232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1080 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1080  integral membrane protein TerC  100 
 
 		 315 aa  628  1e-179  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.132797  normal  0.336795 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  57.86 
 
 		 317 aa  341  8e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  58.57 
 
 		 317 aa  341  1e-92  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  60.87 
 
 		 322 aa  339  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  58.28 
 
 		 321 aa  339  4e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  58.28 
 
 		 321 aa  339  4e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  58.28 
 
 		 321 aa  339  4e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  58.02 
 
 		 321 aa  338  5e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  58.28 
 
 		 320 aa  339  5e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  58.28 
 
 		 321 aa  338  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  58.28 
 
 		 321 aa  338  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  60.87 
 
 		 322 aa  338  8e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  58.28 
 
 		 321 aa  338  9e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  60.87 
 
 		 322 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3555  protein Alx  57.68 
 
 		 321 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  60.87 
 
 		 322 aa  337  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  60.87 
 
 		 337 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  55.73 
 
 		 325 aa  333  2e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  55.94 
 
 		 323 aa  332  4e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  56.07 
 
 		 317 aa  332  6e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  54.81 
 
 		 320 aa  329  4e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3543  integral membrane protein TerC  58.22 
 
 		 322 aa  326  3e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  56.99 
 
 		 325 aa  317  1e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0510  hypothetical protein  53.06 
 
 		 316 aa  317  1e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4318  integral membrane protein TerC  55.82 
 
 		 325 aa  317  2e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3381  Integral membrane protein TerC  57.3 
 
 		 319 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  51.2 
 
 		 325 aa  309  4e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  50.67 
 
 		 320 aa  307  2.0000000000000002e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1762  integral membrane protein TerC  50.5 
 
 		 319 aa  293  3e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.974772  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1829  export protein  51.57 
 
 		 320 aa  292  4e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.942389  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03496  export protein  52.26 
 
 		 318 aa  288  6e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  50.17 
 
 		 317 aa  285  5.999999999999999e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2113  hypothetical protein  50.17 
 
 		 317 aa  272  4.0000000000000004e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4461  integral membrane protein TerC  53.76 
 
 		 334 aa  266  4e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105782 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  48.08 
 
 		 328 aa  265  5.999999999999999e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3859  integral membrane protein TerC  50.52 
 
 		 327 aa  265  8.999999999999999e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.891237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3132  Integral membrane protein TerC  51.42 
 
 		 327 aa  264  2e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  46.15 
 
 		 320 aa  258  9e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  43.52 
 
 		 331 aa  257  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  45.8 
 
 		 312 aa  252  7e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  46.76 
 
 		 313 aa  250  2e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  46.13 
 
 		 338 aa  249  4e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  45.95 
 
 		 328 aa  249  5e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  42.27 
 
 		 311 aa  248  8e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  49.83 
 
 		 334 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2667  integral membrane protein TerC  43.75 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  46.5 
 
 		 329 aa  246  3e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  45.61 
 
 		 328 aa  245  6e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  44.67 
 
 		 306 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  41.99 
 
 		 308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  43.16 
 
 		 310 aa  241  9e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  40.7 
 
 		 321 aa  241  1e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2343  integral membrane protein TerC  44.33 
 
 		 324 aa  241  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.912158  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  45.14 
 
 		 313 aa  240  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  40.93 
 
 		 321 aa  239  4e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  44.84 
 
 		 325 aa  238  6.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  44.33 
 
 		 307 aa  238  8e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  46.15 
 
 		 314 aa  238  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  45.68 
 
 		 327 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  40.68 
 
 		 311 aa  235  6e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  42.46 
 
 		 311 aa  235  7e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1946  Integral membrane protein TerC  45.91 
 
 		 337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.683729  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  43.4 
 
 		 321 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  46.49 
 
 		 314 aa  233  3e-60  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  42.72 
 
 		 327 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3680  integral membrane protein TerC  42.33 
 
 		 330 aa  231  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  45.86 
 
 		 328 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  44.71 
 
 		 344 aa  230  3e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  42.05 
 
 		 327 aa  229  4e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  42.31 
 
 		 322 aa  229  5e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  44.32 
 
 		 354 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10498  membrane protein, TerC family protein  40.33 
 
 		 322 aa  228  1e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  44.57 
 
 		 354 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2793  Integral membrane protein TerC  45.3 
 
 		 328 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  43.02 
 
 		 354 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1553  integral membrane protein TerC  45.3 
 
 		 328 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.729834  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  45.15 
 
 		 330 aa  226  4e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  43.81 
 
 		 344 aa  226  4e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  42.25 
 
 		 359 aa  226  4e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1557  integral membrane protein TerC  45.3 
 
 		 328 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  43.94 
 
 		 354 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1747  hypothetical protein  45.74 
 
 		 325 aa  223  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4279  hypothetical protein  43.89 
 
 		 325 aa  223  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2297  Integral membrane protein TerC  39.24 
 
 		 286 aa  223  4e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.610971  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2543  integral membrane protein TerC  43.61 
 
 		 327 aa  223  4e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2610  integral membrane protein TerC  43.61 
 
 		 327 aa  223  4e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1586  integral membrane protein TerC  44.63 
 
 		 328 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1451  integral membrane protein TerC  45.3 
 
 		 328 aa  223  4e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2710  integral membrane protein TerC  43.89 
 
 		 325 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  43.63 
 
 		 346 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000188  membrane protein TerC  40.86 
 
 		 339 aa  222  6e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000121417  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  43.63 
 
 		 347 aa  222  6e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  41.97 
 
 		 320 aa  221  9e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  38.62 
 
 		 318 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1947  Integral membrane protein TerC  40.34 
 
 		 320 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204992  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1628  integral membrane protein TerC  42.46 
 
 		 334 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  41.1 
 
 		 312 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06090  tellurium resistance membrane protein TerC  38.18 
 
 		 333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186577  normal  0.851737 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  41.46 
 
 		 314 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2053  integral membrane protein TerC  44.98 
 
 		 373 aa  219  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  normal  0.603844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>