247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_0016 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_0016  integral membrane protein TerC  100 
 
 
328 aa  652    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1705  integral membrane protein TerC  62.81 
 
 
320 aa  403  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2919  Integral membrane protein TerC  62.03 
 
 
331 aa  396  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000105664  normal  0.323377 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1438  integral membrane protein TerC  64.55 
 
 
329 aa  384  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3632  Integral membrane protein TerC  59.55 
 
 
321 aa  373  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.443887  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0923  integral membrane protein TerC  57.43 
 
 
322 aa  351  8e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0184  TerC family membrane protein  53.44 
 
 
321 aa  347  2e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.36035  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0811  Integral membrane protein TerC  58.92 
 
 
313 aa  344  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0168  integral membrane protein TerC  52.46 
 
 
321 aa  341  8e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000120388  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0855  TerC family membrane protein  53.95 
 
 
311 aa  341  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0835081  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_173  membrane protein, TerC family  53.69 
 
 
308 aa  339  2.9999999999999998e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225812  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1570  TerC family membrane protein  58.56 
 
 
314 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1144  integral membrane protein TerC  53.29 
 
 
310 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000129998  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1155  integral membrane protein TerC  53.09 
 
 
311 aa  330  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000825766  normal  0.0331018 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3568  integral membrane protein TerC  55.3 
 
 
312 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00256618  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1472  integral membrane protein TerC  55.37 
 
 
318 aa  325  6e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0736705  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2511  integral membrane protein TerC  51.22 
 
 
335 aa  325  7e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168713  normal  0.0111876 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0543  Integral membrane protein TerC  58.62 
 
 
328 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0514  integral membrane protein TerC  57.58 
 
 
328 aa  324  2e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.139671  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0968  Integral membrane protein TerC  53.2 
 
 
306 aa  323  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1153  integral membrane protein TerC  51.07 
 
 
334 aa  323  3e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0550  Integral membrane protein TerC  52.46 
 
 
312 aa  322  7e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0040107  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2303  integral membrane protein TerC  55.15 
 
 
314 aa  320  1.9999999999999998e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1367  TerC family integral membrane protein  52.01 
 
 
311 aa  319  5e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.536325  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2416  Integral membrane protein TerC  55.92 
 
 
313 aa  318  1e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0291  integral membrane protein TerC  52.84 
 
 
308 aa  317  1e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3281  Integral membrane protein TerC  52.53 
 
 
307 aa  318  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3259  integral membrane protein TerC  54.22 
 
 
325 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2384  integral membrane protein TerC  53.62 
 
 
359 aa  314  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0331794  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1793  integral membrane protein TerC  53.38 
 
 
318 aa  313  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  55.1 
 
 
312 aa  312  5.999999999999999e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0547  Integral membrane protein TerC  60.61 
 
 
328 aa  311  7.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.386888  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0781  integral membrane protein TerC  52.86 
 
 
314 aa  311  1e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00541452  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1240  Integral membrane protein TerC  50.62 
 
 
338 aa  310  2e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0237698 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3507  Integral membrane protein TerC  52.09 
 
 
317 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0331  integral membrane protein TerC  49.85 
 
 
325 aa  308  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1897  Integral membrane protein TerC  47.76 
 
 
339 aa  308  1.0000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567869  normal  0.451222 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4156  integral membrane protein TerC  53.75 
 
 
323 aa  306  2.0000000000000002e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3448  Integral membrane protein TerC  50.16 
 
 
360 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000597859  hitchhiker  0.00065247 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2946  integral membrane protein TerC  51.31 
 
 
322 aa  306  2.0000000000000002e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0216006  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5098  integral membrane protein TerC  49.38 
 
 
322 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.137745  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5186  integral membrane protein TerC  49.38 
 
 
322 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0800835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5477  integral membrane protein TerC  49.38 
 
 
322 aa  306  3e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.409981  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2440  integral membrane protein TerC  51.15 
 
 
327 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127814  normal  0.55186 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3524  protein Alx  55.03 
 
 
321 aa  305  8.000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3305  TerC family membrane protein  50.49 
 
 
327 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2667  integral membrane protein TerC  53.57 
 
 
318 aa  305  9.000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2602  hypothetical protein  52.06 
 
 
325 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.127831  normal  0.661335 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3415  inner membrane protein alx  51.76 
 
 
322 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02957  predicted inner membrane protein, part of terminus  54.7 
 
 
321 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0613  Integral membrane protein TerC  54.7 
 
 
321 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3380  protein Alx  54.7 
 
 
321 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568911  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3581  inner membrane protein alx  51.76 
 
 
322 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.081228 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4403  protein Alx  54.7 
 
 
321 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.49414  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0612  integral membrane protein TerC  54.7 
 
 
321 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02907  hypothetical protein  54.7 
 
 
320 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3519  hypothetical protein  51.76 
 
 
322 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  hitchhiker  0.000693905 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1443  integral membrane protein TerC  50 
 
 
305 aa  303  4.0000000000000003e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.145143  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3412  inner membrane protein alx  51.76 
 
 
337 aa  302  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3555  protein Alx  54.36 
 
 
321 aa  301  7.000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3270  protein Alx  54.36 
 
 
321 aa  301  9e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3485  inner membrane protein alx  51.44 
 
 
322 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2138  hypothetical protein  51.3 
 
 
317 aa  300  2e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10498  membrane protein, TerC family protein  48.53 
 
 
322 aa  300  2e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0747324  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0534  Integral membrane protein TerC  49.68 
 
 
317 aa  299  3e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0751  Integral membrane protein TerC  50.97 
 
 
317 aa  300  3e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2606  integral membrane protein TerC  51.72 
 
 
327 aa  299  4e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.271005 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0083  Integral membrane protein TerC  50.78 
 
 
344 aa  298  1e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0265  Integral membrane protein TerC  51.77 
 
 
320 aa  296  3e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2053  integral membrane protein TerC  53.18 
 
 
373 aa  295  5e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.2838  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0390  integral membrane protein TerC  49.03 
 
 
354 aa  295  6e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0875594  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1576  Integral membrane protein TerC  51.29 
 
 
325 aa  295  7e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3347  integral membrane protein TerC  47.44 
 
 
330 aa  294  1e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2086  integral membrane protein TerC  46.53 
 
 
354 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3257  integral membrane protein TerC  47.16 
 
 
354 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2438  hypothetical protein  47.16 
 
 
354 aa  293  3e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2113  hypothetical protein  51.3 
 
 
317 aa  292  5e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1628  integral membrane protein TerC  49.37 
 
 
334 aa  292  7e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3613  integral membrane protein TerC  49.21 
 
 
342 aa  291  1e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2034  Integral membrane protein TerC  50.91 
 
 
334 aa  290  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1946  Integral membrane protein TerC  48.69 
 
 
337 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.683729  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4318  integral membrane protein TerC  50.31 
 
 
325 aa  288  8e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3543  integral membrane protein TerC  53.36 
 
 
322 aa  287  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.45062 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1025  Integral membrane protein TerC  47.23 
 
 
327 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.237996  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5015  Integral membrane protein TerC  47.32 
 
 
344 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31610  TerC family protein  48.22 
 
 
347 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0594051 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0510  hypothetical protein  49.01 
 
 
316 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1762  integral membrane protein TerC  48.23 
 
 
319 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.974772  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3062  integral membrane protein TerC  46.13 
 
 
354 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0416562  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2543  integral membrane protein TerC  47.27 
 
 
327 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2610  integral membrane protein TerC  47.27 
 
 
327 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0942  integral membrane protein TerC  46.75 
 
 
328 aa  282  5.000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2710  integral membrane protein TerC  47.27 
 
 
325 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2343  integral membrane protein TerC  47.66 
 
 
324 aa  282  5.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.912158  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2688  hypothetical protein  48.68 
 
 
346 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.409159  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1747  hypothetical protein  46.95 
 
 
325 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1586  integral membrane protein TerC  46.65 
 
 
328 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1829  export protein  48.51 
 
 
320 aa  281  1e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.942389  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4036  Integral membrane protein TerC  47.76 
 
 
320 aa  281  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.640744 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03496  export protein  49.36 
 
 
318 aa  281  1e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>