224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_25830 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_25830  tellurium resistance membrane protein TerC  100 
 
 
336 aa  672    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.322541  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5513  Integral membrane protein TerC  62.92 
 
 
330 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.195308  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6050  integral membrane protein TerC  58.01 
 
 
330 aa  378  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.022574  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3760  Integral membrane protein TerC  55.49 
 
 
399 aa  376  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495579  normal  0.0658998 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1955  Integral membrane protein TerC  56.74 
 
 
352 aa  352  7e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3135  integral membrane protein TerC  55.28 
 
 
332 aa  343  2e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3363  integral membrane protein TerC  54.97 
 
 
332 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3019  Integral membrane protein TerC  51.6 
 
 
343 aa  342  5.999999999999999e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.863775  normal  0.353723 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06090  tellurium resistance membrane protein TerC  53.43 
 
 
333 aa  339  5e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186577  normal  0.851737 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1533  Integral membrane protein TerC  55.25 
 
 
333 aa  338  5.9999999999999996e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2183  Integral membrane protein TerC  53.78 
 
 
330 aa  338  7e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157717  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2005  Integral membrane protein TerC  56.88 
 
 
324 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.466329 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2025  putative transporter membrane protein  51.02 
 
 
337 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.348042  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1962  Integral membrane protein TerC  52.06 
 
 
369 aa  333  3e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121597  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3882  integral membrane protein TerC  51.67 
 
 
352 aa  330  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1961  Integral membrane protein TerC  54.43 
 
 
387 aa  324  1e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1772  Integral membrane protein TerC  51.37 
 
 
332 aa  323  3e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.682835  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2182  Integral membrane protein TerC  51.88 
 
 
328 aa  319  3e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1249  Integral membrane protein TerC  51.69 
 
 
330 aa  320  3e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0563072  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5646  Integral membrane protein TerC  50.15 
 
 
367 aa  314  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0287071  normal  0.141305 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1104  integral membrane protein TerC  53.05 
 
 
329 aa  311  1e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1534  Integral membrane protein TerC  51.86 
 
 
328 aa  310  2e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13030  tellurium resistance membrane protein TerC  48.28 
 
 
342 aa  310  2.9999999999999997e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0291333  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3228  integral membrane protein TerC  50.6 
 
 
399 aa  309  5e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3290  integral membrane protein TerC  50.6 
 
 
399 aa  309  5e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.459496 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3239  integral membrane protein TerC  50.6 
 
 
399 aa  309  5e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0367734  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1405  integral membrane protein TerC  49.14 
 
 
348 aa  306  3e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4785  integral membrane protein TerC  50.58 
 
 
346 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0724265  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4871  integral membrane protein TerC  50.58 
 
 
346 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.878645  normal  0.656899 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0919  integral membrane protein TerC  48.47 
 
 
398 aa  303  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5385  integral membrane protein TerC  48.12 
 
 
341 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00407258 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5171  integral membrane protein TerC  50.58 
 
 
346 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657774  normal  0.0510984 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2476  Integral membrane protein TerC  49.25 
 
 
334 aa  301  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368959  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5168  integral membrane protein TerC  49.23 
 
 
338 aa  300  2e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.35637  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30000  tellurium resistance membrane protein TerC  50.78 
 
 
400 aa  300  3e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0742  membrane protein  48.39 
 
 
328 aa  299  4e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1056  Integral membrane protein TerC  48.55 
 
 
360 aa  293  4e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2194  Integral membrane protein TerC  48.1 
 
 
350 aa  289  6e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2919  Integral membrane protein TerC  54.51 
 
 
337 aa  288  1e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1008  Integral membrane protein TerC  48.47 
 
 
399 aa  286  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.200826 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0650  Integral membrane protein TerC  44.51 
 
 
348 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1164  integral membrane protein TerC  49.4 
 
 
337 aa  280  3e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.76671  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2071  integral membrane protein TerC  46.89 
 
 
362 aa  280  4e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243682  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1811  Integral membrane protein TerC  48.14 
 
 
342 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000488909 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4836  Integral membrane protein TerC  48.62 
 
 
337 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  42.34 
 
 
328 aa  268  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  41.96 
 
 
329 aa  263  3e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0285  integral membrane protein TerC  45.91 
 
 
337 aa  260  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12736  integral membrane protein  45.13 
 
 
397 aa  259  3e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.616365 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  41.96 
 
 
331 aa  259  6e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22390  tellurium resistance membrane protein TerC  47.4 
 
 
474 aa  257  2e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.335048  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11230  tellurium resistance membrane protein TerC  47.33 
 
 
419 aa  254  1.0000000000000001e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.530504  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  48.34 
 
 
334 aa  251  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  41.42 
 
 
360 aa  249  7e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  41.46 
 
 
320 aa  246  4e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  39.46 
 
 
339 aa  243  3.9999999999999997e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  41.07 
 
 
325 aa  242  6e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  41.56 
 
 
321 aa  242  7.999999999999999e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0869  integral membrane protein TerC  45.78 
 
 
346 aa  239  4e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1762  integral membrane protein TerC  41.32 
 
 
319 aa  237  2e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.974772  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2267  integral membrane protein TerC  48.72 
 
 
346 aa  237  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26281  normal  0.0356305 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  41.09 
 
 
344 aa  237  3e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1829  export protein  41.32 
 
 
320 aa  236  5.0000000000000005e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.942389  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  40.95 
 
 
313 aa  236  5.0000000000000005e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  40.71 
 
 
311 aa  235  6e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  41.23 
 
 
308 aa  235  8e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1443  integral membrane protein TerC  42.49 
 
 
305 aa  234  1.0000000000000001e-60  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.145143  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  43.04 
 
 
314 aa  234  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  38.53 
 
 
359 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  38.15 
 
 
321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  38.92 
 
 
310 aa  233  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  39.23 
 
 
318 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  37.8 
 
 
321 aa  231  1e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  40.25 
 
 
320 aa  231  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  40.31 
 
 
312 aa  231  2e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  41.8 
 
 
344 aa  230  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  42.32 
 
 
313 aa  230  3e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  37.7 
 
 
306 aa  230  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  38.92 
 
 
311 aa  229  5e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  38.7 
 
 
338 aa  229  7e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  39.81 
 
 
322 aa  227  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  37.14 
 
 
308 aa  228  2e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  40.63 
 
 
312 aa  224  1e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000188  membrane protein TerC  40.61 
 
 
339 aa  224  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000121417  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  40.45 
 
 
322 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  40.45 
 
 
322 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  40.45 
 
 
322 aa  224  2e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2343  integral membrane protein TerC  38.3 
 
 
324 aa  223  2e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.912158  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2993  integral membrane protein TerC  38.39 
 
 
339 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  39.56 
 
 
325 aa  223  3e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  40.62 
 
 
325 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1557  integral membrane protein TerC  39.62 
 
 
328 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  37.38 
 
 
307 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05912  hypothetical protein  38.74 
 
 
343 aa  223  4.9999999999999996e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2123  integral membrane protein TerC  50 
 
 
346 aa  222  6e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.756712  normal  0.0151869 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2793  Integral membrane protein TerC  39.62 
 
 
328 aa  222  7e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  39.56 
 
 
320 aa  222  8e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3613  integral membrane protein TerC  41.37 
 
 
342 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1553  integral membrane protein TerC  39.62 
 
 
328 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.729834  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  38.41 
 
 
347 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0594051 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>