224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0285 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0285  integral membrane protein TerC  100 
 
 
337 aa  660    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2267  integral membrane protein TerC  69.84 
 
 
346 aa  403  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26281  normal  0.0356305 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2123  integral membrane protein TerC  68.73 
 
 
346 aa  384  1e-106  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.756712  normal  0.0151869 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3019  Integral membrane protein TerC  43.56 
 
 
343 aa  276  4e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.863775  normal  0.353723 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2025  putative transporter membrane protein  46.52 
 
 
337 aa  271  9e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.348042  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2476  Integral membrane protein TerC  46.84 
 
 
334 aa  271  9e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368959  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1772  Integral membrane protein TerC  44.62 
 
 
332 aa  269  4e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.682835  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5513  Integral membrane protein TerC  45.26 
 
 
330 aa  267  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.195308  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2183  Integral membrane protein TerC  45.09 
 
 
330 aa  266  2.9999999999999995e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157717  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0650  Integral membrane protein TerC  47.5 
 
 
348 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5168  integral membrane protein TerC  46.84 
 
 
338 aa  264  1e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.35637  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1955  Integral membrane protein TerC  45.69 
 
 
352 aa  264  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1533  Integral membrane protein TerC  45.74 
 
 
333 aa  264  2e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1249  Integral membrane protein TerC  44.04 
 
 
330 aa  263  3e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0563072  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  46.03 
 
 
360 aa  262  6e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2919  Integral membrane protein TerC  51.86 
 
 
337 aa  259  4e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06090  tellurium resistance membrane protein TerC  44 
 
 
333 aa  259  5.0000000000000005e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186577  normal  0.851737 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2194  Integral membrane protein TerC  44.21 
 
 
350 aa  259  6e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1961  Integral membrane protein TerC  44.51 
 
 
387 aa  258  8e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25830  tellurium resistance membrane protein TerC  45.91 
 
 
336 aa  258  1e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.322541  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3760  Integral membrane protein TerC  42.68 
 
 
399 aa  257  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495579  normal  0.0658998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6050  integral membrane protein TerC  45.14 
 
 
330 aa  256  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.022574  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0919  integral membrane protein TerC  42.68 
 
 
398 aa  254  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4836  Integral membrane protein TerC  49.05 
 
 
337 aa  251  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2182  Integral membrane protein TerC  46.04 
 
 
328 aa  249  4e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1008  Integral membrane protein TerC  42.42 
 
 
399 aa  249  4e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.200826 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3228  integral membrane protein TerC  43.54 
 
 
399 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3290  integral membrane protein TerC  43.54 
 
 
399 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.459496 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3239  integral membrane protein TerC  43.54 
 
 
399 aa  248  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0367734  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5385  integral membrane protein TerC  43.6 
 
 
341 aa  247  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00407258 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3882  integral membrane protein TerC  40.3 
 
 
352 aa  246  4.9999999999999997e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1104  integral membrane protein TerC  43.44 
 
 
329 aa  245  6.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3363  integral membrane protein TerC  44.63 
 
 
332 aa  245  6.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3135  integral membrane protein TerC  44.63 
 
 
332 aa  245  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  40.98 
 
 
328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1164  integral membrane protein TerC  48.47 
 
 
337 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.76671  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1056  Integral membrane protein TerC  40.06 
 
 
360 aa  243  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1405  integral membrane protein TerC  45.08 
 
 
348 aa  242  6e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  41.23 
 
 
328 aa  240  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  43.17 
 
 
329 aa  240  2.9999999999999997e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13030  tellurium resistance membrane protein TerC  38.65 
 
 
342 aa  238  9e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0291333  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0742  membrane protein  42.24 
 
 
328 aa  238  9e-62  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  41.37 
 
 
311 aa  238  1e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  43.23 
 
 
334 aa  238  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5646  Integral membrane protein TerC  41.74 
 
 
367 aa  237  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0287071  normal  0.141305 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  37.66 
 
 
321 aa  236  4e-61  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05912  hypothetical protein  40.44 
 
 
343 aa  235  6e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  39.94 
 
 
339 aa  235  7e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  40.85 
 
 
311 aa  235  9e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  37.22 
 
 
321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30000  tellurium resistance membrane protein TerC  41.74 
 
 
400 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  41.96 
 
 
322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  41.96 
 
 
322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  42.09 
 
 
325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  41.96 
 
 
322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  42.9 
 
 
328 aa  233  5e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  45 
 
 
328 aa  232  8.000000000000001e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  40.06 
 
 
325 aa  232  9e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1534  Integral membrane protein TerC  46.18 
 
 
328 aa  231  1e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  42.07 
 
 
318 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  41.67 
 
 
320 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11230  tellurium resistance membrane protein TerC  44.69 
 
 
419 aa  230  3e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.530504  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2005  Integral membrane protein TerC  42.95 
 
 
324 aa  229  5e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.466329 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  40.57 
 
 
344 aa  229  6e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5171  integral membrane protein TerC  40.49 
 
 
346 aa  229  7e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657774  normal  0.0510984 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2071  integral membrane protein TerC  43.32 
 
 
362 aa  228  8e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243682  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  41.1 
 
 
314 aa  228  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4785  integral membrane protein TerC  41.19 
 
 
346 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0724265  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4871  integral membrane protein TerC  41.19 
 
 
346 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.878645  normal  0.656899 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1862  Integral membrane protein TerC  41.19 
 
 
320 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201743  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  40.13 
 
 
306 aa  227  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  39.49 
 
 
313 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  39.46 
 
 
310 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000188  membrane protein TerC  40.75 
 
 
339 aa  226  6e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000121417  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1947  Integral membrane protein TerC  41.19 
 
 
320 aa  225  7e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204992  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  40 
 
 
344 aa  225  8e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  36.57 
 
 
308 aa  225  1e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1962  Integral membrane protein TerC  42.81 
 
 
369 aa  223  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121597  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1443  integral membrane protein TerC  40.33 
 
 
305 aa  223  4e-57  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.145143  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  40.3 
 
 
320 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  41.06 
 
 
359 aa  222  6e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  42.28 
 
 
313 aa  222  8e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  38.85 
 
 
352 aa  220  3e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  37.1 
 
 
312 aa  220  3e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  37.66 
 
 
311 aa  219  5e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  39.81 
 
 
307 aa  219  7e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  40.32 
 
 
312 aa  218  7.999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1628  integral membrane protein TerC  43.73 
 
 
334 aa  218  1e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0027  protein alx  40.12 
 
 
314 aa  218  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  45.08 
 
 
338 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  42.07 
 
 
321 aa  218  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  40.06 
 
 
325 aa  218  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12736  integral membrane protein  39.64 
 
 
397 aa  218  1e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.616365 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1094  protein alx  40.12 
 
 
314 aa  218  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.901246  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2053  integral membrane protein TerC  45.74 
 
 
373 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1811  Integral membrane protein TerC  42.11 
 
 
342 aa  217  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000488909 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  41.83 
 
 
322 aa  217  2.9999999999999998e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  38.98 
 
 
331 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  38.79 
 
 
322 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  38.79 
 
 
337 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>