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.942389  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  56.29 
 
 
323 aa  365  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  56.6 
 
 
325 aa  358  9e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  53.89 
 
 
325 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  56.48 
 
 
317 aa  355  5e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  55.02 
 
 
317 aa  348  6e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  56.62 
 
 
317 aa  347  2e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  53.72 
 
 
317 aa  342  5e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  53.25 
 
 
322 aa  341  8e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  53.25 
 
 
322 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  53.25 
 
 
322 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  53.25 
 
 
322 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  53.25 
 
 
337 aa  339  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0510  hypothetical protein  52.4 
 
 
316 aa  338  7e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4318  integral membrane protein TerC  53.09 
 
 
325 aa  337  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  54.76 
 
 
321 aa  334  1e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  54.76 
 
 
321 aa  333  2e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  54.76 
 
 
321 aa  333  2e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2113  hypothetical protein  56.62 
 
 
317 aa  333  2e-90  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  54.76 
 
 
321 aa  333  2e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  54.76 
 
 
321 aa  333  2e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  54.76 
 
 
320 aa  333  2e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  54.76 
 
 
321 aa  333  3e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  54.76 
 
 
321 aa  333  3e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3555  protein Alx  54.42 
 
 
321 aa  332  6e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3543  integral membrane protein TerC  53.57 
 
 
322 aa  329  4e-89  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3381  Integral membrane protein TerC  54.05 
 
 
319 aa  324  1e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  52.23 
 
 
331 aa  301  1e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  50.31 
 
 
338 aa  293  3e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  50.16 
 
 
328 aa  284  1.0000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  51.48 
 
 
320 aa  284  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1080  integral membrane protein TerC  50.34 
 
 
315 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.132797  normal  0.336795 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  49.08 
 
 
359 aa  278  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  46.11 
 
 
328 aa  275  7e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  46.11 
 
 
328 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  46.73 
 
 
330 aa  266  4e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0056  integral membrane protein TerC  45.43 
 
 
329 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  45.77 
 
 
327 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  48.1 
 
 
328 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  48.04 
 
 
313 aa  262  4.999999999999999e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  45.21 
 
 
329 aa  262  6e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  48.68 
 
 
314 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  43.87 
 
 
318 aa  260  3e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2667  integral membrane protein TerC  46.58 
 
 
318 aa  259  4e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  47.15 
 
 
325 aa  258  8e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1946  Integral membrane protein TerC  43.9 
 
 
337 aa  258  8e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.683729  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  44.13 
 
 
311 aa  258  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3680  integral membrane protein TerC  44.38 
 
 
330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  43.42 
 
 
306 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  50.18 
 
 
321 aa  253  3e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  48.11 
 
 
334 aa  253  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  43.81 
 
 
322 aa  253  4.0000000000000004e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  41.67 
 
 
311 aa  251  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0942  integral membrane protein TerC  45.19 
 
 
328 aa  249  4e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  46.11 
 
 
312 aa  247  2e-64  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  45.51 
 
 
327 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  45.85 
 
 
347 aa  246  4e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  43.96 
 
 
352 aa  245  6e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  47.25 
 
 
346 aa  245  8e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  42.11 
 
 
307 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  41.07 
 
 
321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  44.62 
 
 
354 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  43.03 
 
 
354 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  44.62 
 
 
354 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  41.69 
 
 
321 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  41.96 
 
 
354 aa  242  5e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  44.58 
 
 
327 aa  242  6e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  43.71 
 
 
354 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  44.97 
 
 
314 aa  241  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  44.41 
 
 
311 aa  241  1e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  45.9 
 
 
318 aa  241  1e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0027  protein alx  42.31 
 
 
314 aa  240  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  45.91 
 
 
320 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1094  protein alx  42.31 
 
 
314 aa  240  2e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.901246  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  39.75 
 
 
310 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  45.82 
 
 
344 aa  239  4e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3199  integral membrane protein TerC  41.67 
 
 
329 aa  239  6.999999999999999e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  41.16 
 
 
308 aa  238  1e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2543  integral membrane protein TerC  43.21 
 
 
327 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2610  integral membrane protein TerC  43.21 
 
 
327 aa  238  1e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2710  integral membrane protein TerC  43.99 
 
 
325 aa  238  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1947  Integral membrane protein TerC  45.36 
 
 
320 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204992  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1862  Integral membrane protein TerC  45.36 
 
 
320 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201743  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1747  hypothetical protein  43.99 
 
 
325 aa  237  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  46.05 
 
 
327 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  42.95 
 
 
322 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  42.95 
 
 
322 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  42.95 
 
 
322 aa  238  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2343  integral membrane protein TerC  45.33 
 
 
324 aa  236  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.912158  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2793  Integral membrane protein TerC  42.86 
 
 
328 aa  236  4e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2438  integral membrane protein TerC  44.06 
 
 
329 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.622946  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1553  integral membrane protein TerC  42.86 
 
 
328 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.729834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>