228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4836 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4836  Integral membrane protein TerC  100 
 
 
337 aa  660    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5168  integral membrane protein TerC  73.65 
 
 
338 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.35637  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2476  Integral membrane protein TerC  70.36 
 
 
334 aa  432  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368959  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1164  integral membrane protein TerC  75 
 
 
337 aa  424  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.76671  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2919  Integral membrane protein TerC  70.03 
 
 
337 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0650  Integral membrane protein TerC  57.02 
 
 
348 aa  357  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5513  Integral membrane protein TerC  55.94 
 
 
330 aa  333  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.195308  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2194  Integral membrane protein TerC  51.3 
 
 
350 aa  317  3e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1772  Integral membrane protein TerC  50.93 
 
 
332 aa  314  1.9999999999999998e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.682835  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30000  tellurium resistance membrane protein TerC  53.61 
 
 
400 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2183  Integral membrane protein TerC  53.21 
 
 
330 aa  313  2.9999999999999996e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157717  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3760  Integral membrane protein TerC  48.66 
 
 
399 aa  309  4e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495579  normal  0.0658998 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1961  Integral membrane protein TerC  54.43 
 
 
387 aa  306  3e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1533  Integral membrane protein TerC  49.27 
 
 
333 aa  305  6e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06090  tellurium resistance membrane protein TerC  50.15 
 
 
333 aa  303  4.0000000000000003e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186577  normal  0.851737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6050  integral membrane protein TerC  54.81 
 
 
330 aa  298  7e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.022574  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25830  tellurium resistance membrane protein TerC  50.33 
 
 
336 aa  298  1e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.322541  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3228  integral membrane protein TerC  48 
 
 
399 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3290  integral membrane protein TerC  48 
 
 
399 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.459496 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3239  integral membrane protein TerC  48 
 
 
399 aa  296  3e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0367734  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0919  integral membrane protein TerC  49.1 
 
 
398 aa  296  4e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1249  Integral membrane protein TerC  50 
 
 
330 aa  293  3e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0563072  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2025  putative transporter membrane protein  46.86 
 
 
337 aa  291  9e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.348042  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1008  Integral membrane protein TerC  49.85 
 
 
399 aa  290  2e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.200826 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2182  Integral membrane protein TerC  48.31 
 
 
328 aa  289  5.0000000000000004e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0285  integral membrane protein TerC  49.05 
 
 
337 aa  286  5e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1962  Integral membrane protein TerC  48.24 
 
 
369 aa  285  5.999999999999999e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121597  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3019  Integral membrane protein TerC  44.84 
 
 
343 aa  285  5.999999999999999e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.863775  normal  0.353723 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1955  Integral membrane protein TerC  47.78 
 
 
352 aa  281  1e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5646  Integral membrane protein TerC  45.67 
 
 
367 aa  281  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0287071  normal  0.141305 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13030  tellurium resistance membrane protein TerC  46.89 
 
 
342 aa  280  3e-74  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0291333  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4785  integral membrane protein TerC  49.07 
 
 
346 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0724265  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4871  integral membrane protein TerC  49.07 
 
 
346 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.878645  normal  0.656899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5171  integral membrane protein TerC  49.07 
 
 
346 aa  277  2e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657774  normal  0.0510984 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1104  integral membrane protein TerC  51.09 
 
 
329 aa  275  6e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3135  integral membrane protein TerC  46.91 
 
 
332 aa  275  8e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5385  integral membrane protein TerC  46.31 
 
 
341 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00407258 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11230  tellurium resistance membrane protein TerC  51.07 
 
 
419 aa  273  2.0000000000000002e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.530504  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1405  integral membrane protein TerC  45.93 
 
 
348 aa  272  6e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3363  integral membrane protein TerC  46.91 
 
 
332 aa  272  7e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2071  integral membrane protein TerC  46.45 
 
 
362 aa  271  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243682  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1056  Integral membrane protein TerC  45.24 
 
 
360 aa  271  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3882  integral membrane protein TerC  45.65 
 
 
352 aa  269  5e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2267  integral membrane protein TerC  50.47 
 
 
346 aa  267  2e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26281  normal  0.0356305 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1534  Integral membrane protein TerC  49.69 
 
 
328 aa  267  2e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0742  membrane protein  45.09 
 
 
328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12736  integral membrane protein  45.32 
 
 
397 aa  265  1e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.616365 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2005  Integral membrane protein TerC  49.05 
 
 
324 aa  261  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.466329 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  44.58 
 
 
322 aa  258  9e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  44.58 
 
 
322 aa  258  9e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  44.58 
 
 
322 aa  258  9e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1811  Integral membrane protein TerC  46.22 
 
 
342 aa  258  1e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000488909 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2123  integral membrane protein TerC  50.16 
 
 
346 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.756712  normal  0.0151869 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  43.55 
 
 
328 aa  252  5.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  44.44 
 
 
344 aa  252  8.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  43.37 
 
 
325 aa  251  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  41.18 
 
 
329 aa  248  8e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  43.47 
 
 
334 aa  246  4e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2946  integral membrane protein TerC  44.48 
 
 
322 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0216006  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  42.42 
 
 
335 aa  246  6e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  42.09 
 
 
334 aa  242  7e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0869  integral membrane protein TerC  46.65 
 
 
346 aa  239  4e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  41.03 
 
 
360 aa  239  5e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  43.57 
 
 
308 aa  239  6.999999999999999e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  41.52 
 
 
339 aa  238  8e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  40.19 
 
 
321 aa  238  1e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22390  tellurium resistance membrane protein TerC  47.71 
 
 
474 aa  236  4e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.335048  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  43.53 
 
 
313 aa  236  4e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  40.38 
 
 
331 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1628  integral membrane protein TerC  45.05 
 
 
334 aa  231  9e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  39.32 
 
 
321 aa  231  1e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3613  integral membrane protein TerC  43.18 
 
 
342 aa  228  8e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  42.53 
 
 
318 aa  228  8e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  40.54 
 
 
318 aa  227  2e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  42.63 
 
 
344 aa  226  3e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  40.91 
 
 
311 aa  227  3e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  39.88 
 
 
328 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  40.06 
 
 
320 aa  226  4e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2053  integral membrane protein TerC  46.02 
 
 
373 aa  226  5.0000000000000005e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  39.61 
 
 
308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  42.57 
 
 
314 aa  225  9e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  43.45 
 
 
328 aa  224  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  39.7 
 
 
328 aa  225  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  40.63 
 
 
314 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  39.58 
 
 
338 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  38.25 
 
 
359 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2993  integral membrane protein TerC  39.4 
 
 
339 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  40.38 
 
 
312 aa  220  3e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1862  Integral membrane protein TerC  40.28 
 
 
320 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201743  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  42.43 
 
 
312 aa  219  5e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1947  Integral membrane protein TerC  40.28 
 
 
320 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204992  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  40.85 
 
 
313 aa  219  6e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  39.93 
 
 
320 aa  219  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  36.88 
 
 
325 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1829  export protein  38.99 
 
 
320 aa  217  2e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.942389  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  43.54 
 
 
314 aa  216  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  40 
 
 
322 aa  216  4e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  43.14 
 
 
321 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  38.44 
 
 
320 aa  215  8e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  37.9 
 
 
310 aa  215  9e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>