239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2476 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2476  Integral membrane protein TerC  100 
 
 		 334 aa  655    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368959  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5168  integral membrane protein TerC  76.95 
 
 		 338 aa  489  1e-137  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.35637  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2919  Integral membrane protein TerC  79.94 
 
 		 337 aa  463  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1164  integral membrane protein TerC  77.25 
 
 		 337 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.76671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4836  Integral membrane protein TerC  70.36 
 
 		 337 aa  418  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0650  Integral membrane protein TerC  58.51 
 
 		 348 aa  365  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5513  Integral membrane protein TerC  54.69 
 
 		 330 aa  333  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.195308  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2194  Integral membrane protein TerC  51.01 
 
 		 350 aa  328  9e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1533  Integral membrane protein TerC  51.05 
 
 		 333 aa  322  6e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06090  tellurium resistance membrane protein TerC  50.45 
 
 		 333 aa  318  6e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.186577  normal  0.851737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6050  integral membrane protein TerC  54.43 
 
 		 330 aa  317  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.022574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3760  Integral membrane protein TerC  50.59 
 
 		 399 aa  316  3e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.495579  normal  0.0658998 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2183  Integral membrane protein TerC  50.61 
 
 		 330 aa  316  4e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25830  tellurium resistance membrane protein TerC  49.25 
 
 		 336 aa  313  1.9999999999999998e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.322541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1249  Integral membrane protein TerC  48.17 
 
 		 330 aa  310  2.9999999999999997e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0563072  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3019  Integral membrane protein TerC  48.49 
 
 		 343 aa  305  5.0000000000000004e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.863775  normal  0.353723 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1772  Integral membrane protein TerC  49.39 
 
 		 332 aa  302  5.000000000000001e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.682835  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1961  Integral membrane protein TerC  50.15 
 
 		 387 aa  301  8.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172544  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1962  Integral membrane protein TerC  51.08 
 
 		 369 aa  300  3e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.121597  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5171  integral membrane protein TerC  49.85 
 
 		 346 aa  300  3e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657774  normal  0.0510984 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4785  integral membrane protein TerC  49.85 
 
 		 346 aa  299  4e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0724265  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4871  integral membrane protein TerC  49.85 
 
 		 346 aa  299  4e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.878645  normal  0.656899 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30000  tellurium resistance membrane protein TerC  51.1 
 
 		 400 aa  298  1e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3135  integral membrane protein TerC  50.93 
 
 		 332 aa  297  1e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2025  putative transporter membrane protein  47.15 
 
 		 337 aa  295  6e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.348042  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1056  Integral membrane protein TerC  47.31 
 
 		 360 aa  295  1e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3363  integral membrane protein TerC  50.31 
 
 		 332 aa  294  2e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1955  Integral membrane protein TerC  44.73 
 
 		 352 aa  292  5e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1104  integral membrane protein TerC  51.07 
 
 		 329 aa  292  6e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403609  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2182  Integral membrane protein TerC  47.19 
 
 		 328 aa  286  4e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.408718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3228  integral membrane protein TerC  47.34 
 
 		 399 aa  286  5e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3290  integral membrane protein TerC  47.34 
 
 		 399 aa  286  5e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.459496 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3239  integral membrane protein TerC  47.34 
 
 		 399 aa  286  5e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0367734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0285  integral membrane protein TerC  46.84 
 
 		 337 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3882  integral membrane protein TerC  45.22 
 
 		 352 aa  282  7.000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5385  integral membrane protein TerC  45.88 
 
 		 341 aa  282  7.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00407258 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1405  integral membrane protein TerC  46.85 
 
 		 348 aa  278  7e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.823461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1534  Integral membrane protein TerC  50.16 
 
 		 328 aa  277  2e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0919  integral membrane protein TerC  46.85 
 
 		 398 aa  277  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2071  integral membrane protein TerC  46.95 
 
 		 362 aa  275  5e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.243682  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1008  Integral membrane protein TerC  46.55 
 
 		 399 aa  275  7e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.200826 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  48.71 
 
 		 344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13030  tellurium resistance membrane protein TerC  43.99 
 
 		 342 aa  273  2.0000000000000002e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0291333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11230  tellurium resistance membrane protein TerC  50.67 
 
 		 419 aa  271  1e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.530504  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2005  Integral membrane protein TerC  48.61 
 
 		 324 aa  271  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.466329 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  44.76 
 
 		 360 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2267  integral membrane protein TerC  50.91 
 
 		 346 aa  269  4e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.26281  normal  0.0356305 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  46.01 
 
 		 322 aa  269  4e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  46.01 
 
 		 322 aa  269  4e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  46.01 
 
 		 322 aa  269  4e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5646  Integral membrane protein TerC  46.13 
 
 		 367 aa  268  8.999999999999999e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0287071  normal  0.141305 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1811  Integral membrane protein TerC  46.67 
 
 		 342 aa  266  4e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000488909 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  43.89 
 
 		 339 aa  265  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  43.75 
 
 		 325 aa  261  8.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  46.63 
 
 		 334 aa  261  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  44.05 
 
 		 328 aa  260  3e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0742  membrane protein  45.28 
 
 		 328 aa  258  7e-68  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3613  integral membrane protein TerC  44.14 
 
 		 342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  42.69 
 
 		 335 aa  252  7e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  45.48 
 
 		 344 aa  251  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  42.99 
 
 		 334 aa  250  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2123  integral membrane protein TerC  50.65 
 
 		 346 aa  248  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.756712  normal  0.0151869 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2946  integral membrane protein TerC  43.75 
 
 		 322 aa  247  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0216006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  44.77 
 
 		 331 aa  247  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  42.3 
 
 		 321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  41.85 
 
 		 320 aa  243  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  42.62 
 
 		 321 aa  243  3.9999999999999997e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  45 
 
 		 308 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  44.27 
 
 		 313 aa  239  4e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  45.08 
 
 		 329 aa  239  5.999999999999999e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12736  integral membrane protein  43.15 
 
 		 397 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.616365 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  41.83 
 
 		 308 aa  238  8e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  43.53 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1628  integral membrane protein TerC  42.99 
 
 		 334 aa  236  3e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  39.14 
 
 		 328 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  40.26 
 
 		 306 aa  232  5e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  43.49 
 
 		 314 aa  232  8.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22390  tellurium resistance membrane protein TerC  45.95 
 
 		 474 aa  232  8.000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.335048  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1762  integral membrane protein TerC  42.02 
 
 		 319 aa  231  1e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.974772  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  41.27 
 
 		 330 aa  231  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  39.1 
 
 		 307 aa  229  4e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  38.84 
 
 		 328 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2993  integral membrane protein TerC  40.26 
 
 		 339 aa  229  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1829  export protein  41.16 
 
 		 320 aa  229  6e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.942389  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1747  hypothetical protein  39.74 
 
 		 325 aa  228  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  41.33 
 
 		 318 aa  228  1e-58  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1557  integral membrane protein TerC  40.32 
 
 		 328 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2793  Integral membrane protein TerC  40.32 
 
 		 328 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.611411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  41.08 
 
 		 320 aa  227  2e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1553  integral membrane protein TerC  40.32 
 
 		 328 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.729834  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4279  hypothetical protein  39.74 
 
 		 325 aa  227  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2543  integral membrane protein TerC  39.74 
 
 		 327 aa  226  3e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2610  integral membrane protein TerC  39.74 
 
 		 327 aa  226  3e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2710  integral membrane protein TerC  39.74 
 
 		 325 aa  227  3e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1586  integral membrane protein TerC  40.32 
 
 		 328 aa  225  6e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03496  export protein  44.12 
 
 		 318 aa  226  6e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0869  integral membrane protein TerC  44.28 
 
 		 346 aa  226  6e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  43.07 
 
 		 328 aa  225  6e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  42.35 
 
 		 314 aa  225  9e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  37.42 
 
 		 311 aa  225  1e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>