224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0811 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  100 
 
 
313 aa  613  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  82.75 
 
 
314 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  71.24 
 
 
312 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  65.73 
 
 
314 aa  397  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  67.11 
 
 
312 aa  396  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  57.89 
 
 
306 aa  360  1e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  57.57 
 
 
307 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  56.86 
 
 
310 aa  353  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  58.92 
 
 
328 aa  344  1e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  54.34 
 
 
311 aa  343  2e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  54.4 
 
 
311 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  55.37 
 
 
329 aa  319  3.9999999999999996e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  53.44 
 
 
321 aa  309  4e-83  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  49.69 
 
 
320 aa  308  5.9999999999999995e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  51.15 
 
 
321 aa  301  7.000000000000001e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  52.72 
 
 
308 aa  300  2e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  48.25 
 
 
331 aa  294  1e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  50.16 
 
 
321 aa  290  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  49.18 
 
 
311 aa  281  8.000000000000001e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2667  integral membrane protein TerC  48.26 
 
 
318 aa  281  9e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1443  integral membrane protein TerC  50.67 
 
 
305 aa  281  1e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.145143  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  50 
 
 
317 aa  278  8e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  55.02 
 
 
359 aa  278  8e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  52.76 
 
 
328 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  52.76 
 
 
328 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  47.85 
 
 
322 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  47.85 
 
 
322 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  47.85 
 
 
322 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  51.69 
 
 
322 aa  276  4e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  50.17 
 
 
322 aa  275  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  50.17 
 
 
322 aa  275  6e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  50.17 
 
 
322 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  50.17 
 
 
322 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  50.69 
 
 
321 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  50.17 
 
 
337 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  50.69 
 
 
321 aa  273  3e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  50.69 
 
 
321 aa  273  3e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  50.69 
 
 
321 aa  273  3e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  50.69 
 
 
321 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  50.69 
 
 
321 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1647  Integral membrane protein TerC  49.44 
 
 
279 aa  272  4.0000000000000004e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.409513  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  50.69 
 
 
320 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  50.69 
 
 
321 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  46.75 
 
 
335 aa  272  5.000000000000001e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  49.67 
 
 
320 aa  271  7e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  50.99 
 
 
317 aa  271  7e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3555  protein Alx  50.17 
 
 
321 aa  272  7e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  49.35 
 
 
318 aa  271  9e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  49.06 
 
 
325 aa  271  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4318  integral membrane protein TerC  48.1 
 
 
325 aa  271  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  49.84 
 
 
317 aa  270  2e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  49.17 
 
 
318 aa  269  5e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  53.53 
 
 
338 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  46.1 
 
 
334 aa  267  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  48.04 
 
 
320 aa  266  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  46.67 
 
 
360 aa  266  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2946  integral membrane protein TerC  44.44 
 
 
322 aa  264  1e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0216006  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  49.35 
 
 
325 aa  263  2e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  49.83 
 
 
314 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  46.6 
 
 
317 aa  263  3e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  51.88 
 
 
312 aa  263  3e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3543  integral membrane protein TerC  48.11 
 
 
322 aa  263  4e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  52.83 
 
 
328 aa  262  6.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  48.38 
 
 
308 aa  262  6.999999999999999e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0510  hypothetical protein  47.71 
 
 
316 aa  261  1e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  47.45 
 
 
325 aa  258  8e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  46.28 
 
 
325 aa  258  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2113  hypothetical protein  46.6 
 
 
317 aa  257  2e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  50.18 
 
 
313 aa  255  7e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3381  Integral membrane protein TerC  47.68 
 
 
319 aa  254  9e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  48.55 
 
 
323 aa  253  3e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  49.64 
 
 
334 aa  252  6e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4581  Integral membrane protein TerC  42.06 
 
 
357 aa  252  6e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.25149  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  46.88 
 
 
320 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1946  Integral membrane protein TerC  51.31 
 
 
337 aa  249  6e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.683729  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10498  membrane protein, TerC family protein  44.44 
 
 
322 aa  248  7e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1628  integral membrane protein TerC  46.08 
 
 
334 aa  248  1e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2297  Integral membrane protein TerC  46.13 
 
 
286 aa  247  2e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.610971  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  44.97 
 
 
339 aa  245  4.9999999999999997e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1862  Integral membrane protein TerC  45.99 
 
 
320 aa  245  6.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201743  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1829  export protein  45.66 
 
 
320 aa  244  9.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.942389  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1947  Integral membrane protein TerC  45.64 
 
 
320 aa  243  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204992  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05912  hypothetical protein  40.55 
 
 
343 aa  243  1.9999999999999999e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  42.53 
 
 
327 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1762  integral membrane protein TerC  45.48 
 
 
319 aa  243  5e-63  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.974772  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2343  integral membrane protein TerC  45.25 
 
 
324 aa  242  5e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.912158  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03496  export protein  46.79 
 
 
318 aa  242  6e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5754  Integral membrane protein TerC  42.7 
 
 
354 aa  241  7.999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5513  Integral membrane protein TerC  42.64 
 
 
330 aa  241  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.195308  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1080  integral membrane protein TerC  45.14 
 
 
315 aa  240  2e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.132797  normal  0.336795 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2182  Integral membrane protein TerC  44.37 
 
 
328 aa  240  2e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  44.76 
 
 
354 aa  239  5e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  45.17 
 
 
354 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  42.21 
 
 
327 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000188  membrane protein TerC  41.46 
 
 
339 aa  238  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000121417  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  44.07 
 
 
354 aa  238  1e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  44.76 
 
 
354 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  44.88 
 
 
344 aa  236  4e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  40.51 
 
 
354 aa  236  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  42.53 
 
 
344 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>