263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05912 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05912  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  693    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000188  membrane protein TerC  89.94 
 
 		 339 aa  624  1e-178  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000121417  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0479  hypothetical protein  73.31 
 
 		 318 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000001102  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1094  protein alx  58.63 
 
 		 314 aa  361  9e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.901246  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0027  protein alx  58.63 
 
 		 314 aa  361  9e-99  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1566  integral membrane protein TerC  54.17 
 
 		 320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  46.62 
 
 		 320 aa  288  1e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  45.02 
 
 		 331 aa  281  8.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  44.94 
 
 		 328 aa  265  1e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  42.21 
 
 		 329 aa  252  7e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  41.54 
 
 		 359 aa  249  6e-65  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  43.52 
 
 		 334 aa  243  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  40.55 
 
 		 313 aa  243  3e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  43.22 
 
 		 318 aa  242  7e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  40.49 
 
 		 325 aa  241  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  40.26 
 
 		 322 aa  239  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  40.26 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  40.26 
 
 		 322 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  40.26 
 
 		 337 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  39.03 
 
 		 317 aa  236  4e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  44.59 
 
 		 318 aa  236  4e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  39.94 
 
 		 322 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  40.68 
 
 		 314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0285  integral membrane protein TerC  40.92 
 
 		 337 aa  233  3e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  38.99 
 
 		 325 aa  233  3e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  40.12 
 
 		 360 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  41.12 
 
 		 306 aa  233  5e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  39.62 
 
 		 314 aa  232  6e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  40.88 
 
 		 320 aa  231  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  43.79 
 
 		 313 aa  231  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  39.23 
 
 		 312 aa  231  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3543  integral membrane protein TerC  40.13 
 
 		 322 aa  231  1e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  41.35 
 
 		 322 aa  231  2e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  39.24 
 
 		 321 aa  230  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4318  integral membrane protein TerC  39.56 
 
 		 325 aa  230  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  39.24 
 
 		 321 aa  230  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  41.03 
 
 		 320 aa  229  4e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  40.65 
 
 		 311 aa  229  7e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2343  integral membrane protein TerC  41.33 
 
 		 324 aa  229  7e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.912158  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  37.42 
 
 		 321 aa  228  8e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  39.3 
 
 		 321 aa  228  8e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  39.3 
 
 		 321 aa  228  9e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  39.3 
 
 		 321 aa  228  9e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  39.3 
 
 		 321 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  39.3 
 
 		 320 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  40.41 
 
 		 310 aa  228  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  39.3 
 
 		 321 aa  228  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  38.78 
 
 		 328 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3555  protein Alx  38.98 
 
 		 321 aa  226  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  39.8 
 
 		 307 aa  226  4e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1862  Integral membrane protein TerC  39.53 
 
 		 320 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201743  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  39.29 
 
 		 328 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4461  integral membrane protein TerC  42.53 
 
 		 334 aa  226  6e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105782 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1762  integral membrane protein TerC  40.79 
 
 		 319 aa  226  6e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.974772  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  37.94 
 
 		 317 aa  225  7e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  39.37 
 
 		 320 aa  225  8e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  39.1 
 
 		 311 aa  224  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  38.59 
 
 		 311 aa  225  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  47.41 
 
 		 312 aa  224  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1829  export protein  40.79 
 
 		 320 aa  224  1e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.942389  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1947  Integral membrane protein TerC  39.19 
 
 		 320 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204992  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  41.69 
 
 		 344 aa  224  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  41.99 
 
 		 344 aa  223  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  36.98 
 
 		 317 aa  222  9e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  39.16 
 
 		 321 aa  221  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10498  membrane protein, TerC family protein  36 
 
 		 322 aa  221  9.999999999999999e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  39.12 
 
 		 338 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  36.36 
 
 		 308 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03496  export protein  41.83 
 
 		 318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  39.2 
 
 		 312 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  36.57 
 
 		 321 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  42.6 
 
 		 328 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2025  putative transporter membrane protein  44.37 
 
 		 337 aa  219  6e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.348042  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  38.49 
 
 		 325 aa  219  6e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2667  integral membrane protein TerC  38.11 
 
 		 318 aa  218  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0650  Integral membrane protein TerC  45.31 
 
 		 348 aa  218  1e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3381  Integral membrane protein TerC  39.35 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  39.93 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  38.18 
 
 		 352 aa  217  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25830  tellurium resistance membrane protein TerC  39.67 
 
 		 336 aa  216  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.322541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1962  Integral membrane protein TerC  42.02 
 
 		 369 aa  216  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121597  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2053  integral membrane protein TerC  42.27 
 
 		 373 aa  216  5e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2152  integral membrane protein TerC  36.53 
 
 		 405 aa  216  5e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.305703  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5513  Integral membrane protein TerC  41.56 
 
 		 330 aa  216  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.195308  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  37.42 
 
 		 314 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  39.56 
 
 		 323 aa  216  5.9999999999999996e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  38.61 
 
 		 339 aa  215  7e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  37.93 
 
 		 325 aa  215  9e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3019  Integral membrane protein TerC  39.27 
 
 		 343 aa  214  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.863775  normal  0.353723 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0510  hypothetical protein  36.39 
 
 		 316 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0742  membrane protein  39.76 
 
 		 328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5646  Integral membrane protein TerC  44.27 
 
 		 367 aa  213  3.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0287071  normal  0.141305 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  39.46 
 
 		 354 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2194  Integral membrane protein TerC  40.06 
 
 		 350 aa  212  5.999999999999999e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1080  integral membrane protein TerC  38.54 
 
 		 315 aa  212  7e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.132797  normal  0.336795 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  38.08 
 
 		 347 aa  212  7e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1249  Integral membrane protein TerC  42.52 
 
 		 330 aa  212  9e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0563072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  36.59 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  40.29 
 
 		 327 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  37.86 
 
 		 346 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>