222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2123 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2123  integral membrane protein TerC  100 
 
 		 346 aa  676    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.756712  normal  0.0151869 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2267  integral membrane protein TerC  90.46 
 
 		 346 aa  565  1e-160  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26281  normal  0.0356305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0285  integral membrane protein TerC  68.73 
 
 		 337 aa  443  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2025  putative transporter membrane protein  47.48 
 
 		 337 aa  294  1e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.348042  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2476  Integral membrane protein TerC  49.85 
 
 		 334 aa  289  6e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368959  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0650  Integral membrane protein TerC  53.35 
 
 		 348 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5168  integral membrane protein TerC  50.49 
 
 		 338 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.35637  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1772  Integral membrane protein TerC  45.99 
 
 		 332 aa  282  6.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.682835  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3019  Integral membrane protein TerC  45.25 
 
 		 343 aa  277  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.863775  normal  0.353723 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1961  Integral membrane protein TerC  47.99 
 
 		 387 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1249  Integral membrane protein TerC  46.3 
 
 		 330 aa  274  2.0000000000000002e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0563072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1104  integral membrane protein TerC  48.12 
 
 		 329 aa  273  3e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1955  Integral membrane protein TerC  47.28 
 
 		 352 aa  271  1e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1405  integral membrane protein TerC  46.65 
 
 		 348 aa  271  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3760  Integral membrane protein TerC  45.09 
 
 		 399 aa  271  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495579  normal  0.0658998 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2194  Integral membrane protein TerC  45.68 
 
 		 350 aa  270  2e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4836  Integral membrane protein TerC  49.4 
 
 		 337 aa  268  8.999999999999999e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5513  Integral membrane protein TerC  46.2 
 
 		 330 aa  268  8.999999999999999e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.195308  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1533  Integral membrane protein TerC  46.88 
 
 		 333 aa  268  1e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2919  Integral membrane protein TerC  53.38 
 
 		 337 aa  264  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5385  integral membrane protein TerC  45.1 
 
 		 341 aa  264  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00407258 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2183  Integral membrane protein TerC  47.09 
 
 		 330 aa  263  4.999999999999999e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06090  tellurium resistance membrane protein TerC  45.94 
 
 		 333 aa  262  6.999999999999999e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186577  normal  0.851737 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4785  integral membrane protein TerC  46.25 
 
 		 346 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0724265  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4871  integral membrane protein TerC  46.25 
 
 		 346 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.878645  normal  0.656899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5171  integral membrane protein TerC  46.25 
 
 		 346 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657774  normal  0.0510984 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3228  integral membrane protein TerC  44.88 
 
 		 399 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3290  integral membrane protein TerC  44.88 
 
 		 399 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.459496 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3239  integral membrane protein TerC  44.88 
 
 		 399 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0367734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25830  tellurium resistance membrane protein TerC  47.6 
 
 		 336 aa  258  8e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.322541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0919  integral membrane protein TerC  45.89 
 
 		 398 aa  257  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6050  integral membrane protein TerC  45.32 
 
 		 330 aa  256  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.022574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3882  integral membrane protein TerC  43.58 
 
 		 352 aa  256  4e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  46.25 
 
 		 344 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1164  integral membrane protein TerC  48.05 
 
 		 337 aa  253  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.76671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  44.88 
 
 		 360 aa  253  5.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2182  Integral membrane protein TerC  48.23 
 
 		 328 aa  252  6e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30000  tellurium resistance membrane protein TerC  43.41 
 
 		 400 aa  249  4e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1056  Integral membrane protein TerC  43.77 
 
 		 360 aa  249  6e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3363  integral membrane protein TerC  45.51 
 
 		 332 aa  248  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1008  Integral membrane protein TerC  44.03 
 
 		 399 aa  248  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.200826 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11230  tellurium resistance membrane protein TerC  47.99 
 
 		 419 aa  245  6e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.530504  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5646  Integral membrane protein TerC  43.96 
 
 		 367 aa  245  6.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0287071  normal  0.141305 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3135  integral membrane protein TerC  44.85 
 
 		 332 aa  245  9.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  44.3 
 
 		 344 aa  241  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1534  Integral membrane protein TerC  46.25 
 
 		 328 aa  238  8e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1962  Integral membrane protein TerC  44.41 
 
 		 369 aa  238  1e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121597  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13030  tellurium resistance membrane protein TerC  40.96 
 
 		 342 aa  236  5.0000000000000005e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0291333  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2005  Integral membrane protein TerC  45.98 
 
 		 324 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.466329 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  42.81 
 
 		 328 aa  233  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0742  membrane protein  40.62 
 
 		 328 aa  232  7.000000000000001e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  40.65 
 
 		 334 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  42.24 
 
 		 339 aa  231  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12736  integral membrane protein  43.08 
 
 		 397 aa  230  3e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.616365 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2071  integral membrane protein TerC  40.82 
 
 		 362 aa  229  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243682  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  40.37 
 
 		 318 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  41.38 
 
 		 314 aa  229  5e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1926  transporter  41.5 
 
 		 352 aa  229  7e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  42.41 
 
 		 346 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  40.98 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2543  integral membrane protein TerC  41.41 
 
 		 327 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2610  integral membrane protein TerC  41.41 
 
 		 327 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  41.88 
 
 		 325 aa  227  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  42.55 
 
 		 322 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  42.09 
 
 		 311 aa  226  3e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  42.55 
 
 		 322 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  42.55 
 
 		 322 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05912  hypothetical protein  40.83 
 
 		 343 aa  227  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  44.07 
 
 		 347 aa  226  4e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1747  hypothetical protein  41.36 
 
 		 325 aa  226  6e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  41.21 
 
 		 313 aa  225  7e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1557  integral membrane protein TerC  41.41 
 
 		 328 aa  225  8e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4279  hypothetical protein  41.36 
 
 		 325 aa  225  9e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  40.33 
 
 		 328 aa  225  9e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  43.21 
 
 		 328 aa  225  9e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2793  Integral membrane protein TerC  41.41 
 
 		 328 aa  225  9e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1553  integral membrane protein TerC  41.41 
 
 		 328 aa  225  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.729834  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2710  integral membrane protein TerC  41.36 
 
 		 325 aa  224  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  39.55 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  37.12 
 
 		 321 aa  224  2e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1586  integral membrane protein TerC  40.92 
 
 		 328 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2946  integral membrane protein TerC  41.61 
 
 		 322 aa  223  3e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0216006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  40.96 
 
 		 327 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22390  tellurium resistance membrane protein TerC  42.76 
 
 		 474 aa  221  9.999999999999999e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.335048  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  41.38 
 
 		 338 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1811  Integral membrane protein TerC  40.67 
 
 		 342 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000488909 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  44.33 
 
 		 313 aa  219  5e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  38.74 
 
 		 320 aa  218  1e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  40 
 
 		 359 aa  218  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1628  integral membrane protein TerC  46.32 
 
 		 334 aa  216  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  40.06 
 
 		 334 aa  216  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  40.92 
 
 		 329 aa  216  2.9999999999999998e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  37.71 
 
 		 311 aa  216  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1094  protein alx  38.7 
 
 		 314 aa  216  4e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.901246  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0027  protein alx  38.7 
 
 		 314 aa  216  4e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  42.21 
 
 		 308 aa  215  7e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3613  integral membrane protein TerC  40.33 
 
 		 342 aa  215  7e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  37.66 
 
 		 311 aa  215  9e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  40.13 
 
 		 327 aa  215  9e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1451  integral membrane protein TerC  39.88 
 
 		 328 aa  215  9e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>